New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 356668 = | 307 (1.110) | 15 (0.080) +CAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCC |
6/180 | NT | 8.7% | coding (10/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
? | NC_002947 | = 1126662 | 176 (0.640) | intergenic (‑111/+39) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase |
GGTGTGGGAGCTGGAGGGCCCGACACCGATCTTGAACAGGTCGAACACGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/356718‑356668 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC < NC_002947/1126662‑1126602 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| cGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTC < 1:2550234/149‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 2:445966/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:4776963/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:4777039/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:7623262/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:7623267/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:7623574/150‑1 GTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG < 1:2989797/150‑1 GTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG < 1:9093896/150‑1 GTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG < 1:8163253/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:6290716/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCGCCGCATTCGCGG < 2:214844/150‑1 CTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC < 2:3307373/150‑1 GAAGACGCCCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:3761050/1‑112 GAAGACGCCCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:3761050/112‑1 TCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTA > 1:5054330/1‑87 TCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTA < 2:5054330/87‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| GGTGTGGGAGCTGGAGGGCCCGACACCGATCTTGAACAGGTCGAACACGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/356718‑356668 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGGGTAAAC < NC_002947/1126662‑1126602 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |