| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 6005183 = | 171 (0.870) | 15 (0.080) | 10/262 | NT | 8.3% | coding (732/1491 nt) | amaB | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | 6005228 = | 171 (0.910) | coding (687/1491 nt) | amaB | L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
ACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAGGGCGG > NC_002947/6005079‑6005373 | ccttctgcgatgctccggctggcttgtcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgatgccatggtcgacgacccgcgcttaccgctggtcagcgccaccGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCg > 1:4323681‑M1/105‑150 (MQ=255) ttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGt > 1:3429732‑M1/103‑150 (MQ=255) ttcggcgatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccaccGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGt > 1:3429561‑M1/103‑150 (MQ=255) gatgctccggctggcttggcacaactggtgatcggcggccgtgaagctggcgaagccatggtcgacgacccgcgcgtaccgctggtcagcgccacgGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCt > 2:4318234‑M1/97‑150 (MQ=255) gaACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCt < 1:3479997/150‑1 (MQ=255) aaCAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTg > 2:2977522/1‑150 (MQ=255) aCAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCTGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCTTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGa < 2:71246/150‑1 (MQ=255) cAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGAc < 1:2318593/150‑1 (MQ=255) ggATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCa < 2:3073788/150‑1 (MQ=255) gATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAg > 2:498425/1‑150 (MQ=255) gATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAg < 2:2293091/150‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGc < 1:397134/150‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGc < 1:2318073/150‑1 (MQ=255) aTGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGc < 1:2084842/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCg < 2:238254/150‑1 (MQ=255) tGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCg < 1:187000/150‑1 (MQ=255) cgcgCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGtc > 2:2722942/1‑149 (MQ=255) cgcACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTAcg > 2:2258229/1‑150 (MQ=255) 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cacccgcatgggtcgcgaagtcggcccacgcgttgctgccGGTGGCGCTGAc < 1:287137‑M2/12‑1 (MQ=255) acccgcatgggtcgcgaagtcggcccacgcgggtgctgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCa > 1:1030084‑M2/41‑150 (MQ=255) cccgcatgggtcgcgaagtcggcccacgcgggtgctgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAg > 1:4175326‑M2/40‑150 (MQ=255) aCGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAgg < 1:1852790/150‑1 (MQ=255) gCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAATCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTc > 1:1231823/1‑150 (MQ=255) gCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCGGGGCTTTTTc < 2:3294923/150‑1 (MQ=255) gCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTc > 1:3508918/1‑150 (MQ=255) ccGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCg > 1:3071147/1‑150 (MQ=255) ccGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCg > 2:4089126/1‑150 (MQ=255) gACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGaa < 1:2440480/150‑1 (MQ=255) ttCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGaacaa > 2:357119/1‑150 (MQ=255) ttCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGaacaa > 2:3655461/1‑150 (MQ=255) tCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGaacaac > 1:83753/1‑150 (MQ=255) gcgACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGaacaa > 2:1856455/1‑147 (MQ=255) gcgACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTGTTTCGAACAACGc > 2:111537/1‑150 (MQ=255) gACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTCCGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCt > 1:4378675/1‑150 (MQ=255) gACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCt > 2:1624529/1‑150 (MQ=255) cccATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTgg < 2:3556781/150‑1 (MQ=255) ccATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGc > 2:2196033/1‑150 (MQ=255) cATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCa < 1:3593568/150‑1 (MQ=255) cATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCa > 1:4300203/1‑150 (MQ=255) aTGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTGTCGAACAACGCCTGGCAg > 2:2740625/1‑150 (MQ=255) gggTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCa < 1:3335446/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAg > 1:4171886/1‑150 (MQ=255) ctgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCCTGccaggcgt < 2:2397706‑M2/145‑4 (MQ=255) ctgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAGGGCg < 1:4508893‑M2/145‑1 (MQ=255) ctgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAGGGCg < 2:1743130‑M2/145‑1 (MQ=255) tgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAGGGCgg > 1:3950893‑M2/5‑150 (MQ=255) tgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAGGGCgg > 1:2831417‑M2/5‑150 (MQ=255) tgccGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAGGGCgg > 1:1675853‑M2/5‑150 (MQ=255) | ACAGCCGAGAACAGGATGCCGCGCACGGCCAGGTCCAGGTCGGCGCTCGGGGCCAGGATCATGGCGTTGTTGCCGCCCAGTTCCAGGATGCTGCGGCCGAAGCGGGCAGCA‑ACGCGTGGGCCGACTTCGCGACCCATGCGGGTGCTGCCGGTGGCGCTGACCAGCGGTACGCGCGGGTCGTCGACCATGGCTTCGCCAGCTTCACGGCCGCCGATCACCAGTTGTGCCAAGCCAGCCGGAGCATCGCCGAAGGCTTTCAGGGCTTTTTCGAACAACGCCTGGCAGGCCAGGGCGG > NC_002947/6005079‑6005373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |