| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2834638 = | 256 (0.930) | 12 (0.050) | 10/262 | NT | 5.1% | intergenic (‑21/+46) | PP_2485/PP_2486 | hypothetical protein/Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 2834686 = | 205 (0.780) | coding (1123/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase | |||||
ACCTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2834793‑2834638‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTC > NC_002947/2834686‑2834833 ACCTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAATTCAGGGGCGTGGC‑‑TCA > 2:8307124/1‑150ACCTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCA > 2:8307122/1‑150 CCTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAG > 2:7476806/1‑150 CCTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAG > 2:7476809/1‑150 CTGCCCGCTCGTATCGCCAACATCTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGC < 1:1725245/150‑1 CTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGC > 1:1909833/1‑150 CTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGC > 1:1910020/1‑150 TGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGACGTGGC‑‑TCAGCG > 2:7854939/1‑150 CCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTACCCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTT < 1:6727189/150‑1 CCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTT < 1:2085132/150‑1 CCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTACACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT < 1:1957417/150‑1 CCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT > 1:7989971/1‑150 CCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT < 1:398343/150‑1 CCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT < 1:2400069/150‑1 CCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT > 2:7670542/1‑150 CCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT > 2:7670664/1‑150 CGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTTCACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTA < 2:3804798/150‑1 CGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTA < 2:9026630/150‑1 GCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAA < 1:2022732/150‑1 TCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCACAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTGGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCC < 1:412210/84‑1 CTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGC > 1:2001999/1‑150 TAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCA > 1:829233/1‑131 TAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCA < 2:829233/131‑1 TCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGCTTTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAG > 1:6738560/1‑150 TCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGCTTTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATAGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAG > 2:1837343/1‑150 CACGCCCCATAACTCAGGGGCGAGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGG > 1:2429263/1‑150 ACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTA > 1:6636381/1‑77 ACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTA < 2:6636381/77‑1 ACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGG < 2:2251144/146‑1 ACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGG > 1:2251144/1‑146 AGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATC < 1:1884430/150‑1 AGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATC > 1:2223090/1‑150 GCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGACAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCTGGGTTCGCAATGTAGGGGCGACCAACAGCGATCA < 2:7574580/150‑1 CGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAG < 2:2896236/150‑1 CGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAG < 2:2896087/150‑1 CGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAG < 1:8112101/150‑1 CGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAG < 1:8112039/150‑1 TTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGT > 2:730449/1‑150 TTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGT > 2:730853/1‑150 TTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGT < 2:2958760/150‑1 TTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTC < 1:8948564/150‑1 TTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTC > 1:142872/1‑150 ACCTGCCCGCTCGTATCGCCAACAACTGGCCGCTTAACCCAGTTGATCCAAGCAGCATGTACGGCGGTACCGATAAGGGCTACACCGACTACCCGACTTACAAATCCTAAACGCTCAATGCCACGCCCCATAACTCAGGGGCGTGGC‑‑TCAGCGTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2834793‑2834638‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTC > NC_002947/2834686‑2834833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |