New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5159824 | 49 (0.560) | 9 (0.140) | 7/186 | NT | 17.4% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 5159839 | 49 (0.740) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCA > NC_002947/5159691‑5159988 | tCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Tt > 1:2222391‑M2/1‑149 (MQ=255) cGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttg > 1:1936093‑M2/1‑148 (MQ=255) gagaGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgt > 2:1363154‑M2/1‑147 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtag > 2:1251466‑M2/1‑145 (MQ=255) gagTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtag > 2:1761585‑M2/1‑145 (MQ=255) tGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGCGCAGCAAGGGCTGTATGCACGGTTGTGGCAACCACAGGATGCAGGTTCAGAAGGGGTTGATTAATACCTGCGATGACCTTTCGCGGGTCAACCTGTTCCTACACAGGTTCGATATCA‑TTGTACGac > 2:390880/1‑149 (MQ=255) cAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgg > 1:218207‑M2/1‑139 (MQ=255) gCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggt > 1:2312062‑M2/1‑137 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtt < 2:1002749‑M2/150‑15 (MQ=255) ccACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtt > 1:1979359‑M2/1‑136 (MQ=255) cacaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCGTTTCGCGGGGAGACGCGCTCGTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggttt < 2:1429317‑M2/150‑16 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggt > 2:1362541‑M2/1‑134 (MQ=255) acaGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggt < 1:1362541‑M2/147‑14 (MQ=255) aGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTAGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacc > 1:281514‑M2/1‑132 (MQ=255) gTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttaccc > 1:718540‑M2/1‑131 (MQ=255) tGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccg > 1:1061993‑M2/1‑130 (MQ=255) tGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGACTGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccg < 1:1815350‑M2/150‑21 (MQ=255) gAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCATACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgc > 2:870434‑M2/1‑129 (MQ=255) gTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcga < 2:1585188‑M2/150‑24 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaa > 1:1585188‑M2/1‑124 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaa > 1:1972936‑M2/1‑124 (MQ=255) gCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaa > 1:1002749‑M2/1‑124 (MQ=255) cTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaag > 1:1475295‑M2/1‑123 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgt < 1:2299132‑M2/125‑4 (MQ=255) tGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgt > 2:2299132‑M2/1‑122 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtagaagcgggtgtacccgcgaaaaggcc < 2:54707‑M2/150‑31 (MQ=255) gAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCCAAGCCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggcc > 1:614267‑M2/1‑120 (MQ=255) caAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGcacc > 1:1838681/1‑149 (MQ=255) ggCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGAATAACCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCa > 1:1646245/1‑150 (MQ=255) tATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACCGGCAAcaca > 1:1832531/1‑150 (MQ=255) cccGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtc < 1:1307249/150‑1 (MQ=255) gTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctctc < 2:373427/150‑1 (MQ=255) ggCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTcc < 1:1429317/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTccc < 1:1565895/150‑1 (MQ=255) gCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTccc > 1:38121/1‑150 (MQ=255) accaccAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCcgg < 1:54707/150‑1 (MQ=255) cGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCa > 1:2275937/1‑150 (MQ=255) gTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATc > 2:1466585/1‑150 (MQ=255) ttGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTATGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATcccc > 2:1780211/1‑150 (MQ=255) tGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATccccc < 1:390880/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACACGGTCGCTATCG‑TTGTATGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCcgc < 1:1780211/150‑1 (MQ=255) ggggTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGACAACGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCgcgc > 2:1481813/1‑150 (MQ=255) gggTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTAACG‑TTGTAGGACACACGTCTGACCTC‑AAGAGGCCTGCACAGGCAACCCAGAACTCCCCGCCCCGGCCCGAGGGCAACATCCCCCGCGcc > 1:988257/1‑150 (MQ=255) ggTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGTAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCct > 2:1816460/1‑150 (MQ=255) ctcgatcgaCACCTGCGCGGCCTTTTCGCTGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCctc > 2:273046/2‑150 (MQ=255) ggACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑CCTAATCGCAAAAGATTGGTGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGc < 2:1815350/149‑1 (MQ=25) acacCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCAGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGCCAACATCCCCCGCGCCTGTTCGGCAt > 2:879898/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAccc > 1:1429231/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATAcccc > 1:855684/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTc < 2:855684/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTAAACCCGCTCCTACTCATTTTCTCTTTCG‑GTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCTGCATACCCCTTTACCCCTTccc < 2:1646245/150‑1 (MQ=38) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCa > 1:1370807/1‑90 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCa < 2:1370807/90‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACACCTTGACCCCTTCCCGtt > 2:2122640/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGGTTAGCTGTCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGtt > 1:1481100/1‑150 (MQ=255) ggTAACCCCGCTCCTACACAGATGGGCTATCG‑GTATACGA‑CCCGGCTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGCAGGTCGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCCGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTc < 1:879898/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTcc > 2:334350/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGc > 1:893069/1‑123 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGc < 2:893069/123‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggc < 1:215656‑M2/150‑123 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaa < 1:1296666‑M2/86‑59 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaa > 2:1296666‑M2/1‑28 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagcaactcactgtggct < 1:1429918‑M2/150‑124 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct > 1:516738/1‑79 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGAtctct < 2:516738/79‑1 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcag > 1:562721/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTgcag > 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2:591358/102‑1 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagc > 1:475500‑M2/1‑24 (MQ=255) gCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑Ttgtaggagcgggtttacccgcgaaaaggccgcgcaggtgtcaatcgaccccgacaaaacctccggtctggtggtgccacaaccgggcatacagcccttgctgctccagc < 2:475500‑M2/133‑110 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGTGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa < 1:1466585/150‑1 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGaaaa > 2:338409/1‑150 (MQ=255) cTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTACCTTCAACAGaaaa > 1:79018/1‑150 (MQ=255) aGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTc > 2:2048287/1‑131 (MQ=255) aGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTc < 1:2048287/131‑1 (MQ=255) gTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAAtcctc < 2:1287883/147‑1 (MQ=255) gTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGATCACGCAGCAGAAAAtcctc > 1:1287883/1‑147 (MQ=255) ttCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAcc > 2:1323150/1‑150 (MQ=255) gCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcc > 2:1040014/1‑150 (MQ=255) tATCG‑ATGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCAccgcccg > 2:89791/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCa > 2:419818/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCa > 1:348609/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACAACGACGTCGGGAGCGGGCCGAAAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCa > 2:1374832/1‑150 (MQ=25) | TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGTTCGCTATCG‑TTGTAGGA‑GCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGGCACAGGCAACACAGATCTCTCAGTCCCGGCGGTAGGGCAACATCCCCCGCGCCTCTTCGGCATACCCCTTGACCCCTTCCCGTTCCTGCAGCAGAAAATCCTCCACCGCCCGCCGCA > NC_002947/5159691‑5159988 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |