| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 4585441 = | 75 (0.380) | 11 (0.070) | 6/236 | NT | 13.9% | intergenic (‑48/+123) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
| ? | NC_002947 | 4585542 = | 72 (0.430) | intergenic (‑149/+22) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase | |||||
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CTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCG > NC_002947/4585403‑4585687 | cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAg > 1:1749302/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGGCGAGGTGCAGGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGCTAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGt > 1:139055/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACCGt > 1:1821589/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAgg > 2:3552226/1‑149 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGt > 1:1749071/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGt > 1:2957118/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CCCAGTCTGa > 2:782155/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CCCAGTCTGa > 2:4366755/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGa > 2:782098/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCACGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGa > 2:3670256/1‑150 (MQ=255) aTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CCCAGGCTGaa > 1:2793345/1‑150 (MQ=255) aTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGaa > 2:1552017/1‑150 (MQ=255) cacaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGTGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑‑GGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTaa > 1:3385019/1‑150 (MQ=255) cacaGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGG‑CCCCGTCGGAACCTtttt > 1:870360/1‑150 (MQ=38) tCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCtt > 1:943459/1‑150 (MQ=255) ccGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCGTGTTAACGGGCgtt > 2:3587029/1‑150 (MQ=255) cGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGGTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑GACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCtttt > 1:1500901/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGa > 1:324708/1‑150 (MQ=255) ttGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CCCAGTCTGAACCTTGGTAACGGGCTTTTTCGAt > 1:4290295/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTAGATgcgc > 1:2825670/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCATGTTAACGGGCTTTTTAGATgagc > 1:1155139/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCGTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAAAGGGCTTTTTCGATgcgc > 1:776606/1‑150 (MQ=255) CCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATg < 1:4010651‑M1/150‑1 (MQ=255) CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGGACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCg < 2:4461443‑M1/150‑1 (MQ=255) CGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCg < 2:4461367‑M1/150‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACgg < 2:267072‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCa < 1:678217‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCa < 1:3102787‑M1/150‑1 (MQ=255) GGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGt < 2:1237049‑M1/150‑1 (MQ=255) ggtttatccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacggggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAgg > 1:2871210‑M2/89‑150 (MQ=255) GTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTg < 2:5337‑M1/150‑1 (MQ=255) gtttatccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacggggggGGGGGG‑CCCCGTGTGAACCTGGTTAACGGGCTTTTTGGATGGGCCAGATGCCGAACGGCcggg > 2:895596‑M2/88‑149 (MQ=255) ggtttatccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGt > 1:885064‑M2/88‑150 (MQ=255) gtttatccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTg > 2:3371792‑M2/87‑150 (MQ=255) gtttatccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggGGGGGG‑CACAGTCGGAACCGTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTg > 2:3371772‑M2/87‑150 (MQ=255) TTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCGGAACCGGGTTAACGGGCGTTTTCGATGCGCCCGATGCCGAACGGCAGGTGcc < 1:2295214‑M1/150‑1 (MQ=255) tttatccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGc > 1:102486‑M2/86‑150 (MQ=255) tttatccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGc > 1:102442‑M2/86‑150 (MQ=255) 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ccgctcctacgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAc > 1:1084665‑M2/16‑150 (MQ=255) cccgctcctacggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAc > 2:111947‑M2/16‑150 (MQ=255) ccgctcctacggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCAcc > 1:2319821‑M2/15‑150 (MQ=255) ctacggggggggggggg‑CCCCGTCTGACCCTTGTTAACGGGCTTTTTGGATGCGCCAGATGCCGAACGGCCGGTGCCAGGGCTCTGGGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCCCCACCCGCGGTGGCCGTTAAACCGGGATTAACCCTg > 2:676194/7‑150 (MQ=255) ccccccgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTg < 1:1490734‑M2/139‑1 (MQ=255) tacggggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTggg > 1:765589‑M2/10‑150 (MQ=255) ctacgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTggg > 2:558636‑M2/10‑150 (MQ=255) tacgggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGt > 1:4374515‑M2/9‑150 (MQ=255) gggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTTTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCGATTGGGTATTGCCGTACCAGGACCAGCGGTGGCCGTTAATCAGGTGTTAACCCTGGgtttg > 2:1166973‑M2/6‑149 (MQ=255) gggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGGTTTTTCGATGCGCCAGATGCAGAACGCCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATACATAGGGTCTTGACGTACAAACACCACCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGggttac > 2:864911‑M2/6‑148 (MQ=255) gggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTc < 2:4223438‑M2/145‑1 (MQ=255) ggggGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCg < 2:2934351‑M2/146‑1 (MQ=255) | CTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTCTTCACCCTGGGTTTCG > NC_002947/4585403‑4585687 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |