| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,375,828 | IS186 (+) +4 bp | coding (132‑135/963 nt) | menC ← | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2375828 = | 1 (0.020) | 56 (0.880) | 47/274 | 0.3 | 98.2% | coding (135/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
| ? | NC_000913 | = 2515617 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2375831 | 1 (0.020) | 73 (1.140) | 61/274 | 0.0 | 98.6% | coding (132/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
| ? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
AGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAA > NC_000913/2515485‑2515759 | aGGTTGCCATTCGTGGGACAGGATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGCCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCg < 2:896124/143‑1 (MQ=255) ggCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGttt < 2:603237/143‑1 (MQ=39) cATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGtctttt > 1:554494/1‑143 (MQ=38) ttCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACACAGCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGGTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTa > 1:697305/1‑143 (MQ=255) tCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTAc > 2:1089176/1‑143 (MQ=255) ttGGGACAGCATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc < 2:646511/142‑1 (MQ=255) gggACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCt < 2:202477/143‑1 (MQ=255) ggACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGACCATCCCCCTGTTTTTTTACGCGTg > 1:1111968/1‑143 (MQ=11) aGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCCGTTaa > 1:141386/1‑143 (MQ=255) tcccccTGACCGCCTTCAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATc < 2:397142/140‑1 (MQ=255) tCCCTGACAGGCTAGAAAGCGCAATTGGAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAg < 2:404900/143‑1 (MQ=255) tCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAg < 1:240157/143‑1 (MQ=255) cccGGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGc < 1:8121/143‑1 (MQ=255) cTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTa < 1:231028/143‑1 (MQ=255) tGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa > 2:756319/1‑143 (MQ=255) aCAGCCTACAAGCCGCAACTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTCTACGCCTGTTAATCAGCTAATg < 1:448904/143‑1 (MQ=255) cAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATgg < 1:321311/143‑1 (MQ=255) cAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCCGTGAATCAGCTACTgg > 1:298204/1‑143 (MQ=255) tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGct > 1:298546/1‑142 (MQ=255) aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCg > 1:501373/1‑143 (MQ=255) aaaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTCTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCg > 1:499464/1‑143 (MQ=255) cGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAcc < 1:782870/143‑1 (MQ=255) ttGTAGATCGTGTGGCATCGTCTTAACGAGGGTCCTAGGCGTCGCATTCTTCTGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCa < 2:541806/143‑1 (MQ=21) tGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCaa < 2:697305/143‑1 (MQ=255) gaagcaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGCGGCGCGGCAGTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCaaa < 1:216878/143‑1 (MQ=25) aagaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGCTTTTTTACGCCTGTTCATCAGCTACTGCACGCGGGCGACCACTCCAAt > 2:551133/1‑143 (MQ=17) agaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTAGCAAACTTCAGAGGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATa > 1:1128343/1‑143 (MQ=255) gaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAc > 1:128473/1‑143 (MQ=255) gaaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGAGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAc > 2:1032580/1‑143 (MQ=255) aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTCATGGCTGCGTGCGCCCCATCAAATAcc > 1:934811/1‑143 (MQ=255) aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAcc > 2:989643/1‑143 (MQ=255) aCGCGAGGCATCGTCTTACCGAGGCACCGTGGCGTCGCATTCTCCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAccc < 2:911413/143‑1 (MQ=255) gcgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCtt > 2:512518/1‑143 (MQ=255) aGGCATCGTCTTAACGATGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCa < 1:990816/143‑1 (MQ=255) gCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCGATCAAATACCGTTGCAGa > 1:406381/1‑143 (MQ=255) gCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAgg > 1:1126861/1‑142 (MQ=255) gtCGTCCTAACCGGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTATGGTAGCGCTTCTGGGCGACTTCCCCGGTTCTGTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGata < 2:644134/142‑1 (MQ=25) tCGTCTTAACGAGGCACCGATGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGCGATAATTCACCGCCTCTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGatat < 2:780185/143‑1 (MQ=25) tCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGatat > 1:766623/1‑143 (MQ=255) tCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGGCCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGc > 1:22329/1‑143 (MQ=255) tCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGAGATAAGGCCCAGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGTCTGCCGGCGACCACTCCAATGCCCTTGCATCTAttac > 2:224412/1‑141 (MQ=21) ttAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATTTTacac > 1:72123/1‑143 (MQ=255) tAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCAcc > 1:1105196/1‑143 (MQ=255) cGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCAccctc > 2:902171/1‑141 (MQ=255) ggCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGc < 2:209730/143‑1 (MQ=255) gCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCt > 1:126213/1‑143 (MQ=255) ccGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTAt < 1:428429/143‑1 (MQ=255) cGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATg < 1:1089176/143‑1 (MQ=255) gCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACTCCTGTTAATCTGCTAATGGCTGCGGGCGACCCTTCTAATCCCCTTGCAGATATTGCCCCCCGCGCTTATGCatt > 2:315523/1‑141 (MQ=25) cGTTGCTTTCTTCATATCGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATa < 2:713082/143‑1 (MQ=255) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGCGCTTATGCAATG‑‑gc > 1:248206/1‑143 (MQ=255) cttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCctgct < 2:1111968/143‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATTGCTGCGGGCGACTAATCCAATACCCTTTCGGATATTGCACCCCGGGCCTATGCAATA‑‑GCGCctgctgc > 2:1182283/1‑143 (MQ=38) ccAGATGGGTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCctgctgc < 2:554494/142‑1 (MQ=255) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAAGCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCACTC‑‑GCGCCTGCTGCTGtt > 1:563651/1‑143 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGtctc > 1:1144263/1‑143 (MQ=255) cccTTAAGTTAGCGCTTATGGCATCATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAGTCCGCTCACGCCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGa < 2:135694/143‑1 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTCATCAGCTAATGGCTTCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTCGACCCCCGCCCTATGCCATT‑‑GCCCCTGCCGCTGTTCGCTCTCGAc > 2:612181/1‑143 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCGAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCGGCTGTGGCGTCTCGACag > 2:807966/1‑142 (MQ=255) ttAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGGTGCGTCTCGACag > 1:880753/1‑142 (MQ=255) aGTTAGCGCTTGTGGGCTGATTCGCCGGTTTTTTTAAGACTGTTAATATGCTAGCGGCTCCGGGAGACCGATCAACTACCCTTGCAGATATTGCACCAAGTG‑TTA‑GCTTTAACGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACt < 2:22329/143‑1 (MQ=255) aGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACt < 2:128473/143‑1 (MQ=255) gTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTc > 1:338368/1‑143 (MQ=255) gcgcTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑gcgc > 1:685114/1‑112 (MQ=255) gcgcTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑gcgc < 2:685114/112‑1 (MQ=255) gcgcTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCcgcg > 2:800570/1‑143 (MQ=255) gcTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCTCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAGCTCCGCGAc > 1:438266/1‑143 (MQ=255) gggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACt > 1:181910/1‑143 (MQ=255) gATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCa > 1:180942/1‑143 (MQ=255) aTAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACACCCTCCCCGACCACACTCac > 2:1086793/1‑142 (MQ=255) | AGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATA‑‑GCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAA > NC_000913/2515485‑2515759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |