| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | CP009273 | 3,676,833 | Δ3 bp | 91.2% | intergenic (‑26/+155) | dctA ← / ← yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3676832 | 8 (0.350) | 78 (3.370) | 57/268 | NT | 91.2% | intergenic (‑25/+158) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
| ? | CP009273 | 3676836 = | 7 (0.300) | intergenic (‑29/+154) | dctA/yhjK | C4‑dicarboxylic acid, orotate and citrate transporter/cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase | |||||
TCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGT > CP009273/3676692‑3676980 | tcgcgaaggcggttCAGTTGCTGGCGTATTTCAGGATAGAAATGGCGAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGTGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTCGTAAAACCACAGGTCt < 1:345894/133‑1 (MQ=255) cgtcgccatgcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagtt < 2:31631‑M2/2‑1 (MQ=255) tcgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGt > 1:63573‑M2/142‑145 (MQ=255) cgccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggcgtcctttagtaaaaccacagTTGTa < 2:211642‑M2/5‑1 (MQ=255) cAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAAGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTa > 1:311103/1‑145 (MQ=255) ctaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgacctttagtaaaaccacagTTGTAAg < 2:211601‑M2/7‑1 (MQ=255) ccaagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagcggttttcatagggtgtcctttattaaaaccacagTTGTAAg > 2:375933‑M2/139‑145 (MQ=255) caagcggtttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatcgctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAgg < 2:285909‑M2/8‑1 (MQ=255) ggtttcatttgctcgcctatttcagtatagaaattgccaaggggaataccaatggctatcgctgtcaggatctgaaagtaaaggctttcaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATg < 2:166155‑M2/13‑1 (MQ=255) ttttcggttgctcgccgatttcaggatagaaatgggcaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATgg < 1:137709‑M2/14‑1 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagcaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATggg < 1:238108‑M2/15‑1 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagcataccaatggctctcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcataaggtgtcccttagtaaaaccacagTAGTAAGGTTATggg > 2:410319‑M2/131‑145 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctttcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggtgttcatagggtgtcctttagtcaaagcacagttgcaagtaaatggg > 2:220032‑M2/131‑137 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctcacgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggctttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATggg > 2:330404‑M2/131‑145 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccaaagATGTAAGGTTATggg > 1:136134‑M2/131‑145 (MQ=255) tttcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcatttagtaaaagcacagGTGTCAGGTTATggg > 1:401700‑M2/131‑145 (MQ=255) aTTTGCTCGCCTATTTCAGGATCGAAATGGCCAAGGAGAATACCGAGGGCTATCGCTGTCAGGACCCGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGGGGTTTTCATATGAAGTCCTGTAGTAGTACCACA‑‑T‑TTGTAAGGTTATGGGGTAc < 1:281255/145‑1 (MQ=255) tcatttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtactttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGt > 2:108771‑M2/129‑145 (MQ=255) atttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaagggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTAc < 1:143525‑M2/19‑1 (MQ=255) ttgctcgtctatttcaggatagaaatgggcaaggagaataccagtggctattgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCt < 2:61364‑M2/21‑1 (MQ=255) ttgctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCt < 2:61358‑M2/21‑1 (MQ=255) ctctcctttttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCg < 2:128760‑M2/24‑1 (MQ=255) ctcgcctatttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCg > 1:239475‑M2/122‑145 (MQ=255) cttCAGGAAAGAAATGGCGAAGGAGAACACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCtt < 1:394951/144‑1 (MQ=255) atttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTaa < 1:67357‑M2/31‑1 (MQ=255) tttcaggatagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaaggagaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaacacagTTGTAAGGTTATGGGGAACCGGCGCACTTaaa > 2:399100‑M2/114‑145 (MQ=255) cgtatagaaatgggcaaggagaataccaatggttattgctgtcaggaccttaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATaa < 2:52066‑M2/36‑1 (MQ=255) aggttagaaatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATaa < 1:4690‑M2/36‑1 (MQ=255) gatagaaatggccaaggagaataccagtggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAaca < 2:184804‑M2/38‑1 (MQ=255) aatggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGa > 2:94329‑M2/102‑145 (MQ=255) ggccaaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaa < 2:356111‑M2/47‑1 (MQ=255) cAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACATAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaa > 2:399464/1‑145 (MQ=255) gccaaggagaataccgagggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagagggtttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaac > 1:19775‑M2/98‑145 (MQ=255) ccaaggagaagaccaatggctatcgctgtcaggaccggaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggggtcctgtagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGacaaca < 2:62138‑M2/49‑1 (MQ=255) aGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCAGCCTTAAAATAACACCCAGccacca > 2:377792/1‑145 (MQ=255) caaggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAt > 2:316479‑M2/96‑145 (MQ=255) caaggagaataccaatggctatcgctgtaaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtatcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAt > 2:316502‑M2/96‑145 (MQ=255) aaggagaataccaatggctatcgctgtcaggcccagaaagtaacggcttgtaaacagagaggtgttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGCACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACACCATc > 1:196298‑M2/95‑145 (MQ=255) aggagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATca < 2:398708‑M2/52‑1 (MQ=255) gagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcaca < 1:345054‑M2/54‑1 (MQ=255) gagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCCGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATcaca > 1:249923‑M2/92‑145 (MQ=255) gagaataccaatggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttgtcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTGGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACACCATcaca > 1:11721‑M2/92‑145 (MQ=255) agaataccaatgactatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAg < 1:109666‑M2/55‑1 (MQ=255) aataacaatggctagcggtgtcagtaccggaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagcaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGaa < 2:362131‑M2/57‑1 (MQ=255) tggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCt > 1:50180‑M2/81‑145 (MQ=255) tggctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAGGTACCt > 1:150653‑M2/81‑145 (MQ=255) ctatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGa < 1:195087‑M2/68‑1 (MQ=255) tatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGAt < 2:35584‑M2/69‑1 (MQ=255) tatcgctgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAAAACCCAGACACCATCACGGGAATGTACCTGGAt > 1:328387‑M2/77‑145 (MQ=255) tcgctgacaggacctgaaatgaaaggcctttaaacagataggttttcatcgtgtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCa < 2:297572‑M2/71‑1 (MQ=255) cgctgtcaggacctgaaagtaaaggctttaaaacagagaggttttcatagggtgtccttgagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCCGACAACATCCCAGAAATGtacctgggacat > 2:257710‑M2/74‑140 (MQ=255) tgtcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggatttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATTGGGTACCTGCTGACTTAAAATAACACGCAGACAACATACCAGAAATGTACCTGCAGCATAAt > 1:12700‑M2/71‑145 (MQ=255) tcaggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTg < 1:306330‑M2/77‑1 (MQ=255) caggacgtgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATTATTGa < 1:297201‑M2/78‑1 (MQ=255) caggacctgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAAACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGa < 1:119137‑M2/78‑1 (MQ=255) tgaaagtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACaaaa > 2:348660‑M2/61‑145 (MQ=255) gaaagtaaaggcttttaaacagagagggtttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACaaaaa < 2:367344‑M2/86‑1 (MQ=255) gtaaaggcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGtt > 2:380704‑M2/56‑145 (MQ=255) ttttAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAGCAAACAGGTTaaaaa > 2:131286/1‑145 (MQ=255) ggtttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTaaaaa < 2:260913‑M2/95‑1 (MQ=255) gcttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAg > 1:93182‑M2/50‑145 (MQ=255) ttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGATAAAAAGtt > 1:159924‑M2/48‑145 (MQ=255) ttttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagATGTCAGGTTGTGGGGTACCTGCGGCTTTCAAATCACACCCAGACAACATCACAGCAAAGTAACTGGATCATAATGGAAACAAACAGGTTAAAAAGtt > 1:407082‑M2/48‑145 (MQ=255) tttaaacggacaggtttgcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGTTTATGGGGTACCTGCGGCCTTATAATCACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTTAAACAAAAAGGTTAAAAAGttt < 1:342803‑M2/99‑1 (MQ=255) tttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGttt < 2:223890‑M2/99‑1 (MQ=255) tttaaacagagaggttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGttt > 2:150517‑M2/47‑145 (MQ=255) gttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTAAGCTGACTCGca > 2:23259‑M2/34‑145 (MQ=255) gttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTATAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGACATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGATAGAACTGGCTCGca > 1:255446‑M2/34‑145 (MQ=255) ttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGcac > 1:239737‑M2/33‑145 (MQ=255) ttttcatagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTAGAGCTCGCTCGcac > 2:25301‑M2/33‑145 (MQ=255) catattgtgtcctttaataaaaccagagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAAc < 2:151992‑M2/117‑1 (MQ=255) catagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAAc > 1:107667‑M2/29‑145 (MQ=255) atagggtgtcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAACGTTTGAGCTGGCTCGCACAAAcc > 1:421230‑M2/28‑145 (MQ=255) tttAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACttt > 2:410082/1‑145 (MQ=255) tcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCCCAAACCGGCACttt > 2:208945‑M2/20‑145 (MQ=255) tcctttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACttt > 2:272172‑M2/20‑145 (MQ=255) tttagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAGCATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTa > 1:53026‑M2/17‑145 (MQ=255) tagtaaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATTTCACCTTGACATCATCACAGTAATGTTCCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTaaa < 2:141372‑M2/131‑1 (MQ=255) tagtaaaaccacagGTGGAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGCACCTGGATCCTAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTaaa < 1:102954‑M2/131‑1 (MQ=255) taaaaccacagTTTGAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtt < 1:6609‑M2/134‑1 (MQ=255) taaaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtt > 2:196964‑M2/12‑145 (MQ=255) taaaaccacagTGGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAAGGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGCTTAAAACGTTTGAGCTGGCTCGCGCAAACCCGAACTTTTTAAGGtt > 1:57688‑M2/12‑145 (MQ=255) aaCCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAGCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtt < 2:63308/145‑1 (MQ=255) aaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGTCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt < 2:153030‑M2/136‑1 (MQ=255) aaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt < 1:346928‑M2/136‑1 (MQ=255) aaaccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGAGGGAAGAGATTGACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGattt > 2:312081‑M2/10‑145 (MQ=255) aaaccacagTTGTAAGGTTATGGGATACCTGCGGTCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtatt > 2:214206‑M2/10‑145 (MQ=255) aaaccacagTTGTAAGGGTAGGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATAACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGtttt < 2:85139‑M2/136‑1 (MQ=255) ccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTa > 1:345992‑M2/7‑145 (MQ=255) ccacagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTa > 1:399920‑M2/7‑145 (MQ=255) acagTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTAGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTgtact > 2:219035‑M2/5‑143 (MQ=255) acagTCGTAAGGCAATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCAAAGAAATGTACCAGGATAATAATTGAAACAAAAAGGGTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAAt > 1:111112‑M2/5‑145 (MQ=255) tCTTGTAAGGTTATGGGGTAACTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACAGCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCa < 1:377792/145‑1 (MQ=255) ttGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGt > 1:178427/1‑145 (MQ=255) | TCGCCAAGCGGTTTCATTTGCTCGCCTATTTCAGGATAGAAATGGCCAAGGAGAATACCAATGGCTATCGCTGTCAGGACCTGAAAGTAAAGGCTTTTAAACAGAGAGGTTTTCATAGGGTGTCCTTTAGTAAAACCACAGGTCTTGTAAGGTTATGGGGTACCTGCGGCCTTAAAATAACACCCAGACAACATCACAGAAATGTACCTGGATCATAATTGAAACAAAAAGGTTAAAAAGTTTGAGCTGGCTCGCACAAACCAGCACTTTTTAAAGTTTTGTAATCAGT > CP009273/3676692‑3676980 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |