| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 943826 = | 50 (0.250) | 5 (0.030) | 3/264 | NT | 6.9% | coding (1799/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 943866 = | 88 (0.470) | coding (1759/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein | |||||
TGGCTTGCAGCACTTCGCCGTCAACTTGTGGCGGGTTGAGGTTGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCG > NC_002947/943677‑943975 | tggcagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccc > 1:3449312‑M1/150‑150 (MQ=255) cagtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGc > 1:1284571‑M1/147‑150 (MQ=255) agtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGcc < 1:2853201‑M1/5‑1 (MQ=255) gtgccattgccaacgccgatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCCg > 2:2439064‑M1/145‑150 (MQ=255) gatggcagcttcagcatcgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAg < 2:2546215‑M1/23‑1 (MQ=255) catcgaactgaatcccgcacacgccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑TCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCg > 2:1890684‑M1/114‑150 (MQ=255) cgaactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAg > 1:1125640‑M1/111‑150 (MQ=255) aactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAggg > 1:2546215‑M1/109‑150 (MQ=255) actgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgttgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAgggg > 1:2337765‑M1/108‑150 (MQ=255) aCGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCa > 2:884590/1‑150 (MQ=11) aCGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCa > 2:2431202/1‑150 (MQ=11) aCGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCa > 1:566536/1‑150 (MQ=11) gATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAAc > 2:4084478/1‑150 (MQ=32) tGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCa > 2:1383320/1‑150 (MQ=32) tGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCa < 1:4392905/150‑1 (MQ=32) gcgcACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCAc > 2:3981469/1‑150 (MQ=32) gcACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGt < 2:352593/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 2:3311303/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 2:318718/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 1:2064788/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 2:838666/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 1:4185232/150‑1 (MQ=32) cGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCca < 2:3361869/150‑1 (MQ=32) cGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCca < 2:339796/150‑1 (MQ=32) ggTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCcag < 2:691050/150‑1 (MQ=32) ggTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCcag < 1:1448979/150‑1 (MQ=32) gTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCcagc < 1:1784422/150‑1 (MQ=32) tgctgtCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCcagca < 2:136714/150‑1 (MQ=17) gctgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCcagcag > 1:25660/1‑150 (MQ=32) ctgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGt < 2:316223/150‑1 (MQ=32) tgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGtt > 1:4188422/1‑150 (MQ=32) tgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGtt > 2:3533818/1‑150 (MQ=32) cccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCg > 1:2904784/1‑150 (MQ=32) cccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCg > 2:614192/1‑150 (MQ=32) ggTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCg < 1:3827224/150‑1 (MQ=32) ttCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGtt < 2:4324510/150‑1 (MQ=32) ttCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGtt < 2:3253897/150‑1 (MQ=32) cGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTgg < 2:3511901/150‑1 (MQ=32) ggCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGc > 2:1332068/1‑150 (MQ=32) ggCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGc < 2:4048478/150‑1 (MQ=32) gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCt > 2:3960107/1‑150 (MQ=32) gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCt > 2:3960177/1‑150 (MQ=32) gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCt > 2:2722653/1‑150 (MQ=32) gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCt > 2:2722660/1‑150 (MQ=32) cACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCtt < 1:3639299/150‑1 (MQ=32) gCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGc < 1:1749927/150‑1 (MQ=32) ccGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCCGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCg < 1:4327383/150‑1 (MQ=17) ccGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCg < 2:2744600/150‑1 (MQ=32) ccGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCg > 2:2010773/1‑150 (MQ=32) cGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg < 1:2451023/150‑1 (MQ=32) cGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg < 1:4117793/150‑1 (MQ=32) cGGTGATAACCCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGCTGTCGGGCGCGGTGATCCGTGCGGGCAGCGAGGACCCGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgc < 1:2441249/150‑2 (MQ=11) ggTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCggg < 1:3981469/150‑1 (MQ=32) gTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGa < 2:475131/150‑1 (MQ=32) gTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGa < 1:3900689/150‑1 (MQ=32) gTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGa < 1:3900556/150‑1 (MQ=32) tGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGAt > 1:2916538/1‑150 (MQ=32) gATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGAtt < 1:1370436/150‑1 (MQ=32) aTAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTc < 1:4278314/150‑1 (MQ=32) aaCGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAg < 2:162922/150‑1 (MQ=32) aaCGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAg < 2:2084652/150‑1 (MQ=32) cGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGtt < 2:4366638/150‑1 (MQ=32) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTc > 2:1129569/1‑150 (MQ=32) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTc < 1:3238655/150‑1 (MQ=32) CTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCg > 2:4329264‑M1/1‑150 (MQ=255) | TGGCTTGCAGCACTTCGCCGTCAACTTGTGGCGGGTTGAGGTTGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCG > NC_002947/943677‑943975 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |