| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2834638 = | 256 (0.930) | 12 (0.050) | 10/262 | NT | 5.1% | intergenic (‑21/+46) | PP_2485/PP_2486 | hypothetical protein/Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 2834686 = | 205 (0.780) | coding (1123/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase | |||||
Only 100 of 300 total aligned reads displayed.
TAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGG > NC_002947/2834489‑2834787 | acctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaa > 2:730449‑M1/148‑150 (MQ=255) acctgatcgcttttggtcgccccttcattgcgaaccccgacctgcccgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaa < 2:2958760‑M1/3‑1 (MQ=255) tgatcgctgttggtcgcccctacattgcgaacccagacctgcccgctcgtatcgccaacaactgtccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctAAACGc < 2:7574580‑M1/6‑1 (MQ=255) 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cGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTgg < 1:1294859/150‑1 (MQ=255) cGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTgg > 2:5773555/1‑150 (MQ=255) cGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTgg < 1:7416907/150‑1 (MQ=255) gTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAg > 2:5895759/1‑150 (MQ=255) aTGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGc < 2:2003041/150‑1 (MQ=255) cTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAg > 2:6497782/1‑150 (MQ=255) tAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAgtt < 1:3295510/150‑1 (MQ=255) tAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAgtt < 1:3390359/150‑1 (MQ=255) tCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAgtt < 1:5778063/142‑1 (MQ=255) tCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGa > 2:320190/1‑150 (MQ=255) 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AAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCgg > 2:7670664‑M1/1‑150 (MQ=255) AAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCgg < 1:398343‑M1/150‑1 (MQ=255) | TAGCATGCTCGGTGTATCACCTTCGAAAGCCTCTAGGGGAAAGAACAGCCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGA‑‑GCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGG > NC_002947/2834489‑2834787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |