| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 80.5% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 19 (0.210) | 72 (0.760) | 47/426 | NT | 78.6% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 18 (0.200) | 81 (0.860) | 48/424 | NT | 81.4% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGT‑CAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCA‑TTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAA > NC_000913/609115‑609584 | gaccataTCCGGCCAACCCCGGATTTCCCCCCCAAAAGTACCGGAGCCGCAAAGAAGAACTAACCCGTTGTGGAGAATAAAAAAAAGGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGt < 2:840099/233‑1 (MQ=11)gacATAATCCAGCCATCGCTGGTTTTCCCCCCCAGAAGGGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGGGGGACAGTAGCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAg < 1:798162/238‑1 (MQ=2) cATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTa < 1:796239/238‑1 (MQ=31) aaTCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGGGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATcc < 1:791343/239‑1 (MQ=18) ggcataggtGGATTTTCCCCCTAACAGGGCCGGACCCGAAAAGGAGAACAAGCCCCATGTAGTGAATAACAAAAATTGCCATCTGGAGCTTGCTGTTGGCCAATCGGGGGACAGTTTCCCTGCCAGCCTCCCAATCGCTATTGAATTACGCGAGGCTTCGTCGTAACGATGCACGGAGGCGTCGCATTCGTCAGATGTTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGcgt < 2:1219737/231‑3 (MQ=255) ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCat > 1:1292338/1‑238 (MQ=34) tCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTACGTTACAC‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCAAATcc > 2:1289723/1‑239 (MQ=255) 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ccAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:783194/239‑1 (MQ=255) ccAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGAAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa > 1:847929/1‑239 (MQ=255) ccAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGACGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGAGGGTTCAACCCTTAGGTTAGCC‑CTTATGGGCGGAAACCCCGCAAATCCCGTTGTCAGATAAGGa > 2:58155/1‑239 (MQ=11) ccAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGATTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCCTCGTCTTAACAAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCACCCCTTAGGTTAGCG‑CTTATGGGAGCAATCCCGGCATATCAGGTTgcaaggtacgga > 1:796437/1‑234 (MQ=11) ccAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAAAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:1267804/239‑1 (MQ=255) gTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGGCTTAACGAGGCACCGAGGCGTAGCATTCTTCAGATGTTTCAACCCTTAAGTTATCG‑CTTATGGGAGTAACCCCCCCAAATCCGGTTTTCAGGTCAAGATGGGaa > 2:717903/1‑239 (MQ=14) 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gATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCa > 1:882480/1‑237 (MQ=255) taactCGTTTAGGGGAATAAAAAAAATGGCCATTGGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTAGCCCTGACAACCTACAAAACGCAATTGAAGGACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGGCGCAGTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCCCCTGCTTTACACTTTCGcc < 2:1227564/239‑1 (MQ=18) actCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGTCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGCTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGGGTAATCCCCTCATATCCCGTTGCCAGGTAAGGTTGTTACGGCACTTGCCTAACACttagtcccg > 2:264645/1‑232 (MQ=14) 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tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGT‑CAGTGATGGCTGCGGGCCAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCCCC‑TTCTCCCGATGAATGCTGACCTGCTGtta > 2:1308044/1‑238 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGAATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTCGT‑CAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGGTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGGGCACAGAAAACATCTCA‑TTCTCACGATAAATGTGAACCTTCTGtta > 2:819486/1‑238 (MQ=255) tGGTTCCACCCTTAAGTTAGGG‑TCTATGGGAATTATCTCCGCTTGTCCGTTTGTCAGGTCAGGGAGGTAAGGTGACTGCTTTACCATTTCGCCCGTGGT‑CAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTGTCTTCTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCA‑TTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTcc < 2:954171/239‑1 (MQ=255) 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GACATAATCCAGCCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCG‑CTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACACTTTCGCCCGTGGT‑CAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCA‑TTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAA > NC_000913/609115‑609584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |