| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 624412 = | 190 (0.960) | 10 (0.050) | 8/270 | NT | 5.3% | coding (498/702 nt) | PP_0537 | transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 624448 = | 174 (0.900) | coding (462/702 nt) | PP_0537 | transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
GTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAGCAAGCCGTTGCG > NC_002947/624300‑624597 | gTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCa < 1:1386390/150‑1 (MQ=255) ttCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAg < 2:1712909/150‑1 (MQ=255) tCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAgg < 1:101464/150‑1 (MQ=255) 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ttCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAG‑TGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAgcgc > 2:245061/1‑150 (MQ=255) tCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAgcgc < 2:2533516/150‑1 (MQ=255) GCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAg > 1:636397‑M1/1‑150 (MQ=255) tggccatcgacctgggcatggcccaggtggtcgagggcCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAgcgc > 2:1482798‑M2/39‑150 (MQ=255) CCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGt < 2:3052028‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGt < 1:3481230‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGt < 1:3481788‑M1/150‑1 (MQ=255) cTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtg > 1:166649/1‑150 (MQ=255) cTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtg > 1:651095/1‑150 (MQ=255) tCGACCACATGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAATCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgc > 2:527437/1‑150 (MQ=255) cGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgct < 1:904805/150‑1 (MQ=255) accaccTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCCGGtgcttg > 2:494253/1‑150 (MQ=255) catcgacctgggcatgacccaggtcgatggcCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgct > 2:1016988‑M2/32‑150 (MQ=255) catcgacctgggcatgacccaggtcgatggcCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgct > 1:301244‑M2/32‑150 (MQ=255) caccTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgcttgct < 2:3331180/150‑1 (MQ=255) atcgacctgggcatgacccaggtggatggcCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGtgctt > 1:3102695‑M2/31‑150 (MQ=255) accTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTtgctg > 2:3737706/1‑150 (MQ=255) accTGGG‑CATGACCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTtgctg > 2:696128/1‑150 (MQ=255) ccTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTtgctgc < 1:2284051/150‑1 (MQ=255) gggTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCa < 2:2545251/150‑1 (MQ=255) aTG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGc < 1:1881340/150‑1 (MQ=255) cAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAg > 2:4444954/1‑150 (MQ=255) aGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAGc > 1:3366945/1‑150 (MQ=255) ggcCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAGCAAGCCGtt < 1:1467831‑M2/147‑1 (MQ=255) ggcCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAGCAAGCCGtt < 1:4473017‑M2/147‑1 (MQ=255) cCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCTGAATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAGCAAGCCGTTGc < 1:731785‑M2/149‑1 (MQ=255) cCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAGCAAGCCGTTGc > 2:4269651‑M2/2‑150 (MQ=255) | GTTCGACCGTGTAGTTGCGCCGGTCATGGCTGTGCAGGTACAGGGTGTCGTGCGGGCCAAGACTGAGGTTGTTTACCCTGAGCATGCCGTTTTGCAGCAGGGCATAGGTTTCGCCCTCGACCACCTGGGTCATG‑CCCAGGT‑‑‑CGATGGCCAGGGTAGCTTGCAGCGGAATCAGCGGGAGCATGTTGCTGGCCGGCATTGCCAGGCAGATTGCGTTGCCGGCTTGCACACCCAAGCCCTTCAGGGCTTTTGCCGGCAAGCGCAGGTGCTTGCTGCCCACCGGCGACAGCAAGCCGTTGCG > NC_002947/624300‑624597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |