| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1431721 | 187 (0.950) | 15 (0.080) | 7/264 | NT | 7.1% | coding (158/336 nt) | PP_1253 | ArsR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 1431746 | 211 (1.120) | coding (133/336 nt) | PP_1253 | ArsR family transcriptional regulator | |||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
CTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGTTCGATTATGATC > NC_002947/1431597‑1431893 | ctcGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAg < 2:2932815/150‑1 (MQ=255) cTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtgg > 1:4150528‑M2/1‑146 (MQ=255) aCGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACAGTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtggcg > 2:3789014‑M2/1‑144 (MQ=255) 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cATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAg < 2:3069853/150‑1 (MQ=255) atatGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAgg > 2:3797212/1‑150 (MQ=255) atatGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAgg > 1:2191706/1‑150 (MQ=255) tGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGgcgc < 1:3006058/150‑1 (MQ=255) aGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACggg < 2:1299536/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) ccACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCa < 1:4188167/150‑1 (MQ=255) cacaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtgtggcgagctggatggaggtcggccgaagtcgagcatgtcccaccacttccgtgtgttgcgtgatgcagggctggtgcaaacccgcaatgtggggactacccatatgaattcgctgcgta < 2:826509‑M2/150‑123 (MQ=255) acaGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCAtt > 2:2871975/1‑150 (MQ=255) caGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGgtgtggcgagctggatggaggtcggccgaagtcgagcatgtcccaccacttccgtgtgttgcgtgatgcagggctggtgcaaacccgcaatgtggggactacccatatgaattcgctgcgtagc < 2:792738‑M2/150‑125 (MQ=255) cTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAAtt < 1:4043276/150‑1 (MQ=255) 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ccTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCa > 2:2635886/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCa > 2:931253/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCa > 2:538121/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCAt > 2:4256713/1‑150 (MQ=255) ggCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGt < 1:1463344/150‑1 (MQ=255) gCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGtt > 2:1914127/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGTTCGa < 2:4295080/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGTTCGa < 2:4238143/150‑1 (MQ=255) gtccAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGTCGTTCTAGAATGAGGTCGTCTGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGTTCGATTATg < 2:3464165/148‑1 (MQ=255) ggCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGTTCGATTATg < 2:3399228/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGTTCGATTATGAt > 2:3089621/1‑150 (MQ=255) | CTCGCTACGCAGCGAATTCATATGGGTAGTCCCCACATTGCGGGTTTGCACCAGCCCTGCATCACGCAACACACGGAAGTGGTGGGACATGCTCGACTTCGGCCGACCTCCATCCAGCTCGCCACAGCTGGCCTCGGCCACGCCGGCCAGGTGGCGGACGATTTCCAGGCGCACGGGGTCGCTGAGCGCATAGAGCAGGCGTTCAAGAATGAGGTCGTCGGGGTTGGGATGTTTATAGGCTCGCATGGTTGACATGATAACGGGGGTTTCATTAATTGCCATAGTTCGATTATGATC > NC_002947/1431597‑1431893 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |