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CATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGC < 1:349943/237‑1 TTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGGTACTTTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG > 1:968811/1‑239 CATTCCCATTCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAAGGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGAC < 1:391283/239‑1 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TTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGACGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTTCGTTTGGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCCCGAAGGGCCACCGGTAAGCTCAAGATGACCATTTTTGTAATTTTCa > 2:311102/1‑238 AACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGTCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCATGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCcc > 1:885746/1‑237 aCAAAAAGGGGGGATTTTTTCCTCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTGGGCGTTGAAGGGGGGGGAAACATCCCATAAGGGGT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGAGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAA < 2:348959/238‑1 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CCTTTAATTTTTCCTCTATTCCCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTCCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATC < 1:1063349/239‑1 TTAATTTTTCCCTTATTCTCGGCGTTGTATGTGGGGGAAACCTCCCATAAGGGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGGCGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGG < 2:894137/239‑1 TCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCCTTTCTG > 1:679048/1‑239 TCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCCCTTCTG > 1:1064162/1‑239 TCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGCCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTG > 2:85649/1‑239 ttttcggggGTTGAATGTTGGGGAAACATCCACTTAGCTGT‑GACCTAAGGGTTGAACCCTCTGAAGGATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGG < 2:526223/230‑1 tTTCTCGGGTTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATTAGCGCT‑AACTTAAGGGGTGAACCAGTTGAAGAATGGGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTGCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGG < 2:679048/238‑1 ccggtTTGTATGTGGGGAAAACATCCCCTAAGCCCT‑AGTTTAAAGGCTGAACCCTCTGAAGAATGGGACGCCTCGGTGCCTCGGTAAGACGCGGCCTCGCGTTCTTCAAGTGCCTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCTCGAATTGCCCCCTGTAAGCACCAGATGACTATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAAgc < 2:917207/234‑3 TGAATGTGGGGGAAACTCCCCAGTAGCGCT‑AACTTAAGGTTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGA < 2:196628/239‑1 TGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGT > 1:188332/1‑192 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GGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTTTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG > 2:993832/1‑235 GGGGGAAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGG < 1:993832/235‑1 AAACATCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTTTTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGACCTTTTTGGGGGGAAATCAAACGAGGGCTGGTTTAT > 2:554101/1‑239 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NC_000913/458562‑458795‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCT‑AACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGATGACCATTTTTGTTATTCTCCACAACGAGTTAGTTCTTCTTTTCGGATCCGGCACTTCTGGGGGGGAAATCCAGCGATGGCTGGATTATGTCG < NC_000913/609351‑609114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |