| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 3717876 = | 228 (1.160) | 13 (0.070) | 10/266 | NT | 5.7% | coding (378/441 nt) | paaI | hydroxyphenylacetyl‑CoA thioesterase |
| ? | NC_002947 | 3717910 = | 207 (1.090) | coding (344/441 nt) | paaI | hydroxyphenylacetyl‑CoA thioesterase | |||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
CAATGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCAGGCGAAGGCGA > NC_002947/3717763‑3718057 | gtggcgctgggctgtaccatcgactacctggccccggcgctgcgcgatgacgtgctcaccgcccacgccagcgaagtcagccgcaaaggccgcaccggcctgtacgacgtgcgCATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATgcgc > 2:1803613‑M1/114‑150 (MQ=255)cAATGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATgcgc < 1:1688235/150‑1 (MQ=255) tggcgctgggctgcaccatcgactacctggccccggcgctgcgcgatgacgtgctcaccgcccacgccagcgaagtcagccgcaaaggccgcaccggcctgtacgacgtgcgCATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCa > 1:1905242‑M1/113‑150 (MQ=255) aaTGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCa > 1:1867434/1‑150 (MQ=255) aaTGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACGTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCa > 2:1985452/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCAc > 1:4457699/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCAc < 2:1663575/150‑1 (MQ=255) gggCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCAcgt < 1:3007409/150‑1 (MQ=255) 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ccaccaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCt > 2:297882/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCt > 1:4373177/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCt > 1:2260432/1‑150 (MQ=255) ccaccaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGGAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCt > 1:3303665/1‑150 (MQ=255) aaccagcgcggtgagctggttgtcgatgCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAg > 1:1660258‑M2/29‑114 (MQ=255) accaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTgg > 1:2940577/1‑150 (MQ=255) accaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTgg > 2:376269/1‑150 (MQ=255) accaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTgg > 2:4229272/1‑150 (MQ=255) ccaGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAG‑GCCACGGTGGcgctggg < 2:1688896/150‑7 (MQ=255) caGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTc < 2:1228876/150‑1 (MQ=255) caGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTc < 2:3505486/150‑1 (MQ=255) caGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTc < 1:296215/150‑1 (MQ=255) tCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAg > 1:322682/1‑150 (MQ=255) tCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAg < 2:1061696/150‑1 (MQ=255) cgcggtgagctggtggcgatgCGCACGTCGTACAGGCCGCTGCGGACTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAg > 2:2307360‑M2/22‑150 (MQ=255) cTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCa < 2:363953/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCag < 1:2360274/150‑1 (MQ=255) gTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggc < 1:3018908/150‑1 (MQ=255) tCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaag < 1:767433/150‑1 (MQ=255) tCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaag < 1:4429124/150‑1 (MQ=255) tCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaag < 2:519611/150‑1 (MQ=255) tCGACGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaag < 1:2160916/150‑1 (MQ=255) cgatgCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTCGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaagg > 1:3438881‑M2/6‑150 (MQ=255) cgatgCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaagg > 2:1975697‑M2/6‑150 (MQ=255) gatgCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaaggc > 2:3363613‑M2/5‑150 (MQ=255) atgCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaaggcg > 2:4220750‑M2/4‑150 (MQ=255) tgCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCaggcgaaggcga > 2:1394118‑M2/3‑150 (MQ=255) | CAATGGGCGTGCGCACGGCGTCGATGATCAAGGCATCGGCGTGGGTCGGTTCATTCATCTTGCGTCTCCTGCGCCAGCACGGTGCCGCGCACTTTGTAGGATTTGCCATGGAACATCGCCACCAGCTCACCGCGCTGGTTGTCGATGCGCACGTCGTACAGGCCGGTGCGGCCTTTGCGGCTGACTTCGCTGGCGTGGGCGGTGAGCACGTCATCGCGCAGCGCCGGGGCCAGGTAGTCGATGGTGCAGCCCAGCGCCACCGTGGCCTGGTCGTAGCTATTGCAGGCGAAGGCGA > NC_002947/3717763‑3718057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |