| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 3 (0.040) | 49 (0.730) | 36/278 | 1.0 | 94.3% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458787‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTC > NC_000913/608011‑608135 GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 1:1149467/143‑1GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCC < 2:789992/143‑1 CAAGACGGGGATTGCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC < 2:50142/143‑1 TTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAAC > 1:877287/1‑143 AATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC < 2:883406/128‑1 AATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC > 1:883406/1‑128 TGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGGTGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAG > 1:640662/1‑143 GCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTGAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:202981/143‑1 TTCACAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTT < 1:78210/143‑1 CAGAACGCTCAGGAGTCAGAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 1:1090692/143‑1 cgaaccgTCAGTATTCATAGATCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACTCCATCTATTAACATTTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAATGGTTGTG < 1:367736/136‑1 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTATGTCAGTATATGGGGAGGTTTTCCCATAAGCTCTATCTTGAGGCGTGTTGTATTtg > 1:337204/1‑141 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC > 1:966383/1‑143 TCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAAGGTTGTGTTGTTAC > 2:1017489/1‑143 GGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTCACATGTACGTCAGTATATGGGGAGGTTTCGCCATACGCGCAAGCTTACGGGATGCGGTATTCCGCC > 1:474121/1‑143 ATTCAGAGAGCTCTCACTTAGTTTAATTTCCGCCGGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG < 1:448791/143‑1 cTAGAGCTTGCTCTTAGTGTAATTTCCGCCAGTGAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCAGCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGTGTTGTGGTATTACGCCTGATAT < 2:1034990/142‑1 ATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATAT > 1:221534/1‑143 AGCTCTCTCTTAGGTTAATTTCCCCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATT < 2:363051/143‑1 gCTCTCTTAGGTTACTGTCCGCCAGGCAATCAGTGGGCACGACTCTGCTCCACGCCATCTATTGACATGTCCGTCCGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 1:294140/142‑1 TCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATAAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCGCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGCGGTATTACACCTGATATAGTTTAAgc > 2:1047826/1‑141 AATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATCTGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACCTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGCAT > 2:533837/1‑143 TTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGAAGTTTCCCCATGAGCGCTAACTTAAGGGGTGTGGTGATACCCCTGATACGAATAAAAGTGCCaagtaatga > 2:291586/1‑134 TTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGAGGCTGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGTGATTAGACAGGATAGGATTAAACATGCCGATGgaaga > 2:315676/1‑138 CAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGGTGTTTCCCCATAAGCGCTAACGTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGACGATGAACTGCTCTCAC > 2:557619/1‑143 CAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCAC < 1:616018/143‑1 AGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACG > 1:941777/1‑143 GATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGT > 1:1152273/1‑143 ACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCCCGATAACTGGTCAGCAA > 2:505321/1‑143 ACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGCGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAA > 2:1072824/1‑143 TGTGCTTCATGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTG > 2:222657/1‑143 TGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGCTGAATTACTCTCACGATAACTGGTCCGCAATTCTG > 1:1035552/1‑143 GTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGG > 1:509955/1‑143 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTGCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:163204/143‑1 TGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGGCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:665264/143‑1 GCTTCCCGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC < 2:641826/143‑1 GCTTCACGCCGTCTATTAACAGGTACGTCAGTATATGGGTATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCC < 1:907936/143‑1 TTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGCGGTATTACGCCTGATATGATTCAACGTCCCGATGAATTCCTCTCCCGGTACCCGGTCAGacatcctccccca > 2:234353/1‑130 ACGCCATCTATTAACATGTACGGCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAGAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATAT < 1:777895/143‑1 CGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATT > 1:596105/1‑143 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATACGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAGTACTCCCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGACCCACATTGG > 2:385864/1‑143 CCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATACTGG > 2:840834/1‑143 atctgtcgtCATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTA < 2:182535/134‑1 ATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTGCCCATAAGCGCTAACTTAGGGGTTGTGGTATTACGCCTTATATGATTTAACGTCCCGATTAATTGCTCTCACGAAAACTGGACAGCAATTCTGGCCCAcgtcggta > 2:21637/1‑135 ATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCCGATCTGCATTTACATGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCCGCAATTCTGGCCCATATCGGTACGCC > 2:1039345/1‑143 ATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCAGGCCAATATTctgaagcc > 2:407833/1‑135 TTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCACTTCTGGCCCATATTGGTAAGCCC > 1:421163/1‑143 TTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCC > 2:558733/1‑143 ACATGTACGTCAGTATATGGGGGTGTTTCCCCATAAGCCCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 1:931717/143‑1 ACATGTACGTCAGTATATGGGGCTGTTTCCCCATAAGCGCTCACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCTGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGGCCATATTTGTATGCGCGAA > 2:395684/1‑143 ACATGTACGGCAGTATGTGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTACCGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAA < 2:625136/143‑1 ATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGGAGA > 1:1026242/1‑143 TATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATCTGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTAGTACGCCCGAAGAACTGGctcctc > 2:631698/1‑137 ggcgcggggagtgcCCCGATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTACCGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTC < 1:632974/129‑1 GCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/458930‑458787‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTC > NC_000913/608011‑608135 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |