| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 49 (0.510) | 50 (0.530) | 44/424 | NT | 51.0% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
ACTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTAT‑TCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGCGGCGATGGACCATGATAAAAAAATT > NC_000913/458562‑459037 | aCTGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTAT‑TCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATcccc < 2:201607/239‑1 (MQ=255) 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tACAATCTACGATCTGCCGCCCATGGAACACGTCGAAAAAGTGGTTATCGAGGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAAAAGGCATCTGCGGAATAATTAACCATTCCCATACAATTATTTAACCAAAAAAGGGGGACTTTATCTCCCCTTTAATTTTTACTCGAT‑TCTCGCGTTTTAACGTGGGGGAAACATCCCataagggcta > 1:877645‑M1/1‑229 (MQ=255) ccATGTACGATCTGCCGGCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGGGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTAT‑TCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACg < 2:170797/239‑1 (MQ=255) ctttgccgttttccgttcatggaataCTTCGAAAAAGTGGTTATCTACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTTATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAATGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTAT‑TCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaactt < 1:357652‑M1/227‑15 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |