New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5552384 | 106 (1.200) | 7 (0.080) | 7/234 | NT | 6.8% | coding (1565/1566 nt) | PP_4882 | iron ABC transporter permease |
? | NC_002947 | = 5552417 | 91 (1.090) | intergenic (+32/+629) | PP_4882/PP_5717 | iron ABC transporter permease/hypothetical protein |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GACCGGCATGACCACCCTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAAGAGGGTAACAAAAC > NC_002947/5552235‑5552532 | cGGCATGACCACCCTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGaaa > 2:1838736/1‑150 (MQ=255) gACCACCCTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGc < 1:509066/150‑1 (MQ=255) caccCTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCa > 2:244339/1‑150 (MQ=255) caccCTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCa > 2:2244765/1‑150 (MQ=255) caccCTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGAATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCa > 2:1145434/1‑150 (MQ=255) cccTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGAACGCAAGAGTGCTTTGC‑GAGAATGCGTGTGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAgg > 1:1686543/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGgccg > 2:820033/1‑150 (MQ=255) gCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTAGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGgccgcc < 2:64284/150‑1 (MQ=255) ccGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCAtgt < 1:1665475/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCAtgtg > 1:340982/1‑150 (MQ=255) tgtgGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTg > 1:1006596/1‑150 (MQ=255) tgtgGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGAATACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTg < 2:1690935/150‑1 (MQ=255) tgGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGc > 1:536283/1‑128 (MQ=255) tgGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTggg < 2:838193/150‑1 (MQ=255) tgGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTggg < 2:1006596/150‑1 (MQ=255) tgGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTggg > 1:846158/1‑150 (MQ=255) gCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Ac > 1:2244075‑M2/1‑149 (MQ=255) acacacaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTg > 1:163274/1‑143 (MQ=255) acacacaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTg < 2:163274/143‑1 (MQ=255) acacacaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Acaa < 1:835735‑M2/150‑4 (MQ=255) acacacaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Acaa < 1:1973046‑M2/150‑4 (MQ=255) acacacaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCACCATGTGGCCTGGGC‑Acaa < 1:336667‑M2/150‑4 (MQ=255) acacaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAgg > 2:1261273/1‑126 (MQ=255) acaGCTAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGcc > 1:2031458/1‑120 (MQ=255) acaGCTAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGcc < 2:2031458/120‑1 (MQ=255) acaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Acaagcct < 2:914825‑M2/150‑8 (MQ=255) acaGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Acaagcct > 1:1515611‑M2/1‑143 (MQ=255) gCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTCTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagccttgt < 1:2261120‑M1/150‑44 (MQ=255) ccAACGTCGAGTGCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGTGGTGGCCGGTGT‑CTTTGCTGCCTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGt < 2:315841/150‑1 (MQ=255) gTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAATGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTa > 1:945884/1‑150 (MQ=255) gTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGc‑aa > 2:1972425/1‑134 (MQ=255) gTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTa < 2:1363133/150‑1 (MQ=255) gTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATGTGCTGACTACGGGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGCGCCTa > 1:2209038/1‑150 (MQ=255) tCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGc > 2:882319/1‑105 (MQ=255) tCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGc < 1:882319/105‑1 (MQ=255) gAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCAAGGCCACCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGAc < 2:336667/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGc > 1:875540/1‑104 (MQ=255) ttCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGc < 2:875540/104‑1 (MQ=255) tCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGaaagctcgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaa < 1:204119‑M1/136‑43 (MQ=255) cggcggcgCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACaa < 1:1641779/150‑1 (MQ=255) cggcggcgCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACaa < 1:378697/150‑1 (MQ=255) gcgcCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagccttg > 2:261854‑M1/1‑83 (MQ=255) gcgcCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagccttg < 1:261854‑M1/125‑43 (MQ=255) cgcCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCAc < 2:2212830/150‑1 (MQ=255) gcCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACt < 1:1839513/150‑1 (MQ=255) gTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACt < 2:2324204/147‑1 (MQ=255) gTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACt > 1:2324204/1‑147 (MQ=255) tATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTaa < 1:820033/150‑1 (MQ=255) gcggcgTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAAc > 1:2127836/1‑150 (MQ=255) gcgTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAActct < 2:1642711/150‑1 (MQ=255) gcgTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAActcc < 2:1973046/150‑2 (MQ=255) cgTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACtctc < 1:183840/150‑1 (MQ=255) ttgttgATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCAc < 1:1020556/150‑1 (MQ=255) gttgATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTa < 1:914825/150‑1 (MQ=255) gttgATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTa > 1:184292/1‑150 (MQ=255) gttgATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTa < 2:184292/150‑1 (MQ=255) tgATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCAtgt < 2:1391371/87‑1 (MQ=255) tgATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCAtgt > 1:1391371/1‑87 (MQ=255) tgATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGc < 1:1145434/150‑1 (MQ=255) aTTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCa < 1:244339/150‑1 (MQ=255) gtggtgTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGtt < 2:835735/150‑1 (MQ=255) ggtgTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACt < 1:2150308/126‑1 (MQ=255) ggtgTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACt > 2:2150308/1‑126 (MQ=255) gtgtCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGa > 2:431843/1‑98 (MQ=255) tgtCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGaaa < 2:1340053/150‑1 (MQ=255) tgtCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACCTTAAACCTCTCACTAGCCAGTTGaaa < 2:1529893/150‑1 (MQ=255) tgtCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCAGGTCGCCTGCGC‑TCAAGCCTCAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGaaa < 2:1529841/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTc < 2:887157/119‑1 (MQ=255) tCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTc > 1:887157/1‑119 (MQ=255) gcGGGGTTTCCGGTGG‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGc < 2:2005436/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAg < 1:279531/150‑1 (MQ=255) ccGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGc < 2:890757/130‑1 (MQ=255) ccGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGc > 1:890757/1‑130 (MQ=255) cGGTGT‑ATGTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGACAGCAAAGCACAAg < 2:623721/150‑1 (MQ=255) ggTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCtt > 1:1305047/1‑49 (MQ=255) gtgt‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagcctt < 2:1965819‑M1/82‑42 (MQ=255) gtgt‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagcctt > 1:1965819‑M1/1‑41 (MQ=255) aCTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGa < 2:250077/122‑1 (MQ=255) aCTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGa > 1:250077/1‑122 (MQ=255) cTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTc < 1:386193/138‑1 (MQ=255) cTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTc > 2:386193/1‑138 (MQ=255) ggATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAg < 1:2256130/123‑1 (MQ=255) tGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCcccacc < 2:1945044/150‑1 (MQ=255) gTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATNTGGCNTGGNC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCcccaccc > 1:1945044/1‑150 (MQ=255) tttGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAag > 1:568545/1‑150 (MQ=255) gAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAAGAgg < 2:2127836/150‑1 (MQ=255) aaCAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAAGAggg < 1:296105/150‑1 (MQ=255) aCAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCCGGTT‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTATAAGCCCCACCCAAGAGGGt < 1:1777776/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Acaagccttgttcaaatacatccgcgtagtcagcaaatacaccggcaaccccgacaccacaatcaacaacgccgcatacggcgc > 2:261854‑M2/1‑42 (MQ=255) cAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Acaagccttgttcaaatacatccgcgtagtcagcaaatacaccggcaaccccgacaccacaatcaacaacgccgcatacggcgc < 1:261854‑M2/125‑84 (MQ=255) aaGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑Acaagccttgttcaaatacatccgcgtagtcagcaaatacac > 1:1965819‑M2/1‑41 (MQ=255) aaGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAACAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAAGAGGGTaa > 2:915419/1‑150 (MQ=255) aGGCTTGtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagccttgttcaaatacatccgcgtagtcagcaaatacaccggcaaccccgacaccacaatcaacaacgccgcatacggcgccgccgccgcgaactcgacgttggctgt > 1:1515611‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagccttgttcaaatacatccgcgtagtcagcaaatacaccggcaaccccgacaccacaatcaacaacgccgcatacggcgccgccgccgcgaactcgacgttggctgtgtgt < 1:1973046‑M1/150‑148 (MQ=255) ttGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGCGAgctttcaagccttgttcaaatacatccgcgtagtcagcaaatacaccggcaaccccgacaccacaatcaacaacgccgcatacggcgccgccgccgcga > 2:204119‑M2/1‑37 (MQ=255) ttGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCGTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAAGAGGGTAACaaaa > 2:1908000/1‑150 (MQ=255) ttGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAAGAGGGTAACaaaa > 1:778616/1‑150 (MQ=255) gtgcccaggccacatggcggcctgggcaagctttcaagccttgttcaaatacatccgcgtagtcagcaaatacaccggcaaccccgacaccacaatcaacaacgccgcatacggcgccgccgccgcgaactcgacgttggctgtgtgtgc > 1:2244075‑M1/1‑1 (MQ=255) gAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGaaa < 1:163337/96‑1 (MQ=255) gAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGaaa > 2:163337/1‑96 (MQ=255) | GACCGGCATGACCACCCTGGCCACCGAGGTGTGGGCACACACAGCCAACGTCGAGTTCGCGGCGGCGGCGCCGTATGCGGCGTTGTTGATTGTGGTGTCGGGGTTGCCGGTGT‑ATTTGCTGACTACGCGGATGTATTTGAACAAGGCTTGAAAGCTTGCCCAGGCCGCCATGTGGCCTGGGC‑ACAAGCCTGAGTGCCTAGACTTCATCACAAGTTCACTTTAAAACTCTCACTAGCCAGTTGAAAGCAAAGAACAAGGTCGTAGATACTACAAGCCCCACCCAAGAGGGTAACAAAAC > NC_002947/5552235‑5552532 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |