| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 80.5% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 19 (0.210) | 72 (0.760) | 47/426 | NT | 78.6% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 18 (0.200) | 81 (0.860) | 48/424 | NT | 81.4% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT > NC_000913/607780‑608243 | tCCAACCCCGAACAATTGGGAAGGTAGCCCCTTCTTCGAATGGAGGCAATATAAACATGCTTACGAAATAGGCCCTTGGTGCAGTCATAGTGCGGTG‑TTTACAGGTGCG‑GGGATTTACGCTTGTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc < 2:237984/239‑1 (MQ=255)tCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc < 1:621548/239‑1 (MQ=255)tCCAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcg < 1:534719/238‑1 (MQ=255) ccAAACCCGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTACTCCCATAAGCGCt < 1:578118/239‑1 (MQ=255) ccAAACCCGAAAAATTTGGTGGGGTGTCCCTTTTTCGCCTGTAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTGTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCt < 2:393975/239‑1 (MQ=255) cccGAACAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACtt > 1:1156491/1‑239 (MQ=255) cGAACAATTTGGAAGGGAGTCCCTTCTTCGTATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTGGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:1215708/239‑1 (MQ=255) aaCAATTTGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGTTGTTTTCGCTTACGAACGCGAGAAGTAGCCGTTGT‑TCGGGGGGGAATCCCCAAAGCCCCAACTTAAgg > 2:433564/1‑239 (MQ=255) tGGATGGTAGTCCCTTCTTCGCATGGAGGCAATATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGGGTTTAAGGCTGTTTTCGCTTACGAACCGGAGAAGTAGCGGTTGT‑GCGGGGGGAAATCCCCTAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑gggg > 2:384573/1‑239 (MQ=255) tGGTAGTCCCTTTTTCGCATGGAGGAAATATTAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTAt < 2:398386/238‑1 (MQ=255) 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aaTATAAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGGG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg < 1:384573/238‑1 (MQ=255) tataAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGAT‑GTGGTATTAAGCCTGATTTGATTTAACGTGcagctg > 1:64493/1‑234 (MQ=255) tataAACATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCCGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GGGGTATTCCGCCTGAAATGATTTAACGGGCCGATg > 2:337/1‑239 (MQ=255) aaCATGCTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCCTAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGGTTAGTCCCATAAGCGCACACTAAAGGGTG‑GGGGGATTACGCCGGAATGGATTAAACGTGCCCATGAAta > 2:452376/1‑238 (MQ=255) aTGTTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTTATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCG‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAct < 2:799099/239‑1 (MQ=255) cTGACGAAATATGCCCTTGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTActct > 1:1155940/1‑238 (MQ=255) 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ttGCCATTGCGGCTGTTATAG‑GGTGTGTTTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTGGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTg < 2:560462/238‑1 (MQ=37) ttgccTTGCGGCATTCATAGTGCTGTT‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTgg < 1:1038016/236‑1 (MQ=255) tGCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT‑GTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCa > 1:1096658/1‑239 (MQ=255) gCGGCAGTCATAGTGCTGTG‑TTTAACGGTGCT‑GGGATTTACGCTTCTGGTCGGAGACTCGCTGTGTGAGTTTACGGTGAAGGAACGTAATATTGAGTTTAAGGCTGTTCTCGCTTACGAACCGAAGAAGTAGCCGTTGT‑GCGGGGAGTAATCCCATAAgcgc > 1:927819/1‑162 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |