| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4164667 = | 34 (1.110) | 7 (0.250) | 3/122 | 2.7 | 21.7% | coding (1029/1845 nt) | btuB | vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter |
| ? | NC_000913 | 4164716 = | 19 (0.670) | coding (1078/1845 nt) | btuB | vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter | |||||
AAACAATGTCATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAACGTAATACCGGCATCTATCTGACCGGGCT > NC_000913/4164601‑4164732 | aaaCTATGTCATCGTTGGGCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGGCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGc < 2:377639/68‑1 (MQ=255) cgtcactgcgtgctgcgccttcaaaggtaaaatcgccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCg < 1:1127197‑M1/4‑1 (MQ=255) cgtcactgcgtgctgcgccttcaaaggtaaaatcgccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCg < 2:575338‑M1/4‑1 (MQ=255) gtcactgcgtgctgcgccttcaaaggtaaaatcgccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCgg > 1:575338‑M1/64‑68 (MQ=255) cAATGTCATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCgg > 1:1110444/1‑68 (MQ=255) cAATGTCATCGTTGGGCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCgg < 1:727721/68‑1 (MQ=255) aTGTCATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGt < 2:38803/68‑1 (MQ=255) gTCATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTAc > 2:406658/1‑68 (MQ=255) tCATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGACGGGTACa > 2:702202/1‑68 (MQ=255) gcATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACa < 2:163138/67‑1 (MQ=255) cATCGTTGGTCACGTTATTATTGGTGAGGTTGGCGACTTGCAGAAACAGACTACTACTCCGGGTACat < 2:604581/68‑2 (MQ=255) cATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAg < 1:249840/68‑1 (MQ=255) cATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAg < 2:285565/68‑1 (MQ=255) tCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGt < 2:532173/68‑1 (MQ=255) tCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGt < 1:834230/68‑1 (MQ=255) tCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGt < 2:2070/68‑1 (MQ=255) cGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGtt > 1:146790/1‑68 (MQ=255) ttGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTAt < 1:948157/68‑1 (MQ=255) ctgcgccttcaaaggtaaaatcgccgacttgttgcagcccggtcagatagctGCCGGGTACAGGTTAt < 1:93369‑M1/16‑1 (MQ=255) ctgcgccttcaaaggtaaaatcgccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCGGGTACAGGTTAt < 1:200678‑M1/16‑1 (MQ=255) ctgcgccttcaaaggtaaaatcgccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCGGGTACAGGTTAt < 1:94822‑M1/16‑1 (MQ=255) ggTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGTGTACAGGTTATGt < 1:541160/68‑1 (MQ=255) ggTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGt > 1:550036/1‑68 (MQ=255) gTCACGGTAGTATTGGTGCGGGCGGCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGtt < 1:295047/68‑1 (MQ=255) gtaTTTGTGCGGGTGTCGACTGTCAGAAACAGACTACGACGCCGTGTACAGGTTATGTTGAggatgga < 1:215834/68‑1 (MQ=255) gtaTTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAggatgga < 2:1110439/68‑1 (MQ=255) gtaTTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAggatgga < 1:679853/68‑1 (MQ=255) gtaTTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAggatgga < 2:417184/68‑1 (MQ=255) aTTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGata > 2:936239/1‑68 (MQ=255) tGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATg < 2:283380/68‑1 (MQ=255) tGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGCCGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATc > 1:582180/1‑68 (MQ=255) tGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGt > 2:236871/1‑46 (MQ=255) tGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGt < 1:236871/46‑1 (MQ=255) tGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATc > 2:849744/1‑68 (MQ=255) gggTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAAc < 1:284127/68‑1 (MQ=255) gggTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAAc < 2:403523/68‑1 (MQ=255) gccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAAc > 2:200678‑M1/31‑68 (MQ=255) gccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAAc > 2:850426‑M1/31‑68 (MQ=255) ccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAACg > 2:94822‑M1/30‑68 (MQ=255) ccgacttgttgcagcccggtcagatagatGCCGGGTACAGGGTATGTTGAGGATGGATATGATCAACg > 2:93369‑M1/30‑68 (MQ=255) aCTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAACGTAATAcc > 2:334644/1‑68 (MQ=255) cTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAACGTAATACCGGCATCTATCTGAcc > 2:952209/1‑68 (MQ=255) cgacgCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAACGTAATACCGGCATCTATCTGACCggg < 1:78870/68‑1 (MQ=255) acgCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAGCGTAATACCGGCATCTATCTGACCGGGCt > 2:1127192/1‑68 (MQ=255) GCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAAc < 1:621595‑M1/38‑1 (MQ=255) GCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAAc > 2:621595‑M1/1‑38 (MQ=255) | AAACAATGTCATCGTTGGTCACGGTAGTATTGGTGCGGGTGTCGACTGGCAGAAACAGACTACGACGCCGGGTACAGGTTATGTTGAGGATGGATATGATCAACGTAATACCGGCATCTATCTGACCGGGCT > NC_000913/4164601‑4164732 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |