| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4585441 = | 75 (0.380) | 11 (0.070) | 6/236 | NT | 13.9% | intergenic (‑48/+123) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
| ? | NC_002947 | 4585542 = | 72 (0.430) | intergenic (‑149/+22) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase | |||||
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TCGAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGC > NC_002947/4585294‑4585585 | cgaaacccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgcccccccccc < 1:49288‑M1/4‑1 (MQ=255) gtaacccagggtgaagacctgatgaacggccaccggtggtgtttgtacgtcaagaccctatgtatgcgcatagagccctggcacctggcgttctgcatctggcgcatcgaaaaaccccgttaacaaggttcagactgtgccccccccccc > 2:864911‑M1/146‑150 (MQ=255) gAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC < 1:3607488‑M1/150‑1 (MQ=255) caaacccagggttaacacctgattaacggccaccgctggtcctggtacggcaatacccaatcgatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaaaaaggttcagactgtgccccccccccc > 2:1166973‑M1/146‑150 (MQ=255) tCGAAGAACGACTTGCTGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGGACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATGGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTA < 2:232747‑M1/150‑1 (MQ=255) acccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTa > 1:4374515‑M1/143‑150 (MQ=255) cccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccccccccgta > 1:765589‑M1/142‑146 (MQ=255) cccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAg > 2:558636‑M1/142‑150 (MQ=255) cGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAG < 2:2885779‑M1/150‑1 (MQ=255) cGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAG < 2:1691994‑M1/150‑1 (MQ=255) gaagaaCGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGG > 1:1449919‑M1/1‑150 (MQ=255) agaaCGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAG < 2:3531461‑M1/150‑1 (MQ=255) gaaCGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGC > 1:3257093‑M1/1‑150 (MQ=255) 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ttGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGTTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTA > 1:2081126‑M1/1‑150 (MQ=255) ttGATGAGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTA < 1:2500816‑M1/150‑1 (MQ=255) gATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTAcc > 2:2081285/1‑150 (MQ=255) aTGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:3880785/150‑1 (MQ=255) gtgCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1068460/150‑1 (MQ=255) gaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:2548216‑M1/123‑150 (MQ=255) gaacggccaccgctggtcgtggtacggcaacacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatctaaaaagcccgttaacaagtttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:1021437‑M1/123‑150 (MQ=255) cAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 1:1914354/150‑1 (MQ=255) cAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:4352848/150‑1 (MQ=255) gCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 2:1571515/150‑1 (MQ=255) gCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 1:2737841/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAt < 2:332100/150‑1 (MQ=255) tGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACcgc > 2:2767453/1‑150 (MQ=255) ggCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTg > 1:2231215/1‑150 (MQ=255) gCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCTGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGc < 2:3162521/150‑1 (MQ=255) ccTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAg < 1:3099490/150‑1 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTGTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAgg > 1:3440556/1‑150 (MQ=255) ttGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGt > 2:437410/1‑150 (MQ=255) ttGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGt > 2:437456/1‑150 (MQ=255) gTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGc < 1:1998291/150‑1 (MQ=255) 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tCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCGTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAAAGGGCTTTTTCGATgcgc > 1:776606/1‑150 (MQ=255) | TCGAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGC > NC_002947/4585294‑4585585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |