New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3717876 = | 228 (1.160) | 13 (0.070) | 10/266 | NT | 5.7% | coding (378/441 nt) | paaI | hydroxyphenylacetyl‑CoA thioesterase |
? | NC_002947 | 3717910 = | 207 (1.090) | coding (344/441 nt) | paaI | hydroxyphenylacetyl‑CoA thioesterase |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
GGCGCGCACGCTGCTCAGGGCCCCGGCATAGCGGCCAATGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCG > NC_002947/3717728‑3718024 | tcgccttcgcctgcaatagctacgaccaggccacggtggcgctgggctgcaccatcgactacctggccccggcgctgcgcgatgacgtgctcaccgcccacgccagcgaagtcagccgcaaaggccgcaccggcctgtacgacgtgcgCa > 2:1394118‑M1/149‑150 (MQ=255) gcgcgcACGCTGCTCAGGGCCCCGGCATAGCGGCCAATGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACGTTGTAGGATTTGCCATGGAACAt > 1:1061696/1‑150 (MQ=255) cgccttcgcctgcaatagctacgaccaggccacggtggcgctgggctgcaccatcgactacctggccccggcgctgcgcgatgacgtgctcaccgcccacgccagcgaagtcagccgcaaaggccgcaccggcctgtacgacgtgcgCAt > 1:1317019‑M1/148‑150 (MQ=255) 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gcACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGt > 2:335220/1‑150 (MQ=255) gcACTTTGGAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGt < 2:4281614/150‑1 (MQ=255) cACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTc < 1:1913082/150‑1 (MQ=255) aCTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCg < 2:1815215/150‑1 (MQ=255) tttGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGAt > 2:3669319/1‑150 (MQ=255) tttGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGAt > 2:2058464/1‑150 (MQ=255) tttGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGAt > 2:1968589/1‑150 (MQ=255) ttGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATg < 1:4052187/150‑1 (MQ=255) aGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGc < 1:1139211/150‑1 (MQ=255) gCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAg > 1:285129/1‑150 (MQ=255) ccATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAgc > 2:2812156/1‑150 (MQ=255) cATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAgcg > 2:4291231/1‑150 (MQ=255) cATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAgcg > 2:3533148/1‑150 (MQ=255) cATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAgcg > 2:1966302/1‑150 (MQ=255) aTGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAgcgc > 2:247937/1‑150 (MQ=255) tGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGcc > 2:4098869/1‑150 (MQ=255) aaCATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCAcc < 1:3742745/150‑1 (MQ=255) | GGCGCGCACGCTGCTCAGGGCCCCGGCATAGCGGCCAATGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCG > NC_002947/3717728‑3718024 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |