| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 458799 | 4 (0.060) | 94 (1.350) | 74/276 | 0.0 | 96.0% | intergenic (+99/‑89) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609347 | NA (NA) | intergenic (+170/+112) | insL1/entD | IS186 transposase/phosphopantetheinyltransferase component of enterobactin synthase multienzyme complex | |||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458657‑458941 | tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCC > 2:996928‑M1/1‑143 (MQ=255)tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCC > 2:511686‑M1/1‑143 (MQ=255)tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGAATGTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCC > 2:1046167‑M1/1‑143 (MQ=255)tGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCAAACTGTTAGGTTACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCC > 2:471174‑M1/1‑143 (MQ=255) aTTTATGGCACGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCat < 2:325752‑M1/143‑3 (MQ=255) tGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcg > 1:290613‑M1/1‑136 (MQ=255) cAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctc > 2:1142899‑M1/1‑133 (MQ=255) aaGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTGGTTAACAACAAAGGGGGGGTTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATCCTCGGCGTTAAAGGTGGGGGGAACCATCCCataagcgcaa > 2:404368‑M1/1‑133 (MQ=255) tccggttgttcgggcgtacccatatgggccagagttgctgacgagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttgaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGAc > 1:1064588‑M1/120‑143 (MQ=255) tccagttcggcgggattaccaatctacatcataattgctgaccatttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaaccctgaagttagcgcttatTGGGAAACATCCCCATATACTGAc > 1:306818‑M1/120‑143 (MQ=255) aGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GTGGGAAACATCCCatacgcgctaac > 1:188935‑M1/1‑131 (MQ=255) agttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTa > 2:356119‑M1/117‑143 (MQ=255) agttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccaggtatcgtgagagtacttcatcggcccgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttacgttagcgcttatGGGGAAACCTCCGCCTGTACTGACGTa < 1:920633‑M1/27‑1 (MQ=255) agttcttcgagcttaccaatatgggccagaattgctgaccagtgatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTa > 2:300370‑M1/117‑143 (MQ=255) tcttcgggcttaccaatacgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt > 1:1039826‑M1/114‑143 (MQ=255) atgcgcaaCAGGCATCTGGCGAATAATGAACCCGTCTCACACAATTAGTTACCCAAAAAGGGGGGATGGTATCTGCCCTTTAATTTTTCCTCTAATCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagg < 1:902495‑M1/141‑19 (MQ=255) aaGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGGTTTTCTCTCCCCTTTCATTTCTCCTCTGAACTCGTCTTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagg < 2:1246661‑M1/143‑19 (MQ=255) aaGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagg < 2:1093997‑M1/143‑19 (MQ=255) ttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGt > 2:832‑M1/112‑143 (MQ=255) 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1:256091‑M1/1‑36 (MQ=255) cacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCt < 2:1228667‑M1/119‑1 (MQ=255) tctcTTCTCGGCGTTGAATGT‑GGTGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata < 2:184928‑M1/143‑109 (MQ=255) tctATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcatcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata > 2:710117‑M1/1‑35 (MQ=255) tcgattcGCGGCGTTGTGTGT‑GGGGGAAACACCCCatgagcgctaacttaagggttgaaccatctggagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgccgcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata < 1:1196775‑M1/140‑109 (MQ=255) ctATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctcacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcgtcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtgagggatac > 2:740430‑M1/1‑34 (MQ=255) 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tGAATGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagagtgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggcggtcagggatactgtcccacgaatg < 1:102608‑M1/143‑123 (MQ=255) aaTGT‑GGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggc < 2:1002350‑M1/143‑125 (MQ=255) gcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATcccc > 2:268209‑M1/7‑143 (MQ=255) gggggtgccgtcccataagcgctaacttaaggggtgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatattgtcccacgaatggccacct < 1:68920‑M1/133‑130 (MQ=255) ggggAAACATACCataagcgctaacttaagggttgaaccaactgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatacctcgagttcttcaattgcgtttgctaggctgtaaggtatacgttcccacgcatgtccccctg > 1:527573‑M1/1‑13 (MQ=255) 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tCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATAAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCGTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTgcgc > 1:158209/1‑143 (MQ=255) gcccataagcgctatcttaagggtggaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtcaagacgatgcctcgcgttcgtccattgcgttttgtaggctgtcagggatactggcccacgaatggccacctgtaagctcca < 1:622091‑M1/142‑140 (MQ=255) cccatacgccctaacttaagggttgaaccatctgcagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag < 1:976798‑M1/143‑141 (MQ=255) cccataagcgctgactgaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccag < 1:1197804‑M1/143‑141 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccacctgtaagctccagat > 2:959810‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGT‑GGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGAT > NC_000913/458657‑458941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |