New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5818832 = | 44 (0.270) | 18 (0.130) | 10/232 | NT | 29.2% | intergenic (+40/+89) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
? | NC_002947 | 5818895 = | 49 (0.340) | intergenic (+103/+26) | PP_5092/pilT | NLP/P60 protein/twitching motility protein |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
AGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGAAC > NC_002947/5818746‑5819043 | aGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgcgc < 2:3048279/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGCCTAAAGAGCAGCTGCTGAGTCTGGCAAAGCTTTAAGCTTATGGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGGGGGCACGCCCGCTCCCACTGGTAGCGGGTGGCTCTCGGGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGGGGGCGCGccc < 1:1438722/150‑1 (MQ=255) ggctgcCGAAAGAGCCGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGCGCGGGCGCGCCcgc < 2:1834416/149‑1 (MQ=255) gcCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaaa > 2:3989073/1‑150 (MQ=255) ggcggctgagggagcgcgggttgagccacggcttgtagtcccggcaacggccccttcgggggcaCGCCCGCTCCCACCGGTTGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg > 1:315948‑M1/65‑150 (MQ=255) cTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGtac < 2:2023365/150‑1 (MQ=255) gAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCACGCGCGCCGCTCACCTACCGGTGGGCGCGGGCCCGCCCGCGACAGGGCCTGTGCAGGtacag > 2:3435627/1‑148 (MQ=255) tCTGGCCTAGCGTTAAGCTGATGGGCGCTAGCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACTGGTCGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACaa < 1:2902828/150‑1 (MQ=38) tCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGTAGCGCGGCGCACGCGCGCGCAGCACACCGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCATTGCAGGTACTaaaa > 2:1176458/1‑150 (MQ=38) tCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACaa < 2:3732982/150‑1 (MQ=255) tCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACaa < 1:4878742/150‑1 (MQ=255) ccAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCtt < 2:5217521/150‑1 (MQ=255) cAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCGTTGCAGGTACTACAAGCCttt > 2:4034887/1‑150 (MQ=255) aaGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGGCGCTCTCGCGCGCAGCTCACCTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACAACACGCCTTTg > 2:2141499/1‑150 (MQ=255) aGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCACACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGa < 1:356592/150‑1 (MQ=255) tAAGCGGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTCCGCGGGCCCGCCCGCGCCCCCTGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATCCCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAAc < 1:4590653/150‑1 (MQ=255) aaGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCCCCCCCGCGCCCACCCGTAGCGCGTCGCGCGCGCGCGCCGCTCACCAACCGGGGGGGGCGGGCGCGCCCGCGCAAGGGCCTGTGGGGGTACAACAAGCCTTTGATCAAcc > 2:4590653/1‑150 (MQ=255) aaGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAAcc < 1:5432566/150‑1 (MQ=255) tGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACCCCCGCTCCCACAGGTAGCCCGTCGCTCTCGCGCGCAGATAACCTAACTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAACGGCCTTTTCCTGTACTACAACCCAGTGAACAACCCACg > 2:2698499/1‑150 (MQ=37) ctgcaaaggccctttcgcgggcgcgcccgctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgcaaccggtgggagcgggcgTGCCCCCGAAGGGGCCGTTGCCGGGACTACAAGCCGTGGCTCAACCCGCGCTCCCTCAgccgcc > 1:315948‑M2/87‑150 (MQ=255) ccGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAAc < 1:4034887/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACACGTAGCGCGTCGCTCGCGCGCCCCGCGCACATACCGGGGGGCGCGGGCGCGCCCGCCAAAGGGCCGTTGCCGGGACTACAAGCCGTTGTTCAACCCGCGCGCCCTCAGCCACCGCAACg > 2:1179131/1‑150 (MQ=255) gCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGGGCGGGCGCGCCCCCGAAAGGGCCATTGCAGGTACTACAACCCGTTGATCAAACCGCGCCCCCACCGCCGCCGCACCGcc > 2:5193370/1‑150 (MQ=37) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAg > 2:3481361/1‑85 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAg < 1:3481361/85‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACACGTATCGCGTCGCTCACGCGCGCAGCGCACAAAACGGTGGGGGCGGGCGCCCCCGCCAAAGGGCCGTTTCAGGGACAACAACCCGTTTATAAACCCACGCTCCCAAACCCACCGCAACGcccccgc > 1:4374145/1‑148 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCATTGTTCAACCCTCGCTCCCTCAGCCGCCGCAACGCCCCCGccct > 1:4371719/1‑148 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTc < 2:2343669/150‑1 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCa < 1:3463920/150‑1 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCa < 2:4574248/150‑1 (MQ=255) cACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCa < 1:5235491/150‑1 (MQ=255) gctcccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgTGCCCGCGAAGGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATccc > 2:4086801‑M2/59‑150 (MQ=255) GCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATccc < 1:832024‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCt < 2:4393134‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCACCGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTc > 2:2405021‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTc > 2:2405125‑M1/1‑150 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgTGCCCGCGAAGGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCAGCGTCAGCATCCCCTcc > 2:4469493‑M2/55‑150 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc > 2:4116384‑M2/55‑150 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc > 1:4925895‑M2/55‑150 (MQ=255) ccacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCGcc > 1:3968134‑M2/55‑150 (MQ=255) CCACTGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc > 1:3456577‑M1/1‑150 (MQ=255) CCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGTGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc < 1:3545731‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc < 2:4145320‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCGATGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTcc < 2:3088728‑M1/150‑1 (MQ=255) cacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgTGCCCGCGAAGGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg > 2:3055536‑M2/54‑150 (MQ=255) cacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgTGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCtt > 1:3306795‑M2/54‑90 (MQ=255) cacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgTGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCtt < 2:3306795‑M2/37‑1 (MQ=255) cacaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg > 1:1722149‑M2/54‑150 (MQ=255) CACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccg < 2:4451147‑M1/150‑1 (MQ=255) acaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgTGCCCGCGAAGGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCAccgc > 1:2549342‑M2/53‑150 (MQ=255) acaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgc > 2:5354043‑M2/53‑150 (MQ=255) acaggtatgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgc > 2:5354088‑M2/53‑150 (MQ=255) ACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgc < 1:2859146‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTATGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTccgcc > 2:1992243‑M1/1‑150 (MQ=255) AGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGc < 1:3286894‑M1/137‑1 (MQ=255) AGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGc > 2:3286894‑M1/1‑137 (MQ=255) GTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCgccgcc < 2:4663399‑M1/150‑1 (MQ=255) gAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGccc > 1:4047364‑M1/2‑150 (MQ=255) atgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGccgcccc > 2:2047991‑M2/47‑150 (MQ=255) tgtgagctgcgcgcgagagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCACCGccgccccg > 1:1654757‑M2/46‑150 (MQ=255) cgcgTCGCTCTCGCGCGCCGCTCCCATCCCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGccgccccgc < 1:1409645/150‑1 (MQ=255) cgcgTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAAc < 1:4606449/89‑1 (MQ=255) cgcgTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAAc > 2:4606449/1‑89 (MQ=255) gTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCt > 2:815824/1‑150 (MQ=255) ctctCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGGACGACAAGCCGTTGATCAACCCTCGCTCCCTCCGCCTCCGCAACGCCCCCTCCAACGGCAGCAACCCCTCCCCCCCCCCGCCCGGcca > 1:2118174/1‑148 (MQ=255) tctcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATc > 2:2454664/1‑150 (MQ=255) tctcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCAACGTCAGCATCCCCACCCCCGCCCCGCCCGGCaac > 1:4899285/1‑148 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCa > 2:2648481/1‑56 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCa < 1:2648481/56‑1 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCAc > 1:3546158/1‑150 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCAACGTCAGCATCCCCACCGCCGCCCCCCCCAGCAacac > 1:2496672/1‑150 (MQ=255) tcGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCACCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCCCCCAGCAacac > 1:1059138/1‑150 (MQ=255) cgcgcgCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACt < 1:1179131/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATc < 1:1425384/122‑1 (MQ=255) gcgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATc > 2:1425384/1‑122 (MQ=255) cgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGa < 2:1231109/150‑1 (MQ=255) cgcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGa < 1:1213618/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGTGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 1:1176458/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 2:3466220/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 2:3687362/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 2:4169491/150‑1 (MQ=255) agagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgTGCCCGCGAAGGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 1:3055536‑M2/120‑1 (MQ=255) agagcgacgcgctacctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGaa < 1:972347‑M2/120‑1 (MQ=255) cAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGAc < 2:5321519/150‑1 (MQ=255) tCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACt > 2:947017/1‑150 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTgc < 1:1703554/150‑1 (MQ=255) acaTACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCCCCCCCCCCAGCAACACTGAAGACCACAgc > 1:3461446/1‑150 (MQ=255) acctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCGCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACAGAAGACAACAGCgccc > 1:4370767‑M2/18‑149 (MQ=255) ctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCCCCCTGCATCACAGAAGACAACAGCGCCCAc > 1:4804104‑M2/16‑150 (MQ=255) ctgtgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCACCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACAGCGCCAAc > 1:4360777‑M2/16‑150 (MQ=255) tgggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGc > 2:4734840‑M2/13‑150 (MQ=255) ctttcgcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACCACTGCGCCAACCGc > 2:3363222‑M2/13‑150 (MQ=255) gggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGcc < 1:1135351‑M2/139‑1 (MQ=255) ggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGccc < 1:3989073‑M2/140‑1 (MQ=255) ggagcgggcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACAGCGCCAACCGccc > 2:4271895‑M2/11‑150 (MQ=255) gcgTGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGa > 1:2682405‑M2/4‑150 (MQ=255) gcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGccc < 2:1597582‑M2/140‑1 (MQ=255) gcgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGccc > 1:1597582‑M2/4‑143 (MQ=255) cgCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGaa < 1:4113643‑M2/148‑1 (MQ=255) gCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCAGCAACACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCCAAc > 1:4325995‑M2/2‑150 (MQ=255) | AGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAGGTACTACAAGCCTTTGATCAACCCTCGCTCCCTCAGCCTCCGCAACGCCCCCTCCATCGTCAGCATCCCCTCCGCCGCCCCGCCCTGCATCACTGAAGACAACTGCGCCAACCGCCCCTCCCGAAC > NC_002947/5818746‑5819043 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |