| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5159824 | 49 (0.560) | 9 (0.140) | 7/186 | NT | 17.4% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5159839 | 49 (0.740) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATC > NC_002947/5159675‑5159971 | gACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA > 2:218207‑M1/1‑150 (MQ=255) aaGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAg > 2:2222391/1‑150 (MQ=255) ggCGAATTGTCGAGGGTGGCAGCCACAGTGAGTTTCTGGATCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGCGGGTTTGTCGCGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCCGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTc < 2:685484/150‑1 (MQ=255) gCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCg > 1:1251466/1‑150 (MQ=255) gAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCt > 2:1936093/1‑150 (MQ=255) aaTTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTa > 2:1979359/1‑150 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgt > 2:1363154‑M2/1‑147 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtag > 2:1761585‑M2/1‑145 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtag > 2:1251466‑M2/1‑145 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgg > 1:218207‑M2/1‑139 (MQ=255) aGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcggg < 1:1429918‑M1/150‑28 (MQ=255) gCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggt > 1:2312062‑M2/1‑137 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtt < 2:1002749‑M2/150‑15 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtt > 1:1979359‑M2/1‑136 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggt < 1:1362541‑M2/147‑14 (MQ=255) aGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTAGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacc > 1:281514‑M2/1‑132 (MQ=255) tGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccg > 1:1061993‑M2/1‑130 (MQ=255) tGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGACTGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccg < 1:1815350‑M2/150‑21 (MQ=255) gAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCATACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgc > 2:870434‑M2/1‑129 (MQ=255) gTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcga < 2:1585188‑M2/150‑24 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagc < 2:475500‑M1/133‑25 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagc > 1:475500‑M1/1‑109 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaa > 1:1002749‑M2/1‑124 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaa > 1:1972936‑M2/1‑124 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaa > 1:1585188‑M2/1‑124 (MQ=255) cTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaag > 1:1475295‑M2/1‑123 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTc < 2:2290445/114‑1 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTc > 1:2290445/1‑114 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgt < 1:2299132‑M2/125‑4 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCCAAGCCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcc > 1:614267‑M2/1‑120 (MQ=255) caAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGcacc > 1:1838681/1‑149 (MQ=255) ggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGAATAACCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCa > 1:1646245/1‑150 (MQ=255) tATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg < 2:855794‑M1/116‑27 (MQ=255) tATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgg > 1:855794‑M1/1‑90 (MQ=255) tATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACCGGCAAcaca > 1:1832531/1‑150 (MQ=255) cccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtc < 1:1307249/150‑1 (MQ=255) gTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTAt < 1:931206/94‑1 (MQ=255) gTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctctc < 2:373427/150‑1 (MQ=255) ggCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTcc < 1:1429317/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTccc > 1:38121/1‑150 (MQ=255) accaccAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg < 1:54707/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCa > 1:2275937/1‑150 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATc > 2:1466585/1‑150 (MQ=255) ttttGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggt > 2:1296666‑M1/1‑58 (MQ=255) ttGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTATGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATcccc > 2:1780211/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACACGGTCGCTATCG‑TTGTATGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgc < 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gcgGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtatggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactc > 2:870434‑M1/1‑21 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCa < 2:1370807/90‑1 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactca > 1:1061993‑M1/1‑20 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcac > 1:718540‑M1/1‑19 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACACCTTGACCCCTTCCCGtt > 2:2122640/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTAGCTGTCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt > 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aaCCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtgg > 1:1979359‑M1/1‑14 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtgg < 2:1002749‑M1/150‑137 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgt > 2:1362541‑M1/1‑13 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgt < 1:1362541‑M1/147‑135 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggc < 1:215656‑M2/150‑123 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaa < 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ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcata > 1:855794‑M2/1‑26 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATGTCTCAGTCCCGGCGGTAggg > 1:1965981/1‑95 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAggg < 2:1965981/95‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATc > 1:591358/1‑102 (MQ=255) ccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATc < 2:591358/102‑1 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagc > 1:475500‑M2/1‑24 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagc < 2:475500‑M2/133‑110 (MQ=255) cTACAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactc > 2:1761585‑M1/1‑5 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGTGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa < 1:1466585/150‑1 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa > 2:338409/1‑150 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTACCTTCAACAGaaaa > 1:79018/1‑150 (MQ=255) aCAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctc > 2:1363154‑M1/1‑3 (MQ=255) aCAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctcca < 1:2299132‑M1/125‑123 (MQ=255) aCAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctcca > 2:2299132‑M1/1‑3 (MQ=255) cAacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcg > 1:1936093‑M1/1‑2 (MQ=255) aacgatagcgaacctgtgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggctgccactctcga > 1:2222391‑M1/1‑1 (MQ=255) | GACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATC > NC_002947/5159675‑5159971 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |