New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 86765 | 156 (0.650) | 8 (0.030) +GC |
3/270 | NT | 7.0% | intergenic (‑48/+97) | PP_0075/PP_0076 | choline sulfate transporter/choline betaine‑binding protein |
? | NC_002947 | = 1504460 | 59 (0.240) | intergenic (+81/‑85) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GATGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGT > NC_002947/86616‑86912 | aagcggccaaggcctgggtgaaagcgcatcctgaatggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGc > 1:1782117‑M1/135‑150 (MQ=255) aagcggccaaggcctgggtgaaagcgcatcctgaacggttggatgggtggttggccggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGc < 2:3805272‑M1/16‑1 (MQ=255) aTGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCa < 1:1770421/150‑1 (MQ=255) gccgcTCAGGCCGACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGccc < 2:2494960/150‑1 (MQ=255) cgcTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgc > 1:3205315/1‑150 (MQ=255) tCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgctcc < 1:5291902/150‑4 (MQ=255) aGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaa > 1:5086618/1‑150 (MQ=255) ggCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa < 2:1817346/150‑1 (MQ=255) ggCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa < 2:1817318/150‑1 (MQ=255) ggCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa < 1:4659513/150‑1 (MQ=255) ggCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGaaaaa < 1:4883987/150‑1 (MQ=255) gCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCcgctcccaca < 1:106668/150‑8 (MQ=255) gCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAg > 2:4662539/1‑150 (MQ=255) cTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGcc > 2:2395819/1‑150 (MQ=255) tACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCa > 1:1813418/1‑150 (MQ=255) tgctggTCCTGTCGCAGGCTGCGTAACGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGTGCAGCAGTAAAGAGAGGCTATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAATCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAAcgc < 1:5375881/146‑1 (MQ=38) cagGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGt < 2:2881715/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCt > 2:5109711/1‑150 (MQ=255) 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cGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGcaaagc < 1:3686812/150‑6 (MQ=255) cGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGc < 2:5419758/150‑1 (MQ=255) ggCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGCAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTGTGcc > 2:4143584/1‑150 (MQ=255) ggCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGcc < 2:4709113/150‑1 (MQ=255) ccGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGgt < 1:3848316/150‑1 (MQ=255) 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cggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg > 1:3523435‑M1/80‑150 (MQ=255) cggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg > 1:576146‑M1/80‑150 (MQ=255) cggagttaccaccaaggccgatggggatgccctggaggccgtcaaagccaaactgtaatctcacaaagcaacacaccaaCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg > 1:593564‑M1/80‑150 (MQ=255) cGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCgcgcccgcgaacaccggcaaagccggtgccaagcaacgcgttggctttttcgcgg < 1:3287787‑M1/150‑56 (MQ=255) cGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCgg < 2:1773060/150‑1 (MQ=255) 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tGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACa > 2:1514779/1‑150 (MQ=255) gggTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGGGAGATTACat > 1:3028293/1‑149 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCttt > 2:4875895/1‑150 (MQ=255) acaATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGGGAGATTACAGTTTGGCttt > 1:1124784/1‑150 (MQ=255) aaTCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGa > 2:1960946/1‑150 (MQ=255) aaTCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGa < 1:4217109/150‑1 (MQ=255) aTCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGAc > 2:3862434/1‑150 (MQ=255) tCCTTCAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGTCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCTCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACg < 2:2623081/150‑1 (MQ=255) ttAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTAGCGGGCGCGCCCGcgaa > 1:5156678/1‑97 (MQ=255) aGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGGTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCCCAGGGTTGGTGTGGTGCTGTGTGAGAGTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTcc > 2:3378608/1‑150 (MQ=37) gggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAg > 2:4514787/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGGTGCGTGGCACCGGCGTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACCGGGTTGGTGGGTTGCGTTGTGGGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAgg > 1:2856880/1‑150 (MQ=25) gTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAggg < 1:1600879/150‑1 (MQ=255) tCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGc < 1:4010064/150‑1 (MQ=255) ccAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATc > 1:1274987/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCGTGGCACCGGCGGTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGGTGGTGTGGTGCGGTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATcc > 2:141129/1‑150 (MQ=25) CCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCAt < 2:2620529‑M1/150‑1 (MQ=255) CTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCg > 1:292909‑M1/1‑150 (MQ=255) GTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGc > 2:2142112‑M1/1‑150 (MQ=255) AGCTGGCATGCCCGCGAATAATCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCTCACCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtgg > 2:3266714‑M1/1‑150 (MQ=255) AGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtgg > 1:2395819‑M1/1‑150 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggt < 1:1065344‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCAACGGCCTtggt < 1:3767552‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTtggtgg > 1:1453657‑M1/1‑150 (MQ=255) GGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTggtggt > 2:2730359‑M1/1‑150 (MQ=255) | GATGGCGCCGCTCAGGCCTACCAGCAGGTCCTGGCGCAGGCTGCGGCCCGATTGGCGGGGAAGCCAGGTGAGGAAGGGCAGCAGTAAAGAGAGGCGATGCATGGGTTATCCACAATCCTTAAGGGGTCGCCAAGCCCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAAAAGCCAACGCGTTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTGGTGTGTTGCTTTGTGAGATTACAGTTTGGCTTTGACGGCCTCCAGGGCATCCCCATCGGCCTTGGTGGT > NC_002947/86616‑86912 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |