| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,833 | Δ3 bp | 91.2% | intergenic (‑26/+155) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676832 | 8 (0.350) | 78 (3.370) | 57/268 | NT | 91.2% | intergenic (‑25/+158) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676836 = | 7 (0.300) | intergenic (‑29/+154) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
CGTCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676690‑3676832‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAAT > CP009273/3676836‑3676976 CGTCGCCATGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTT < 2:31631/145‑1 TCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGT > 1:63573/1‑145 CGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGCGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTA < 2:211642/145‑1 ctAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGACCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAG < 2:211601/143‑1 CCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGCGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTATTAAAACCACAGTTGTAAG > 2:375933/1‑145 CAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATCGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGG < 2:285909/145‑1 GGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGTATAGAAATTGCCAAGGGGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGATCTGAAAGTAAAGGCTTTCAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATG < 2:166155/145‑1 ttttcggTTGCTCGCCGATTTCAGGATAGAAATGGGCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGG < 1:137709/138‑1 TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGCAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGG < 1:238108/145‑1 TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGCATACCAATGGCTCTCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAAGGTGTCCCTTAGTAAAACCACAGTAGTAAGGTTATGGG > 2:410319/1‑145 TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTTTCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTGTTCATAGGGTGTCCTTTAGTCAAAGCACAGTTGCAAGtaaatggg > 2:220032/1‑137 TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTCACGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGCTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGG > 2:330404/1‑145 TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCAAAGATGTAAGGTTATGGG > 1:136134/1‑145 TTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCATTTAGTAAAAGCACAGGTGTCAGGTTATGGG > 1:401700/1‑145 TCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTACTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGT > 2:108771/1‑145 ATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAAGGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTAC < 1:143525/145‑1 TTGCTCGTCTATTTCAGGATAGAAATGGGCAAGGAGAATACCAGTGGCTATTGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCT < 2:61364/145‑1 TTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCT < 2:61358/145‑1 CTCTCCTTTTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCG < 2:128760/145‑1 CTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCG > 1:239475/1‑145 ATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAA < 1:67357/145‑1 TTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGGAGAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAAACACAGTTGTAAGGTTATGGGGAACCGGCGCACTTAAA > 2:399100/1‑145 cgtATAGAAATGGGCAAGGAGAATACCAATGGTTATTGCTGTCAGGACCTTAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAA < 2:52066/142‑1 AGGTTAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAA < 1:4690/145‑1 GATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAGTGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACA < 2:184804/145‑1 AATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGA > 2:94329/1‑145 GGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAA < 2:356111/145‑1 GCCAAGGAGAATACCGAGGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAAC > 1:19775/1‑145 CCAAGGAGAAGACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCGGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGGGTCCTGTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACA < 2:62138/145‑1 CAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAT > 2:316479/1‑145 CAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTAAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTATCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAT > 2:316502/1‑145 AAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGCCCAGAAAGTAACGGCTTGTAAACAGAGAGGTGTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGCACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACACCATC > 1:196298/1‑145 AGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCA < 2:398708/145‑1 GAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACA < 1:345054/145‑1 GAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCCGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACA > 1:249923/1‑145 GAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTGTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTGGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACACCATCACA > 1:11721/1‑145 AGAATACCAATGACTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAG < 1:109666/145‑1 AATAACAATGGCTAGCGGTGTCAGTACCGGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGCAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAA < 2:362131/145‑1 TGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCT > 1:50180/1‑145 TGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAGGTACCT > 1:150653/1‑145 CTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGA < 1:195087/145‑1 TATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAT < 2:35584/145‑1 TATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAAAACCCAGACACCATCACGGGAATGTACCTGGAT > 1:328387/1‑145 TCGCTGACAGGACCTGAAATGAAAGGCCTTTAAACAGATAGGTTTTCATCGTGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCA < 2:297572/145‑1 CGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTAAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTGAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCCGACAACATCCCAGAAATGTACCTGGgacat > 2:257710/1‑140 TGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGATTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATTGGGTACCTGCTGACTTAAAATAACACGCAGACAACATACCAGAAATGTACCTGCAGCATAAT > 1:12700/1‑145 TCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTG < 1:306330/145‑1 CAGGACGTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATTATTGA < 1:297201/145‑1 CAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAAACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGA < 1:119137/145‑1 TGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAA > 2:348660/1‑145 GAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGGTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAA < 2:367344/145‑1 GTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTT > 2:380704/1‑145 ggtTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAA < 2:260913/142‑1 GCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAG > 1:93182/1‑145 TTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGATAAAAAGTT > 1:159924/1‑145 TTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGATGTCAGGTTGTGGGGTACCTGCGGCTTTCAAATCACACCCAGACAACATCACAGCAAAGTAACTGGATCATAATGGAAACAAACAGGTTAAAAAGTT > 1:407082/1‑145 TTTAAACGGACAGGTTTGCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGTTTATGGGGTACCTGCGGCCTTATAATCACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTTAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTT < 1:342803/145‑1 TTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTT < 2:223890/145‑1 TTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTT > 2:150517/1‑145 GTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTAAGCTGACTCGCA > 2:23259/1‑145 GTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTATAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGACATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGATAGAACTGGCTCGCA > 1:255446/1‑145 TTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCAC > 1:239737/1‑145 TTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTAGAGCTCGCTCGCAC > 2:25301/1‑145 catattGTGTCCTTTAATAAAACCAGAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAAC < 2:151992/139‑1 CATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAAC > 1:107667/1‑145 ATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAACGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACC > 1:421230/1‑145 TCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCCCAAACCGGCACTTT > 2:208945/1‑145 TCCTTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTT > 2:272172/1‑145 TTTAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAGCATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTA > 1:53026/1‑145 TAGTAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATTTCACCTTGACATCATCACAGTAATGTTCCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAA < 2:141372/145‑1 TAGTAAAACCACAGGTGGAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGCACCTGGATCCTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAA < 1:102954/145‑1 TAAAACCACAGTTTGAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTT < 1:6609/145‑1 TAAAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTT > 2:196964/1‑145 TAAAACCACAGTGGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAGGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGCTTAAAACGTTTGAGCTGGCTCGCGCAAACCCGAACTTTTTAAGGTT > 1:57688/1‑145 AAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGTCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTT < 2:153030/145‑1 AAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTT < 1:346928/145‑1 AAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGAGGGAAGAGATTGACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGATTT > 2:312081/1‑145 AAACCACAGTTGTAAGGTTATGGGATACCTGCGGTCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTATT > 2:214206/1‑145 AAACCACAGTTGTAAGGGTAGGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATAACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTT < 2:85139/145‑1 CCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTA > 1:399920/1‑145 CCACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTA > 1:345992/1‑145 ACAGTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTAGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAct > 2:219035/1‑143 ACAGTCGTAAGGCAATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAAAGAAATGTACCAGGATAATAATTGAAACAAAAAGGGTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAAT > 1:111112/1‑145 CGTCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3676690‑3676832‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAAT > CP009273/3676836‑3676976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |