| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 771005 = | 10 (0.310) | 77 (2.410) | 35/132 | 0.0 | 88.5% | intergenic (+394/‑453) | mngB/cydA | alpha‑mannosidase/cytochrome d terminal oxidase, subunit I |
| ? | NC_000913 | = 1050545 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
ATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGT > NC_000913/770939‑771072 | aTTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCttt < 2:290068/68‑1 (MQ=255) atgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAAtt < 1:388735‑M1/6‑1 (MQ=255) tgacaaagtcatcgcgcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTaatag > 2:1023068‑M1/62‑66 (MQ=255) ccAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTg > 2:817090/1‑68 (MQ=255) aaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCaa < 2:632562‑M1/11‑1 (MQ=255) gtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCg < 1:876441‑M1/14‑1 (MQ=255) catcggtcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGaa > 1:172684‑M1/53‑68 (MQ=255) catcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGaa > 1:834995‑M1/53‑68 (MQ=255) aaaaaGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAAc < 1:572779/68‑1 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTaa < 2:1186502‑M1/21‑1 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTaa < 1:645817‑M1/21‑1 (MQ=255) ggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATAGCCAACCGAAACTaa < 2:299439‑M1/21‑1 (MQ=255) gcattatctgatcataaaacactatcaatacgttggagtcattaccTTAATCGCCCACCGAAACTAAt > 2:583739‑M1/47‑68 (MQ=255) tctgaacataaagcactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGc < 2:1040147‑M1/28‑1 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGc < 2:1093974‑M1/28‑1 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGc < 1:580774‑M1/28‑1 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGc > 1:632562‑M1/41‑68 (MQ=255) tctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGc > 2:928574‑M1/41‑68 (MQ=255) 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ataaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATaa < 1:1074463‑M1/35‑1 (MQ=255) cGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACt < 2:209097/68‑1 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACt > 1:29590‑M1/32‑68 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACt > 1:525227‑M1/32‑68 (MQ=255) aaaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACt > 2:492578‑M1/32‑68 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTc < 2:33904‑M1/38‑1 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTc < 1:848886‑M1/38‑1 (MQ=255) aaacactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTc < 2:1030992‑M1/38‑1 (MQ=255) acactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGACTTATAACTcac < 1:529005‑M1/40‑1 (MQ=255) cactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGc < 1:415755‑M1/28‑1 (MQ=255) cactatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGc > 2:415755‑M1/28‑55 (MQ=255) actatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTcacac < 1:599661‑M1/42‑1 (MQ=255) ctatcaataagttgtattcttttccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATTACtctcact > 1:1016150‑M1/26‑67 (MQ=255) ctatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTcacaca > 1:1189932‑M1/26‑68 (MQ=255) ctatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTcacaca > 1:1082453‑M1/26‑68 (MQ=255) tttttGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACAt < 1:290469/68‑1 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACAt > 1:943716‑M1/25‑68 (MQ=255) tatcaataagttggagtcattaccTTAATAGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACAt > 2:468941‑M1/25‑68 (MQ=255) ttttTCTTCGTCTCTTTTTATCATTAATTGCCAACCGATACTACTTTCAGCCTTATTACTcacacaat < 2:1181493/68‑3 (MQ=255) atcattaattttgagtcattaccTTAATTGCCAACCGAAATTAATTTCAGCCTTTTAACTCACACAtt > 2:1159286‑M1/24‑68 (MQ=255) 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tCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTaa > 1:838866/1‑68 (MQ=255) accTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTaa > 2:990340‑M1/4‑68 (MQ=255) accTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTaa > 2:876441‑M1/4‑68 (MQ=255) accTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTaa > 2:1098028‑M1/4‑68 (MQ=255) ccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCTCACATTTTAAACATAAATGTCACTaaa > 1:299439‑M1/3‑68 (MQ=255) ccTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTaaa > 2:264146‑M1/3‑68 (MQ=255) cTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTaaa < 1:1058715/68‑1 (MQ=255) cTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAg > 2:557820‑M1/2‑68 (MQ=255) ttAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGt < 1:1186504/68‑1 (MQ=255) | ATTAGCCAGTGACCAAAAAAAGAATTAAGGTCAACCGTGCTGTTTTTGCTTCGTCTCTTTTTATCTTTAATTGCCAACCGAAACTAATTTCAGCCTTATAACTCACACATTTTAAACATAAATGTCACTAAAGT > NC_000913/770939‑771072 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |