| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 0 (0.000) | 33 (0.880) | 30/278 | 0.2 | 100% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 1 (0.030) | 31 (0.830) | 28/276 | 0.3 | 96.7% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > NC_000913/608008‑608151 ggAATTCGTGGATTTCAATCCCTTCAGCACGCTCAGGATTCATAGAACTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAGTCAGATGACACGACTTTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 2:61733/141‑1GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCTGAACTCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTGAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 1:418863/143‑1 CAATACGGGGATGTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC < 2:423464/143‑1 ATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATCTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGCTGTTCCCCCATAAGGGCTA > 2:444342/1‑143 tttATGCTTTCTGTACGCTCAGGATTCATAGATCTCTCTCTTAGTTTATTTTCCTCTAGGTAATCATATGTCACGTCTGTGCTTCACGCCATCTATTAATATGTTCGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACT < 2:505999/140‑1 AATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTTCCCATAAGGGCTAACTTA > 1:184688/1‑143 GTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCCCGCCCTCTTTTAACATGTACGTCAGTATATGGGAATGTTTCAAAATAAGCACTAACTTAAGGGT > 1:94120/1‑143 TCAGAACGCTCAGGATTCATGGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 2:423701/143‑1 GAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTTTGCTATTTTATCAGATGACACGACAGGGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG < 1:346328/143‑1 ACGCTCATGATGCATAGAGGTCTCTCTTAGTTTAAGTGCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 2:468523/143‑1 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCGTCACGCCCTCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTGCCAAGAAGAGCTAACTTAAGAGTGTAGGTATTAC > 1:669911/1‑143 ATAGAACTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCAAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCAGCTATTAACATGTGCGGCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 1:231200/143‑1 AGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGA < 2:681649/143‑1 AGAGCTCCCTCTTAGTCTAATCTCCGCCAGGTAACCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGCACGTCCGTATATGGTGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGA < 1:269722/143‑1 TCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 2:610967/143‑1 CTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC < 1:534471/143‑1 TCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTACTCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGCTGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTTCGCCTGCTGTGATTTATCG > 1:136802/1‑143 TCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACACCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGCTGTGCTCTTACGCCTAATATGATTTAACa > 2:195100/1‑142 TTTCCGCCATGTAATTAGATGACACGACTGTGCTTCACGACATCTATTAACATGTACGTCAGTATAGGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA < 1:170496/143‑1 CCGCCATGTAAGCAGAGAACTCGATTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 2:68601/143‑1 CGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTCCTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCTAGCGGTACTACGACTGATATGATTTAACGTGCCGACGAATTACTCT > 2:253905/1‑143 CAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCCCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC > 2:81680/1‑143 GTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGGCTGAGAGGATTTAAAATGCCGCTGAATTACTCTCACGAT > 2:506518/1‑143 TCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCCTCCGCGCTTACTTACTAGTTGTGGTATTACAACTGAAATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACT > 1:25911/1‑143 TCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGTTATGATTTATCGTGCCGATGAATTAATCTCATAATAACT > 1:145274/1‑143 ACGACTGTGCTTCACGGCATCTAGTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATTAATTCCTCTCACGATAACTGGTCAGCAA < 2:520317/143‑1 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:692053/143‑1 GCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC > 1:434291/1‑143 GCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTTACCCATATTa > 1:134425/1‑142 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGGTAACTGGTCAGCAATTCTGGCCTATATTGG > 1:701480/1‑143 ATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCC < 2:57764/143‑1 agATGTGCGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAATCGCTATCTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCATCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 2:114009/141‑1 TGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTCAGCCCGAcgcg > 1:320189/1‑139 GGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAAGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCCCGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCAAATTGGTAAGCCCGCAGACATGGATACTGCGGCA > 2:85796/1‑143 GGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATACTGGCCCATATTGGTAAGCACGAAGAACTCGATAATTCaccac > 2:424530/1‑138 GTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTGAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATCCTTCCGCCCGTcct > 1:653821/1‑140 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > 2:367962/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGCATACTTCGGCACTTAATCCCGGG > 2:459366/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCCATGAATTACTCTCACCGTAACTGGTCAGCAATTCTCGCCCATATTGGTCATCCCGAAGCACTGCATACTTCGGCCCACACTGCCGGc > 2:362012/1‑142 GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > NC_000913/608008‑608151 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |