New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 771005 = | 10 (0.310) | 77 (2.410) | 35/132 | 0.0 | 88.5% | intergenic (+394/‑453) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/771071‑771005 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < NC_000913/1050545‑1050484 CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAG > 2:557820/1‑68 TTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGG > 2:264146/1‑68 TTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGAGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGG > 1:299439/1‑68 TTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGT > 2:990340/1‑68 TTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGT > 2:876441/1‑68 TTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGT > 2:1098028/1‑68 TGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATG > 2:580774/1‑68 TGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGATATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTTAGGTAATG > 2:698159/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 2:335426/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA < 2:1173274/68‑1 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 1:1093975/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 1:450660/1‑68 GACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGA > 2:1074462/1‑68 ACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGAC < 2:765817/68‑1 CATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACT < 1:409251/68‑1 TATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAA < 1:1011750/68‑1 TATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAA < 1:576860/68‑1 TGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:17367/68‑1 TGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACT < 1:1042277/62‑1 TGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACT > 2:1042276/1‑62 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTa > 1:712963/1‑67 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 1:394966/1‑68 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 2:629435/1‑68 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 1:1030993/1‑68 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 1:60239/1‑68 GTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTAGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTT > 1:37894/1‑68 TTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTA < 2:419011/68‑1 TTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTA < 1:335426/68‑1 TTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTA < 1:557820/68‑1 AATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:879534/1‑68 AATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATAAAGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:1069555/1‑68 AATGTGTGAGTTAAAAGGCTGAAATTAATTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCAAAATTAATGAT > 2:1159286/1‑68 ATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCTATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 2:468941/1‑68 ATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATA > 1:943716/1‑68 aGTGAGAGTAATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGAAAAGAATACAACTTATTGATAG > 1:1016150/2‑68 TGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:1082453/1‑68 TGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:1189932/1‑68 GTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT < 1:599661/68‑1 GTGAGTTATAAGTCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 1:529005/68‑1 GAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 1:848886/68‑1 GAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:33904/68‑1 GAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:1030992/68‑1 AGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 2:492578/1‑68 AGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:29590/1‑68 AGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTT > 1:525227/1‑68 TTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 1:1074463/68‑1 ATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 1:264146/68‑1 AAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC > 1:460217/1‑68 AGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 2:49635/1‑68 AGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA > 1:397748/1‑68 GGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 2:25515/1‑68 GGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG > 1:684748/1‑68 GGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACT > 1:1192282/1‑39 GGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACT < 2:1192280/39‑1 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 2:1093974/68‑1 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA > 2:928574/1‑68 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 2:367711/68‑1 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA > 1:632562/1‑68 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA > 1:29073/1‑68 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA < 1:580774/68‑1 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGCTTTATGTTCAGA < 2:1040147/68‑1 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:415755/55‑1 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 2:415755/1‑55 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT > 2:333928/1‑44 GCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACT < 1:333928/44‑1 ATTAGTTTCGGTGGGCGATTAAGGTAATGACTCCAACGTATTGATAGTGTTTTATGATCAGATAATGC > 2:583739/1‑68 TTAGTTTCGGTTGGCTATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 2:299439/68‑1 TTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 2:1186502/68‑1 TTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCC < 1:645817/68‑1 TTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 1:380651/1‑54 TTAGTTTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT < 2:380651/54‑1 TTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG > 1:834995/1‑68 TTCGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGACCGATG > 1:172684/1‑68 CGGTTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 1:876441/68‑1 TTGGCAATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 2:632562/68‑1 ctATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCGCGATGACTTTGTCA > 2:1023068/3‑68 AATTAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 1:388735/68‑1 CTTTAGTGACATTTATGTTTAAAATGTGTGAGTTATAAGGCTGAAATTAGTTTCGGTTGGCAATTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/771071‑771005 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < NC_000913/1050545‑1050484 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |