New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 5820264 = | 102 (1.170) | intergenic (+57/‑43) | PP_5096/metX | shape determination factor/homoserine O‑acetyltransferase |
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGCAAACCGCCCGGTTCGATGAAC > NC_002947/5820077‑5820373 | cgtaactggccagtgaacggccacaggccagtgccagcggttcatcgaaccgggcggtttgcggtactaccagaccgacggaatcttcgggaaagacagttgacatcgaccctgctcacgcttgacggaggcgtaagtctaaagagcgct < 1:1977409‑M1/1‑1 (MQ=255) tCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCa < 1:1411795/150‑1 (MQ=255) tGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGc > 2:1128173/1‑143 (MQ=255) tGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGc < 1:1128173/143‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTGGTTTGTCATGCCCTGGCTTGCCGCGTACGCCGTCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCg > 1:1452022/1‑150 (MQ=255) tGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCa > 1:569691/1‑150 (MQ=255) gaacggccacaggccagtgccagcggttcatcgaaccgggcggtttgcggtactaccagaccgacggaatcttcgggaaagacagttgacatcgaccctgctcacgcttgacggaggcgtaagtctaaagagcgcTGCCCCCAGTCGCaa < 1:1723802‑M1/15‑1 (MQ=255) gCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAg > 2:2012373/1‑150 (MQ=255) gCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAg > 2:1613790/1‑150 (MQ=255) 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ccTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGc > 1:1809970/1‑113 (MQ=255) ccTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGc > 1:1809867/1‑113 (MQ=255) tCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTc > 1:1268886/1‑150 (MQ=255) aaGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTGCTCGCCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCg < 1:1334109/150‑1 (MQ=255) agCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCg < 2:1321201/150‑1 (MQ=255) agCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACCAACCCGCACCTGCAGCTTATGCAGGGGCTATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCg < 1:636703/150‑1 (MQ=255) cTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGt > 1:854454/1‑150 (MQ=255) tcacgcttgacggaggcgtaagtctaaagagcgcTACCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTa < 1:480409‑M1/38‑1 (MQ=255) tgGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTg < 2:854454/150‑1 (MQ=255) gAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCACGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGACGATTCCCTCGGTCTGgtag > 2:497253/1‑150 (MQ=255) aaTGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGgtagt > 1:1911178/1‑150 (MQ=255) tGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTAc < 2:369883/150‑1 (MQ=255) tGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTAc < 1:705146/150‑1 (MQ=255) gATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTAcc < 2:1452022/150‑1 (MQ=255) tCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTgg > 2:1439250/1‑56 (MQ=255) tCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAggg < 2:47076/101‑1 (MQ=255) tCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAggg > 1:47076/1‑101 (MQ=255) tCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGc > 2:1474008/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCAGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGCAAACCg > 1:1035647/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGCAAACCGcc < 2:2279072/150‑1 (MQ=255) cagcgccagcTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGCAAACCGCCCGGt > 1:1351491/1‑150 (MQ=255) agcgccagcTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGCAAACCGCCCGGtt < 1:779117/150‑1 (MQ=255) cTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGCAAACCGCCCGGTTCGATGAAc < 1:1474008/150‑1 (MQ=255) | TGCCAAATCTGGGTGGCATGGACATCTCGCCGATCTTCGCCTTCCTGGCGATCCAGGTGGTCCAGTCGTTTGTCATGCCCCCGCTGGCCGCCTACGCCGGCATGCCTCAAGAGCTGTGGCGAATGATCTGAGGCTCGCCAGCGCCAGCTTGCCCCCAGTCGCAAGCCTTTGCTTGCCGCTGGGGGTAGCGCTCTTTAGACTTACGCCTCCGTCAAGCGTGAGCAGGGTCGATGTCAACTGTCTTTCCCGAAGATTCCGTCGGTCTGGTAGTACCGCAAACCGCCCGGTTCGATGAAC > NC_002947/5820077‑5820373 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |