| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 49 (0.510) | 50 (0.530) | 44/424 | NT | 51.0% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CCATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCACCTGCTTTACAC‑TTTCGCCCGTGGTCAGTGATGGCTGCGGGCGAATCGTACCAGATGTTGTCAATTAATCGTGTTGGCACAGCGTTATGACTATCTTTTCTTTTATCTGCCAGTGCACAGCAAACATCTCATTCTCACGATGAATGATGACCTGCTGTTTATTCCAGCTAATTATCTGATAGTCCAGAAA > NC_000913/609127‑609584 | ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGCGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGACAC‑CGAGGCGTCGCATTATTCAGATGGTTCAACCCTTAAGGTAGCCCTTATGGGAGAAATACCCGCata > 1:809509/1‑239 (MQ=255)ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTCAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCat > 2:662705/1‑238 (MQ=21)ccATCGCTGGATTTCCCCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGAGGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGAAGTAATCCCCGCat > 2:799216/1‑238 (MQ=21) ctcTGGATTTCCCCCCCAGAAGTTCCGGATTCGAAAAGAAGATCTATCTTGTTGTGGGGAATAACAAAAATGGTCATCTGGATCTTCAAGGTGGCCGTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCg < 1:535140/237‑1 (MQ=11) tttttCCGCCCCAGAAGTGCCGGATCCGAAATGAAAAACTAAATCGTTGTGTAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTGCAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAAGCCCCGCATATCCGGTTgt < 1:237703/237‑1 (MQ=255) cccccccAGAAGTGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTCGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 2:1251565/1‑238 (MQ=255) cccccacAGAAGTGTCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAACAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGAATCCCTGACAGCCTACAAAACGAAATTGAA‑GAACGCGCGGCATAGCTTTAACGAGCCAA‑CGGGGCTCCGCATTTTTCAGCTGGTTCAACCATTAAGTCAGCGCTTATGGGGGCAATCCCCCCTATTCCGGTTgtcagc > 1:1256326/1‑237 (MQ=11) ccccaccAGAAGGGCCGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAGCGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt < 2:410167/239‑1 (MQ=255) aaGAAGTGCAGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt < 2:130205/238‑1 (MQ=255) ccGGATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGTTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGc > 2:558179/1‑239 (MQ=255) ggttCCAAAAAGTAGAACAAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCTTTCGTGGGACAGTAGCCCTGGCAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGGGGCATCGTCTTAACGGGGCCC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 1:154664/236‑1 (MQ=17) ggATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:774618/239‑1 (MQ=255) ggATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:222026/239‑1 (MQ=255) ggATCCGAAAAGAAGAACTAACTCGTTGTGGAGAATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:644911/239‑1 (MQ=255) 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agaATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGAACCTGCTTTAAAC‑TTTCGCCCGGGGTCAGTGAt > 2:1263623/1‑239 (MQ=255) gaATAACAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCCCTTATGGGGGTAATCCCCGCCTAACCGGGTGTCAAGTCAGGATGGTAAGGGACCTGCTTTCACC‑TTTCcccctgagaccgaggag > 1:117899/1‑226 (MQ=14) cAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATGGTAAGGCAc < 2:31688/201‑1 (MQ=255) cAAAAATGGTCATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAA‑GAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCAC‑CGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGACAGGTCAGGATGGTAAGGCAc > 1:31688/1‑201 (MQ=255) 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> NC_000913/609127‑609584 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |