| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 356668 = | 307 (1.110) | 15 (0.080) +CAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCC |
6/180 | NT | 8.7% | coding (10/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
| ? | NC_002947 | = 1126662 | 176 (0.640) | intergenic (‑111/+39) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
Only 100 of 351 total aligned reads displayed.
GTACGTCGGTTGCAGACGGCGAGGTGGGCGGTAAAAGCCCGATGATGCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCG > NC_002947/356519‑356817 | gTACGTCGGTTGCAGACGGCGAGGTGGGCGGTAAAAGCCCGATGATGCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCa < 1:2718880/150‑1 (MQ=255)gTACGTCGGTTGCAGACGGCGAGGTGGGCGGTAAAAGCCCGATGATGCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCa < 2:6599239/150‑1 (MQ=255) aCGTCGGTTGCAGACGGCGAGGTGGGCGGTAAAAGCCCGATGATGCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGc < 2:8003540/150‑1 (MQ=255) 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cATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAAc < 2:4951834/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAAcgcg < 1:2162524/150‑1 (MQ=255) ggCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAAcgcg < 1:4946504/150‑1 (MQ=255) cgcAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGa < 1:1376903/150‑1 (MQ=255) agagACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTc < 1:4398139/58‑1 (MQ=255) agagACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCt < 2:4760276/150‑1 (MQ=255) agagACAAGCCCAGCAAGAGGAGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGGTCGACCTGATCAACATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGGTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGAGAGCt > 2:4233139/1‑150 (MQ=255) gagaCAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTg < 1:1695/150‑1 (MQ=255) gaCATGCCCATCAAGAGTTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGa < 1:8358643/150‑1 (MQ=255) gaCAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGa < 1:6261821/150‑1 (MQ=255) aCAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAg > 1:1952890/1‑150 (MQ=255) aaGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCg > 2:7729040/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTa > 1:6323205/1‑150 (MQ=255) gagGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGa < 1:539409/150‑1 (MQ=255) gagGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGa < 1:451289/150‑1 (MQ=255) gagGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGa < 1:5648664/150‑1 (MQ=255) gATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGaa < 1:8661241/150‑1 (MQ=255) gATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGaa < 1:5798849/150‑1 (MQ=255) ttCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGt > 2:5246869/1‑150 (MQ=255) gACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTgcg > 2:492694/1‑150 (MQ=255) aCAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTgcgc < 2:6357359/150‑1 (MQ=255) ggCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTa < 1:3871205/150‑1 (MQ=255) ggCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTa < 1:3537078/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCt < 1:8864659/150‑1 (MQ=255) cAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTc > 2:4064545/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTc > 2:4458311/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTc > 1:3632974/1‑150 (MQ=255) | GTACGTCGGTTGCAGACGGCGAGGTGGGCGGTAAAAGCCCGATGATGCTGGCATTCAAGGCGGCCCGCTGTTTGAGCCTAGCAGCTACCCCGCCCTGCGCATGGCGCGCAGAGACAAGCCCAGCAAGAGGTGATTCGACAATGGCCATCAGCGTGTTCGACCTGTTCAAGATCGGTGTCGGGCCCTCCAGCTCCCACACCGTCGGCCCCATGCGTGCTGGCGCCCTGTTCGTTCAGGGCCTGCGCGAACGCGGTGAGCTGGAGCGTGTAAAACGGATCGAAGTGCGCCTGTATGGCTCG > NC_002947/356519‑356817 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |