| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 2834638 = | 256 (0.930) | 12 (0.050) | 10/262 | NT | 5.1% | intergenic (‑21/+46) | PP_2485/PP_2486 | hypothetical protein/Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 2834686 = | 205 (0.780) | coding (1123/1125 nt) | PP_2486 | Oye family NADH‑dependent flavin oxidoreductase | |||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
CCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGC > NC_002947/2834537‑2834835 | cgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggcttcaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatgccacgccccataactcaggggcgtggctcagcgttta < 2:3804798‑M2/1‑1 (MQ=255)cgctcgtatcgccaacaactggccgcttaacccagttgatccaagcagcatgtacggcggtaccgataagggctacaccgactacccgacttacaaatcctaaacgctcaatgccacgccccataactcaggggcgtggctcagcgttta < 2:9026630‑M2/1‑1 (MQ=255)cccAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa < 1:102756/150‑1 (MQ=255)cccAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTa < 2:4355082/150‑1 (MQ=255) ccAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAg > 1:2012025/1‑150 (MQ=255) cAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAgg > 1:7168739/1‑150 (MQ=255) aGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCGATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGAt < 2:5562651/150‑1 (MQ=255) gCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGAttt < 2:2456545/150‑1 (MQ=255) gCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGAttt < 1:7888810/150‑1 (MQ=255) gCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGAttt < 1:7822078/150‑1 (MQ=255) ttAGATGACCCTGCCTGATGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGTTCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTTACTTCCTCGGTCAGCAATCGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTTTGAGTTTAGGAttttt < 1:8747460/150‑3 (MQ=255) aGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTaa < 1:2613234/150‑1 (MQ=255) gACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCg < 2:3719277/150‑1 (MQ=255) 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CTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAgg > 2:7476809‑M1/1‑150 (MQ=255) TGAGCCACGCCCCTGAATTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGt > 2:8307124‑M1/1‑150 (MQ=255) ccACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCggg > 1:3499967/1‑150 (MQ=255) cACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCgggg > 2:5232595/1‑150 (MQ=255) cACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCgggg > 1:274446/1‑150 (MQ=255) cACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGATGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCgtgg < 2:1725245/150‑1 (MQ=255) acgccccataactcaggggcgtggcattgagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTa > 1:6636381‑M2/37‑77 (MQ=255) acgccccataactcaggggcgtggcattgagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTa < 2:6636381‑M2/41‑1 (MQ=255) aCGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGt > 1:4063423/1‑150 (MQ=255) gCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTc < 1:3809100/150‑1 (MQ=255) acgccccataactcaggggcgtggctcagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCggg > 1:2251144‑M2/35‑146 (MQ=255) acgccccataactcaggggcgtggctcagcgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCggg < 2:2251144‑M2/112‑1 (MQ=255) cTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCaa > 1:1167015/1‑150 (MQ=255) cTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCaa > 1:6393980/1‑150 (MQ=255) cTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCaa < 2:5610386/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAgtt < 2:6465859/108‑1 (MQ=255) aTGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAggg < 1:916767/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAggg < 1:5317761/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAggg < 2:6802867/150‑1 (MQ=255) gggCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCg > 2:8667201/1‑150 (MQ=255) aTTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGc < 1:6995642/150‑1 (MQ=255) ttGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCa > 1:5022932/1‑115 (MQ=255) gAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGAt > 1:1538442/1‑150 (MQ=255) cgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAg < 2:2896087‑M2/145‑1 (MQ=255) cgtttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAg < 1:8112039‑M2/145‑1 (MQ=255) tttAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGt > 2:730449‑M2/4‑150 (MQ=255) | CCCAAGGCTTAGATGACCCTGCCTGAAGGTTCGTTTGAATCCCCTATGCTCTTGGTAGGGGATCGTGCTCGGTTGGTACATGCTTAACTTCCTCGGTCAGCAAACGCTGAGCCACGCCCCTGAGTTATGGGGCGTGGCATTGAGCGTTTAGGATTTGTAAGTCGGGTAGTCGGTGTAGCCCTTATCGGTACCGCCGTACATGCTGCTTGGATCAACTGGGTTAAGCGGCCAGTTGTTGGCGATACGAGCGGGCAGGTCGGGGTTCGCAATGAAGGGGCGACCAAAAGCGATCAGGTCGC > NC_002947/2834537‑2834835 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |