New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4585441 = | 75 (0.380) | 11 (0.070) | 6/236 | NT | 13.9% | intergenic (‑48/+123) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | 4585542 = | 72 (0.430) | intergenic (‑149/+22) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
GGCACCTGCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4585607‑4585441 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaacccgctcctac‑gggggGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCG > NC_002947/4585542‑4585687 GGCACCTGCCGTTCGGCATCGGGCGCATCGAAAACGCCCGTTAACCCGGTTCCGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAA < 1:2295214/150‑1 CACCTGCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGGGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAAC < 2:5337/150‑1 ACCTGCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACC < 2:1237049/150‑1 TGCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:678217/150‑1 TGCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGC < 2:4396488/150‑1 TGCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGC < 1:3102787/150‑1 GCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCT < 2:2335775/150‑1 CCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:267072/150‑1 TTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACACGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGTACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTA < 1:1943179/150‑1 CGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑G < 2:4461367/150‑1 CGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTCCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑G < 2:4461443/150‑1 CATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGG < 1:4010651/150‑1 CCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATG > 1:3745014/1‑150 GGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGG > 1:2871210/1‑150 GGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGT > 1:885064/1‑150 GTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGCCCCGTGTGAACCTGGTTAACGGGCTTTTTGGATGGGCCAGATGCCGAACGGCCGGg > 2:895596/1‑149 GTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTG > 2:3371792/1‑150 GTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCGGAACCGTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTG > 2:3371772/1‑150 TTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGC > 1:102486/1‑150 TTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGC > 1:102442/1‑150 ACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTAT > 1:2175147/1‑150 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTC > 1:2548216/1‑150 TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAAACTTGTTAACGGGCTTTTTAGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTGTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTC > 1:1021437/1‑150 AAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCT > 2:943504/1‑150 CCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCA > 1:817259/1‑150 CCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCA > 1:3085886/1‑150 CCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCA > 1:401880/1‑150 CCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAC > 2:111947/1‑150 CCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAC > 1:1084665/1‑150 CCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAC > 1:101553/1‑150 CCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACC > 1:2319821/1‑150 cccccC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTG < 1:1490734/145‑1 CTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGG > 2:558636/1‑150 tacgGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGG > 1:765589/5‑150 TAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGT > 1:4374515/1‑150 TAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGT > 1:1739158/1‑150 GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTTTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCGATTGGGTATTGCCGTACCAGGACCAGCGGTGGCCGTTAATCAGGTGTTAACCCTGGGTTTg > 2:1166973/1‑149 GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGGTTTTTCGATGCGCCAGATGCAGAACGCCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATACATAGGGTCTTGACGTACAAACACCACCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTac > 2:864911/1‑148 GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTC < 2:4223438/150‑1 GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCG < 2:2934351/150‑1 GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCG < 1:49288/150‑1 GGCACCTGCCGTTCGGCATCTGGCGCATCGAAAAAGCCCGTTAACAAGGTTCAGACTGTGCCCCCCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTATCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCTCGGCACCGCGGTGTCATCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑GGGGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/4585607‑4585441 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaacccgctcctac‑gggggGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCG > NC_002947/4585542‑4585687 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |