| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | intergenic (+254/‑485) | ychE → / → oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499–1300693 | 1300697 | 5–1199 | 85 [0] | [0] 86 | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 81 (1.160) | 65/276 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑1684) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+1453/‑484) | ychE/oppA | UPF0056 family inner membrane protein/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
AAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCT > NC_000913/1299356‑1299639 | aaaTTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACCGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCTTTTGGTAGAGGAAAGTA‑CTAA > 1:244245‑M1/1‑143 (MQ=255) ttACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTTTGTTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTGTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAata < 2:454641‑M1/143‑4 (MQ=255) ttACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTATCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATTATAATCCTCGGCTTGCTCAAGAATAATTGAAATGATATTCTTAATTACACTGCCCTTGGAAGAGGAAAGT‑‑CTAAaata > 1:65870‑M1/1‑139 (MQ=255) cAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataata < 1:466250‑M1/143‑7 (MQ=255) agttagttATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCTTCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataa < 1:341512‑M1/143‑8 (MQ=255) agttagttATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATACTCATGAGCTTCCGCCAGGATCATTGACATGATATTATTCAGTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataatag > 1:441885‑M1/1‑136 (MQ=255) agttagttATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataa < 2:782563‑M1/143‑8 (MQ=255) ttagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatc > 1:221134‑M1/1‑134 (MQ=255) tagttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatca < 1:777043‑M1/143‑11 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGACATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaatt < 2:716756‑M1/143‑14 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaatt < 2:826977‑M1/143‑14 (MQ=255) ttaTAAGGATTTCCTTAACTGCTTCGCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaatt < 1:285798‑M1/143‑14 (MQ=255) taAGGATTTGCTTAACTGCTTCTGCTCACCATCATGTTGTTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTACTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCATTTGGTAGAGGAAAGGG‑ATAAataataatcaattgtt > 1:395697‑M1/1‑127 (MQ=255) ccTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGACTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGACTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAatattaatcatttgttaaattattg > 1:228832‑M1/1‑118 (MQ=255) cTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgt < 2:221134‑M1/143‑27 (MQ=255) tGCTTCTCCTCACCGTCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcattt < 1:818890‑M1/143‑33 (MQ=255) cTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttca < 2:850909‑M1/143‑35 (MQ=255) ttCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaactgttaaattattgtgcatttcac > 1:576201‑M1/1‑108 (MQ=255) ctcACGATCCTGTTATTTTCGCCACCTCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg < 2:567422‑M1/143‑41 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataatactcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:568196‑M1/1‑103 (MQ=255) ctcACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactg > 1:480973‑M1/1‑103 (MQ=255) gTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatc < 1:732068‑M1/143‑52 (MQ=255) gTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatc > 2:421353‑M1/1‑92 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatca > 2:1142296‑M1/1‑91 (MQ=255) ttATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttaactactggaactgtaatca > 1:541345‑M1/1‑91 (MQ=255) ttttCGCCACATCATAATCCTGAGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCAACTGCCTTTGGTATAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgaactgtaatcagaaa < 1:1017365‑M1/143‑56 (MQ=255) tttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaa > 2:1006126‑M1/1‑87 (MQ=255) ttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa < 1:388349‑M1/143‑58 (MQ=255) ttCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaa > 1:328165‑M1/1‑86 (MQ=255) ttCGCCAAATCATAATCCTGGTCGTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgtaactgtaatcagaaaa < 1:220570‑M1/143‑58 (MQ=255) tCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaag > 2:956895‑M1/1‑85 (MQ=255) gCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagat < 2:545489‑M1/143‑61 (MQ=255) gcacatCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata < 1:389611‑M1/142‑62 (MQ=255) ccACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagata < 1:1063178‑M1/143‑62 (MQ=255) catcatAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagac < 2:217939‑M1/143‑65 (MQ=255) tcatAATCCTGGGCCTGCTAAAGAATTATTTAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGACAAACTTC‑CTAAatcacaatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacat < 1:82121‑M1/143‑67 (MQ=255) cgcctgGGCGTGCTGAAGAAGAAGTGAGATGATATGATGAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattggtaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgctta < 2:194850‑M1/141‑72 (MQ=255) cTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagcc < 1:662356‑M1/143‑75 (MQ=255) cTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagcc < 2:115241‑M1/143‑75 (MQ=255) gggCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaa > 2:1020237‑M1/1‑67 (MQ=255) ggCCTGCGGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaat < 1:640481‑M1/143‑78 (MQ=255) tGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatt > 1:647445‑M1/1‑59 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTATTAATTACACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatacacatgcttagccaatctctattt > 1:730148‑M1/1‑58 (MQ=255) gaagaaTAATTGAAATGATATTATTAAGTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctattt < 1:330208‑M1/143‑86 (MQ=255) gaaTAATTGAAATGATTTTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgat < 1:488909‑M1/143‑89 (MQ=255) aataatTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgatt > 2:342972‑M1/1‑54 (MQ=255) ctggaattatATGACTAATCCCCCTGCCCGTGGTAGAGGCAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagttagacatgcttagccaatctctatttgattgaatt < 2:646916‑M1/139‑95 (MQ=255) aaaTGATCTTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaa < 1:137753‑M1/143‑98 (MQ=255) aaTTATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaa < 1:169257‑M1/143‑99 (MQ=255) aaTGATTTTATTAATTCCACTGCCTTTGTTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaa < 2:323106‑M1/143‑99 (MQ=255) aaTGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAgtaataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatctgattgaattgaaa > 2:143620‑M1/1‑45 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatgtctattagattaaagtgaacga > 1:1058580‑M1/1‑43 (MQ=255) tGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaaga < 2:488987‑M1/143‑101 (MQ=255) gATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGG‑GAGTGTCAAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactgaaactgtaagcagaaaagatatacatgcttatccaatctctatttgattgaattgaaagat > 1:1091125‑M1/1‑42 (MQ=255) atatTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgcattgaacgatg > 2:615213‑M1/1‑41 (MQ=255) tattatTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgt < 2:172458‑M1/143‑104 (MQ=255) ttattaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaatggaaagatgttt > 2:650565‑M1/1‑38 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGACAGTG‑CTAAataataatcaattgttgaattaccaacaaattaactacttgaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgt > 1:888369‑M1/1‑36 (MQ=255) attaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaaatattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgattagccaatctctatttaattgaattgaaagatgcttgt > 1:1193126‑M1/1‑36 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataattaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaggatgtttgtt > 1:686228‑M1/1‑35 (MQ=255) ttaATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcagttcactactggaactgtaataagaaaagatagaaatgcttagccaatccctatttgattgaattgaaagaggtttgtt > 1:70906‑M1/1‑35 (MQ=255) aaTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaa < 2:324695‑M1/143‑111 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaag < 2:480973‑M1/143‑112 (MQ=255) aTTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaaataaaagatgattgttaag > 1:164254‑M1/1‑32 (MQ=255) tCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaagac > 1:567280‑M1/1‑30 (MQ=255) cACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcat < 2:69736‑M1/143‑116 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatg > 1:234984‑M1/1‑27 (MQ=255) aCTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatg < 2:835628‑M1/143‑117 (MQ=255) cTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatgg < 1:1020237‑M1/143‑118 (MQ=255) gcgtttggtAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcggaaaagatagacatgcttggccgatctctatttgatggaattgaaagatgtttgttaaggcatggat < 2:1189814‑M1/140‑120 (MQ=255) gCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggat < 1:905768‑M1/143‑120 (MQ=255) accaaaggcagtggaaagcg‑ctaaataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggat < 1:184496‑M1/131‑120 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaacagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatg > 2:577682‑M1/1‑23 (MQ=255) ccTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaacgatgtttgttaaggcatggctg > 1:1121654‑M1/1‑23 (MQ=255) ggTAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagc < 2:740660‑M1/143‑126 (MQ=255) tAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagcta > 2:589625‑M1/1‑16 (MQ=255) tAGAGGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagacaatctgtatttgattgaattgagagatgtttgttaaggcatggatgagagcta > 1:1047843‑M1/1‑16 (MQ=255) agagGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctat < 2:805472‑M1/143‑129 (MQ=255) gagGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctata > 1:848225‑M1/1‑14 (MQ=255) agGAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatag > 1:1112254‑M1/1‑13 (MQ=255) gAAAGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagat > 2:793927‑M1/1‑11 (MQ=255) aaaGTG‑CTAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagatt > 2:190868‑M1/1‑10 (MQ=255) ggccaaagaataatcaattgttaaattattctgcacttcactactggaactttaatccgagaagttggacctgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctga < 1:442141‑M1/139‑138 (MQ=255) tAAataataatcaattgttaaattattgtgcatttcactactggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgatac > 2:115368‑M1/1‑3 (MQ=255) aaataataatggattgttaaagtatggtggatttgactagtggaactgtaatcagaaaagatagacatgcttagccaatctctatttgattgaattgaaagatgtttgttaaggcatggatgcaagctatagattctgatacg < 1:970216‑M1/143‑142 (MQ=255) | AAATTACAGTTAGTTATAAGGATTTCCTTAACTGCTTCTCCTCACCATCATGTTATTTTCGCCACATCATAATCCTGGGCTTGCTGAAGAATAATTGAAATGATATTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTG‑CTAAGGAAGGTGCGAACAAGTCCCTGATATGAGATCATGTTTGTCATCTGGAGCCATAGAACAGGGTTCATCATGAGTCATCAACTTACCTTCGCCGACAGTGAATTCAGCAGTAAGCGCCGTCAGACCAGAAAAGAGATTTTCT > NC_000913/1299356‑1299639 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |