| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 4,049,990 | Δ12 bp | noncoding (93‑104/109 nt) | spf → | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 4049990 | 4050001 | 12 | 60 [0] | [0] 60 | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4049989 | 0 (0.000) | 58 (0.810) | 45/282 | 0.6 | 100% | noncoding (92/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| ? | NC_000913 | 4050002 = | NA (NA) | noncoding (105/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent | |||||
CTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTC > NC_000913/4049861‑4050143 | ttacaaaaagtgctttctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaattt > 1:325467‑M2/142‑143 (MQ=255) tacaaaaagtgctttctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggattttgctgaatattttagcctccccagtccataatttt > 2:433991‑M2/141‑143 (MQ=255) caaaaagtgctttctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagacctattacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTa > 2:1242654‑M2/139‑143 (MQ=255) aaaaagtgctttctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgcccccgtcagtaatTTTTAt > 1:397078‑M2/138‑143 (MQ=255) aaaaagtacttgctcaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcatagagtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttgtctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTAt < 1:33708‑M2/6‑1 (MQ=255) aaaagtgctttctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTAtt < 2:826152‑M2/7‑1 (MQ=255) aaaagtgctttctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttaacgtaatcggatttggctgaatattttagccgcaccagtgagtaatttgtcat > 1:995939‑M2/137‑138 (MQ=255) aagtgctttctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTgg < 2:837794‑M2/9‑1 (MQ=255) tctgaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcaggaatTTTTATTGGGcgaaagg > 2:323614‑M2/127‑142 (MQ=255) gaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagttggtctatctttcggatgtgttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGaaagaaaa < 2:464569‑M2/20‑1 (MQ=255) gaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGaaagaaaa < 2:313627‑M2/20‑1 (MQ=255) gaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggcagaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGaaagaaaa < 2:49984‑M2/20‑1 (MQ=255) gaactgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaaaagtttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGaaagaaaa < 2:1183384‑M2/20‑1 (MQ=255) tgaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGCAAAGATc > 2:84505‑M2/120‑143 (MQ=255) gaacaaaaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagaggttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATcc < 2:467262‑M2/25‑1 (MQ=255) aacaaagagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatatttcagaccttttacttcaggtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTCTTGGGCGGAAGAAAAGATCCGTaa > 2:495673‑M2/115‑143 (MQ=255) aaaaaagagtaaagttaggcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTaa < 2:602276‑M2/29‑1 (MQ=255) gagtaaagttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTg < 1:919402‑M2/35‑1 (MQ=255) atgtagtcgcttagtgtacagaggtacgatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATgcgc < 1:854030‑M2/41‑1 (MQ=255) agttagtcgcgtagggtacagaggtaagatgttttatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATgcgc < 1:1187214‑M2/41‑1 (MQ=255) tcgcgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTCTTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTatgct > 1:28985‑M2/97‑141 (MQ=255) tcgcgtaggggacagaggtaagatgttctatctatcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGtt < 2:993731‑M2/47‑1 (MQ=255) cgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAACGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTAt > 2:150904‑M2/94‑143 (MQ=255) cgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTAt < 1:693858‑M2/50‑1 (MQ=255) cgtagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTCTAt > 1:916513‑M2/94‑143 (MQ=255) tagggtacagaggtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGGGAAAGATAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCa < 2:530683‑M2/52‑1 (MQ=255) ggtacagaggtaagatgttgtatctttcagaccttctacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGCAAAGTTTCGCAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGc < 1:92162‑M2/55‑1 (MQ=255) gaggtaagaggttctatctttcagacctttcacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACgg < 1:693868‑M2/61‑1 (MQ=255) gtaagatgttctatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAACGAAAAGATCCGTAATACCTGATACGCTATGTTGATCAGTCCAACGGtac > 1:255475‑M2/80‑142 (MQ=255) tatctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCt > 1:1947‑M2/69‑143 (MQ=255) ctttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTAtt < 2:644199‑M2/78‑1 (MQ=255) ttcagaccttttacttcacgtaatcggatttggctgagtattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGa > 2:1048926‑M2/64‑143 (MQ=255) accttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGCTGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAACTGTAATCTATTGAatttc > 1:911392‑M2/59‑142 (MQ=255) accttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCAAACGGTAAAATTGTAATCTCTTGAATTTa > 1:669048‑M2/59‑143 (MQ=255) ttttacttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATTCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATGGAATTTCCgg > 1:681524‑M2/56‑143 (MQ=255) cttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCgg < 2:834102‑M2/93‑1 (MQ=255) ttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGa > 2:663993‑M2/50‑143 (MQ=255) ttcacgtaatcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGa > 2:439078‑M2/50‑143 (MQ=255) taagcggatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGcc < 2:660328‑M2/100‑1 (MQ=255) tatttggctgtatattttagacgccccagtcagtaatTTATAGTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATcc < 2:1048994‑M2/106‑1 (MQ=255) gatttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTAGCAGGCCAACGGTAGAATTGTAGTCTAGTGAATTTACGTGCCGGATACGCGAcattc > 2:1222345‑M2/38‑141 (MQ=255) ttggctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGc < 1:972858‑M2/109‑1 (MQ=255) ttgaatattttagccgctccagtcaggaatTTATATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACaa < 2:270057‑M2/113‑1 (MQ=255) ctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACaa > 2:434692‑M2/31‑143 (MQ=255) ctgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACaa < 2:325467‑M2/113‑1 (MQ=255) atgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACaa > 1:217895‑M2/31‑143 (MQ=255) tgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAg > 1:1045121‑M2/30‑143 (MQ=255) tgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATAAGGTCATCCTCATTATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCAAAAg > 2:284647‑M2/30‑143 (MQ=255) tgaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAAATCCATAGTGCCTGCTGCGCTCCGCTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGACTTTACGGGCCGGATACGCCACATCcggcacccg > 2:409065‑M2/30‑140 (MQ=255) gaatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACCAGc > 1:173179‑M2/29‑143 (MQ=255) aatattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCa > 1:214643‑M2/28‑143 (MQ=255) atattttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCAt < 1:900126‑M2/117‑1 (MQ=255) ttttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTaa < 2:770536‑M2/120‑1 (MQ=255) ttttagccgccccagtcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTaa < 2:418608‑M2/120‑1 (MQ=255) ggcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAattat < 2:198729‑M2/134‑1 (MQ=255) tcagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTCCGGGCCGCATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAattatt > 1:936292‑M2/9‑143 (MQ=255) cagtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTc < 1:1048926‑M2/136‑1 (MQ=255) agtaatTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGTTCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATAATTCg > 1:747629‑M2/7‑143 (MQ=255) tTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCGCCATCCGGCACATGCAGTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTc > 1:163047‑M2/2‑143 (MQ=255) tTTTTAGTGGGCGAAAGAAAAGATCCTTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAAGTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTc < 2:397078‑M2/142‑1 (MQ=255) | CTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATGCGCTATGTTTATCAGGCCAACGGTAGAATTGTAATCTATTGAATTTACGGGCCGGATACGCCACATCCGGCACAAGCATTAAGGCAAGAAAATTATTCGCCGTC > NC_000913/4049861‑4050143 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |