| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 943826 = | 50 (0.250) | 5 (0.030) | 3/264 | NT | 6.9% | coding (1799/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 943866 = | 88 (0.470) | coding (1759/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein | |||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
TGAGGTTGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAA > NC_002947/943713‑944015 | catcgaactgaatcccgcacacgccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑TCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCg > 2:1890684‑M1/114‑150 (MQ=255) aactgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggtcgccatcgatgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAggg > 1:2546215‑M1/109‑150 (MQ=255) actgaatcccgcacaagccaacggcgaactgctggacgtggttgccatcgttgacggcggcgtttcctcgctgcccgcacagatcaccgcgcccgacatcaccgcccCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAgggg > 1:2337765‑M1/108‑150 (MQ=255) aCGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCa > 1:566536/1‑150 (MQ=11) gATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAAc > 2:4084478/1‑150 (MQ=32) tGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCa > 2:1383320/1‑150 (MQ=32) tGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCa < 1:4392905/150‑1 (MQ=32) gcgcACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCAc > 2:3981469/1‑150 (MQ=32) gcACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGt < 2:352593/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 2:838666/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 2:318718/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 1:4185232/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 2:3311303/150‑1 (MQ=32) cACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTc < 1:2064788/150‑1 (MQ=32) cGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCca < 2:339796/150‑1 (MQ=32) cGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCca < 2:3361869/150‑1 (MQ=32) ggTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCcag < 2:691050/150‑1 (MQ=32) ggTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCcag < 1:1448979/150‑1 (MQ=32) 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cccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCg > 2:614192/1‑150 (MQ=32) cccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCg > 1:2904784/1‑150 (MQ=32) ggTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCg < 1:3827224/150‑1 (MQ=32) ttCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGtt < 2:3253897/150‑1 (MQ=32) ttCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGtt < 2:4324510/150‑1 (MQ=32) 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gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCt > 2:2722660/1‑150 (MQ=32) gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCt > 2:3960177/1‑150 (MQ=32) cACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCtt < 1:3639299/150‑1 (MQ=32) gCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGc < 1:1749927/150‑1 (MQ=32) ccGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCCGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCg < 1:4327383/150‑1 (MQ=17) 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ccAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCgg > 1:2003312/1‑150 (MQ=32) ccAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCgg > 2:1974208/1‑150 (MQ=32) gTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGt < 1:2546741/150‑1 (MQ=32) gTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGt < 1:3982080/150‑1 (MQ=32) cggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTgg > 1:2287964/1‑150 (MQ=32) cggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTgg < 2:304725/150‑1 (MQ=32) cggtcggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTgg < 1:3781775/150‑1 (MQ=32) ggtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAGCCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCAACGCCGATGGCagct < 2:2831913/150‑4 (MQ=11) gtGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCAACGCCGATGGCagctt < 1:1902807/150‑5 (MQ=255) gCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCa < 1:876995/150‑1 (MQ=32) cggcagGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCAc > 2:2439064‑M2/7‑150 (MQ=255) ggcagGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACt < 1:2853201‑M2/145‑1 (MQ=255) gcagGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTg > 1:1284571‑M2/5‑150 (MQ=255) gGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCa > 1:3449312‑M2/2‑150 (MQ=255) gggCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCaa > 2:3507287/1‑150 (MQ=32) gggCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCaa > 1:180515/1‑150 (MQ=32) gggCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCaa > 2:3507369/1‑150 (MQ=32) | TGAGGTTGAGGCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCAACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAGCTGCCATCGGCGTTGGCAATGGCACTGCCAA > NC_002947/943713‑944015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |