| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 356668 = | 307 (1.110) | 15 (0.080) +CAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCC |
6/180 | NT | 8.7% | coding (10/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
| ? | NC_002947 | = 1126662 | 176 (0.640) | intergenic (‑111/+39) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
ATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCT > NC_002947/1126514‑1126811 | tgccgatCTTGAACAGGTCGACGAGGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 2:7563234/150‑1 (MQ=255) tgccgatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAcaca < 2:8074851/150‑1 (MQ=255) gatCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGCGGTATAGCCACCATAGCAATCGCGGGTAAACCCGCTCCAACACAGAGc > 2:6597864/1‑150 (MQ=255) ttGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGGTTAACCGCGAATGCGGAGGTATATCCACCAACGCATTCGCGGGTAAAACCGCGCCAACACAGAGCCCGc > 2:5602740/1‑150 (MQ=255) gAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGGTTAACCCCGAAAGCGGAGGTATATCCACCAACGCAATCGCGGGTAAAAACCCACCAAAACAGAGCCCCCCa > 1:2982611/1‑150 (MQ=255) ggTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCaa < 2:4306289/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTTACCCCCAAAGCGGAGGTATAGCCACCAACGCAAAAGCCGGTAAAACCCCACCAAAACACAGCCCCCCACCCaac > 2:4083047/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGGTTTACCGCGAAAGAGGAGGTATATACACCATCCCAATCGCGGGTAAACCCGCGCCGACACCGAGCCCGCCAccccac > 2:8480413/1‑147 (MQ=255) aGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCTGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAgg < 2:1167709/150‑1 (MQ=255) gACGCTCTGTGACTTGTGGCCCTCCTGCCTGGTTGTTGGGGGTACATTGAGCCCTGTAGGCGGGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGt < 1:4756381/150‑1 (MQ=38) cTCCGTGACATGTGGCCCTCCTCCCAGGTTGTGGGGTGGACCTGGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGTTATCGCCACCATCGAATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCg < 1:6342547/150‑1 (MQ=37) cTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCg < 2:3863958/150‑1 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTAACCCCCCAAGCGGCGGTATATCCACCAAACCAAACGCCGGTAAACCCCCACCAACACACAGCCCCCCCCCCCAGCCACGTGGCgg > 2:7046055/1‑150 (MQ=255) tCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGGTTAACCCCGCATTCGGAGGTATAGCCACCAAAGCAATACCGGGTAAACCCCCTCCAAAAAAAAGCCCCCCCACCAAGCCACGTGGCgg > 2:2428103/1‑150 (MQ=255) ccgTGACTTGTGGACCCCCGGCCTGGTTGTTGGGTGCACATTGAGCCCTGTCGGCGGGGTTTTACCCGCTACTGCGGTGGTACAGCCACAATCGCTTCCGGGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCggg < 1:855222/148‑1 (MQ=255) ccgTGACATGTGGACCCCCGGCCCGGTTGTGGGGTGGCCCTGCAGCCCTGCCGGCGCGGGTTCACCCGCGATTGCGGCGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCggg < 1:3990509/148‑1 (MQ=255) tGACATGGGGACCGCCGGCCTGGTTGTGGGGTGGACATTTCGCCCTGTCGGCGCGGTTTTACCCGCGAATGGGGAGTTATAGCCACCATCGCATGCGCGGGTAACCCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAg < 1:8811022/150‑1 (MQ=255) aCATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTAAAACCGAAAGCGGGGGTTTAGCCACCCACGCAGTAGCGGGGCAAACCCCGCCCACCCAGACCCCCCCCCCCAAACCCCCGGGCgggggggg > 1:7332927/1‑150 (MQ=255) 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ccAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGa < 1:6033154/150‑1 (MQ=255) ccAGGTTGTGGGGTGGACTTTGTGCCGTGTCGGCGGGGGTTTACCCGCTAAGGCGGCGTTATAGCCACCATCGAATTGGCGGTTAACCCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGa < 1:7723392/150‑1 (MQ=255) ggTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGACGCCTGATAg < 2:6756949/150‑1 (MQ=255) gttgttGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGGTTTACCGCCCAAGCGGAGGTATAGGCCCCCAAGCCGTAGCCGGTAAAACCCCACCGAAACACAGCCCCCCACCCCAACCCCGTGGCGGGGGGGGGTATCAGGGGGCCGGAtgtc > 2:1025667/1‑147 (MQ=255) ttgtggGGGGGACCTGGCGCCCTGTCGGCGCGGGTTTACCCGCGACTGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGct < 2:3127224/150‑1 (MQ=38) 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acATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggc < 2:3048579/149‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggcgg < 2:3639395/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACcggagg > 1:2660526/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCggcggc > 2:5090934/1‑150 (MQ=255) ggagcgGGTTTACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCggcggc > 1:6761063/4‑150 (MQ=255) gagcgGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGcc > 1:6930720/3‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCGCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAg > 2:1522597/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTa < 1:5192820/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTa < 1:847704/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACt < 1:1926352/150‑1 (MQ=255) 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tCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCCGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccac > 2:1071177/1‑150 (MQ=255) cTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccacca > 1:8018458/1‑150 (MQ=255) cTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccacca < 1:5822840/150‑1 (MQ=255) cTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTccacca < 2:2982611/150‑1 (MQ=255) tACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAg > 2:4663909/1‑150 (MQ=255) 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ATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGAGGTATAGCCACCATCGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGAGCCCGCCACCCAAGCCAGGTGGCGGGGAGGGCTATCAGGCGTCCTGATAGCTCTCGATCGACGGGCAGGCGCACACCAGGTTGCGGTCGCCGAACACGTTGTCGACCCGGCCGACCGGCGGCCAGTACTTGCCTTCCACCAGGCT > NC_002947/1126514‑1126811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |