New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1798193 = | 84 (0.950) | 5 (0.060) | 5/244 | NT | 5.8% | coding (74/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
? | NC_002947 | 1798250 = | 80 (0.920) | coding (131/1128 nt) | lpxB | lipid‑A‑disaccharide synthase |
GCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCG > NC_002947/1798102‑1798396 | gcgGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAg > 1:301844/1‑150 (MQ=255) cgGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAgg > 2:515655/1‑150 (MQ=255) cATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCg > 1:1698691/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAggg < 2:1787071/150‑1 (MQ=255) gcTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTg < 1:921241/150‑1 (MQ=255) atatGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAAt < 2:997679/150‑1 (MQ=255) atatGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAAt < 2:301844/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCTGCTGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAt < 2:1939392/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAt < 2:2089067/150‑1 (MQ=255) gCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGCCCTGCAATCCTAt > 2:753666/1‑150 (MQ=255) cccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggatcgcaggccctcggcctccatcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgatggag < 2:2094254‑M2/2‑1 (MQ=255) cccagtacctcgactagccccatgacggccaggcgctccatggggaaataggatcgcaggccctcggcctccatcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgatggag > 1:2094254‑M2/128‑129 (MQ=255) ccAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTAttt > 2:1156468/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTccc < 2:1651266/150‑1 (MQ=255) tttGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCa < 2:452394/150‑1 (MQ=255) tttGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCa < 2:1281695/150‑1 (MQ=255) tGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATg < 2:645756/150‑1 (MQ=255) cGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCGGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGa < 1:398337/150‑1 (MQ=255) 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tCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCg < 1:2123477/150‑1 (MQ=255) gCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAg > 1:195006/1‑111 (MQ=255) gCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAg < 2:195006/111‑1 (MQ=255) gTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGGAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg > 2:106923/1‑150 (MQ=255) gTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgg < 1:1181559/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTGAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATGGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGCAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTTGCCGTCATgggg > 2:735006/1‑150 (MQ=255) gAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATgggg < 2:1890440/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTa > 1:447351/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCACGAACAAAGCG‑CGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTa > 2:1152519/1‑150 (MQ=255) tGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGa < 2:659693/150‑1 (MQ=255) tGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCACGC‑TACCTTGACGTGGGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCGTATTTCCACATGGGGCGCCTGGCCGTCATGGGGGTAGTAGa > 1:1120719/1‑150 (MQ=255) ggCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAg < 2:1986577/150‑1 (MQ=255) ggCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAg < 2:1546585/150‑1 (MQ=255) tatCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAg > 1:987301/1‑85 (MQ=255) tatCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAg < 2:987301/85‑1 (MQ=255) ctttGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTggg < 2:1145846/148‑1 (MQ=255) ccTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGa > 2:90013/1‑114 (MQ=255) ccTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGa < 1:90013/114‑1 (MQ=255) ccTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTggg > 2:1089205/1‑150 (MQ=255) cTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTgggg > 1:899594/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGgc > 1:431216/1‑146 (MQ=255) ttCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGgc < 2:431216/146‑1 (MQ=255) gCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGcgcg > 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atcaaggggccgccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTc < 1:289915‑M2/59‑1 (MQ=255) gc‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGCGGCTGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc < 2:1816575/150‑1 (MQ=255) gc‑CACCCCGACGTGCGGTTCATCGGGGTTGGCGGGCCCTTGATGGAGGCCTAGGGCCTGAAATCGTATTTCCCCATTCAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc < 1:753666/150‑1 (MQ=255) gc‑CACCCCGACGTGCCTTTTATCGTTTTTTGTGGCCGCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCCGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc < 2:1123815/150‑1 (MQ=255) ccaaccccgatgaaacgcacgtcggggtggcgcgccccttgatggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc > 1:1069556‑M2/46‑150 (MQ=255) c‑cACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATg < 2:772202/94‑1 (MQ=255) 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aCGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGa < 1:515655/150‑1 (MQ=255) gTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGTGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGAcc > 1:2223632/1‑150 (MQ=255) tGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGAccc < 1:1236343/150‑1 (MQ=255) gCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCt > 2:1239294/1‑150 (MQ=255) tttCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGAt > 1:1647746/1‑150 (MQ=255) tCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCg > 1:1147228/1‑150 (MQ=255) aTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc > 1:1660218/1‑130 (MQ=255) aTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAgctgc < 2:1660218/130‑1 (MQ=255) aTCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaa > 2:1407622/1‑150 (MQ=255) ggggTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCgaagaa < 1:1089205/150‑1 (MQ=255) cggcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTACGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGa < 1:1152519/150‑1 (MQ=255) ggcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGAc > 1:1899653/1‑150 (MQ=255) cgcgccttgagggAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGAc < 1:588808‑M2/137‑1 (MQ=255) gcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACg > 1:1138253/1‑150 (MQ=255) gcCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACg > 1:2001958/1‑150 (MQ=255) cccTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTa < 2:88139/150‑1 (MQ=255) cTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGaaa > 2:1847139/1‑137 (MQ=255) cTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGaaa < 1:1847139/137‑1 (MQ=255) cTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTAtt > 1:1319123/1‑150 (MQ=255) aTGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATc > 2:1475615/1‑150 (MQ=255) tGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCg < 1:1377897/150‑1 (MQ=255) tGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCg < 1:866204/150‑1 (MQ=255) | GCGGCATCACGCGCTGATATGGCCCAGCTTTGCGTAGCGCTGGTCGCCGGTGAGGCCAGTGGCGATATCCTTGGTTCAGGCTTGATGCGTGCCCTCAAGGCGCGC‑CACCCCGACGTGCGTTTCATCGGGGTTGGCGGCCCCTTGATGGAGGCCGAGGGCCTGCAATCCTATTTCCCCATGGAGCGCCTGGCCGTCATGGGGCTAGTCGAGGTACTGGGGCGCCTGCGCGAACTGCTCAAGCGCCGCAAGCTGCTGATCCAGACCCTGATCGAAGAAAAGCCCGACGTATTCATCG > NC_002947/1798102‑1798396 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |