| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 6005183 = | 171 (0.870) | 15 (0.080) | 10/262 | NT | 8.3% | coding (732/1491 nt) | amaB | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 6005228 = | 171 (0.910) | coding (687/1491 nt) | amaB | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
ACGATCAGGCGGCGCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGG > NC_002947/6005034‑6005331 | aCGATCAGGCGGCGCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCgg > 1:3294923/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCGGCGCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGgc > 1:3665941/1‑150 (MQ=255) ccgccctggcctgccaggcgttgttcgaaaaagccctgaaagccttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGgca > 1:2831417‑M1/147‑150 (MQ=255) ccgccctggcctgccaggcgttgttcgaaaaagccctgaaagccttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGgca > 1:3111284‑M1/147‑150 (MQ=255) ccgccctggcctgccaggcgttgttcgaaaaagccctgaaagccttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGgca > 1:3950893‑M1/147‑150 (MQ=255) aTCAGGCGGCGCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGgca < 2:109960/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCGGCGCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGgca < 2:58078/150‑1 (MQ=255) cgccctggcctgccaggcgttgttcgaaaaagccctgaaagccttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGgcag < 2:1743130‑M1/5‑1 (MQ=255) cgccctggcctgccaggcgttgttcgaaaaagccctgaaagccttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGgcag < 1:4508893‑M1/5‑1 (MQ=255) acgcctggcaggccaggcgttgttcgaaaaagccctgaaagccttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGgcag < 2:2397706‑M1/5‑1 (MQ=255) ggcggcGCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCAGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCaa > 2:667127/1‑150 (MQ=255) gcggcgCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTGGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAc > 2:215256/1‑150 (MQ=255) gcAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTg < 1:1583183/150‑1 (MQ=255) 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gccCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTtg > 1:2220042/1‑150 (MQ=255) cccAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTtgt < 1:2416517/150‑1 (MQ=255) cccAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTtgt < 1:3723894/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTtgtg < 1:918230/150‑1 (MQ=255) cAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTTGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGc < 2:419118/150‑1 (MQ=255) cAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGc < 2:263944/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCaa > 1:3816096/1‑150 (MQ=255) ccAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAagc > 2:1140793/1‑150 (MQ=255) cAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAagcc > 1:175761/1‑150 (MQ=255) gATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAagccagc > 1:2761564/1‑150 (MQ=255) 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gAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGcc < 1:482291/150‑1 (MQ=255) gCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGaa < 1:2977522/150‑1 (MQ=255) gCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGaa < 2:3259595/150‑1 (MQ=255) gggCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAgg < 2:451912/150‑1 (MQ=255) gggCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTGCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAgg > 1:2591145/1‑150 (MQ=255) | ACGATCAGGCGGCGCAGGGTGGTGCAACGCTGGCCGGCAGTGCCGACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCAAC‑GCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGG > NC_002947/6005034‑6005331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |