| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 624412 = | 190 (0.960) | 10 (0.050) | 8/270 | NT | 5.3% | coding (498/702 nt) | PP_0537 | transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 624448 = | 174 (0.900) | coding (462/702 nt) | PP_0537 | transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 225 total aligned reads displayed.
CCAGGCCCTGCGCCTGACGCTGAGCAGCGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAG > NC_002947/624264‑624561 | ccAGGCCCTGCGCCTGACGCTGAGCAGCGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGc < 2:1962801/150‑1 (MQ=255)ccAGGCCCTGCGCCTGACGCTGAGCAGCGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGc < 2:4032033/150‑1 (MQ=255)ccAGGCCCTGCGCCTGACGCTGAGCAGCGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGc < 2:2967504/150‑1 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cATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCaa > 1:2137479/1‑150 (MQ=255) cATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCaa < 1:701534/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAg < 1:3616658/150‑1 (MQ=255) tGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGAGGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGc > 2:4001035/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCCGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGcc > 1:2471826/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGcc > 1:1777568/1‑150 (MQ=255) gCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGcc > 2:4272672/1‑150 (MQ=255) ccGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGccc > 1:1010258/1‑150 (MQ=255) cGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCt > 2:4227485/1‑150 (MQ=255) cGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCt > 1:1606639/1‑150 (MQ=255) cGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCt > 1:1946498/1‑150 (MQ=255) tttGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCa < 2:3319718/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAg < 2:207245/150‑1 (MQ=255) ttccgctgcaagctaccctgGCCATCGACC‑‑‑TGGG‑CATGACCCAGGTGGTCGAGGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAgg < 2:1866807‑M1/130‑1 (MQ=255) gcagcaGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAggg > 1:276466/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGGCAGAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAggg > 1:98161/1‑150 (MQ=255) agGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCtttt > 2:2035394/1‑150 (MQ=255) cATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCg < 1:2265321/150‑1 (MQ=255) tAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGc < 1:3532472/150‑1 (MQ=255) tAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGc > 2:1444139/1‑150 (MQ=255) gTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAg < 1:305916/150‑1 (MQ=255) GCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAg > 1:3405426‑M1/1‑150 (MQ=255) | CCAGGCCCTGCGCCTGACGCTGAGCAGCGGTGTAGCGTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAG > NC_002947/624264‑624561 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |