| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 4 (0.100) | 34 (0.860) | 31/278 | 0.2 | 89.7% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458787‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > NC_000913/608011‑608151 ggAATTCGTGGATTTCAATCCCTTCAGCACGCTCAGGATTCATAGAACTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAGTCAGATGACACGACTTTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 1:61733/141‑1GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCTGAACTCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTGAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 2:418863/143‑1 CAATACGGGGATGTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC < 1:423464/143‑1 ATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATCTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGCTGTTCCCCCATAAGGGCTA > 1:444342/1‑143 tttATGCTTTCTGTACGCTCAGGATTCATAGATCTCTCTCTTAGTTTATTTTCCTCTAGGTAATCATATGTCACGTCTGTGCTTCACGCCATCTATTAATATGTTCGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACT < 1:505999/140‑1 AATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTTCCCATAAGGGCTAACTTA > 2:184688/1‑143 GTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCCCGCCCTCTTTTAACATGTACGTCAGTATATGGGAATGTTTCAAAATAAGCACTAACTTAAGGGT > 2:94120/1‑143 TCAGAACGCTCAGGATTCATGGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 1:423701/143‑1 GAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTTTGCTATTTTATCAGATGACACGACAGGGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG < 2:346328/143‑1 ACGCTCATGATGCATAGAGGTCTCTCTTAGTTTAAGTGCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA < 1:468523/143‑1 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCGTCACGCCCTCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTGCCAAGAAGAGCTAACTTAAGAGTGTAGGTATTAC > 2:669911/1‑143 catggcggTCTCTCTTAGTTTGATTTCCGCCAGGTACTCAGATGTTCCGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATA < 1:344154/135‑1 ATAGAACTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCAAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCAGCTATTAACATGTGCGGCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 2:231200/143‑1 AGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGA < 1:681649/143‑1 AGAGCTCCCTCTTAGTCTAATCTCCGCCAGGTAACCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGCACGTCCGTATATGGTGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGA < 2:269722/143‑1 TCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:610967/143‑1 CTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAC < 2:534471/143‑1 TCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTACTCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGCTGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTTCGCCTGCTGTGATTTATCG > 2:136802/1‑143 TCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACACCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGCTGTGCTCTTACGCCTAATATGATTTAACa > 1:195100/1‑142 TTTCCGCCATGTAATTAGATGACACGACTGTGCTTCACGACATCTATTAACATGTACGTCAGTATAGGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTA < 2:170496/143‑1 CCGCCATGTAAGCAGAGAACTCGATTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC < 1:68601/143‑1 CGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTCCTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCTAGCGGTACTACGACTGATATGATTTAACGTGCCGACGAATTACTCT > 1:253905/1‑143 CAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCCCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC > 1:81680/1‑143 GTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGGCTGAGAGGATTTAAAATGCCGCTGAATTACTCTCACGAT > 1:506518/1‑143 TCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCCTCCGCGCTTACTTACTAGTTGTGGTATTACAACTGAAATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACT > 2:25911/1‑143 TCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGTTATGATTTATCGTGCCGATGAATTAATCTCATAATAACT > 2:145274/1‑143 ACGACTGTGCTTCACGGCATCTAGTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATTAATTCCTCTCACGATAACTGGTCAGCAA < 1:520317/143‑1 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:692053/143‑1 GCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC > 2:434291/1‑143 GCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTTACCCATATTa > 2:134425/1‑142 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGGTAACTGGTCAGCAATTCTGGCCTATATTGG > 2:701480/1‑143 ATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCC < 1:57764/143‑1 agATGTGCGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAATCGCTATCTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCATCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 1:114009/141‑1 TGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTCAGCCCGAcgcg > 2:320189/1‑139 GGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAAGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCCCGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCAAATTGGTAAGCCCGCAGACATGGATACTGCGGCA > 1:85796/1‑143 GGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATACTGGCCCATATTGGTAAGCACGAAGAACTCGATAATTCaccac > 1:424530/1‑138 GTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTGAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATCCTTCCGCCCGTcct > 2:653821/1‑140 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > 1:367962/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGCATACTTCGGCACTTAATCCCGGG > 1:459366/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCCATGAATTACTCTCACCGTAACTGGTCAGCAATTCTCGCCCATATTGGTCATCCCGAAGCACTGCATACTTCGGCCCACACTGCCGGc > 1:362012/1‑142 GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458787‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGG > NC_000913/608011‑608151 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |