| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458787 = | 3 (0.040) | 49 (0.730) | 36/278 | 1.0 | 94.3% | intergenic (+87/‑101) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608011 = | NA (NA) | intergenic (+23/‑54) | hokE/insL1 | toxic polypeptide, small/IS186 transposase | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTG > NC_000913/458645‑458929 | gCAGACTGTTTCTGTTGTATGGCCACCCGGAAGCGTCGCAGGCATCTGGGGAATAGTGCACCATTCCCATACAATTAGTTACCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTGTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTTAATGTgg < 2:865835/143‑1 (MQ=255) cAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTggg > 1:1049367/1‑143 (MQ=255) gCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATC > 2:352168‑M1/1‑143 (MQ=255) gCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATC < 2:1132416‑M1/143‑1 (MQ=255) acttatGGCAAGTCGCAAGATGAACAGGGAGATGGTGAATAATTAACCACTCGCGTACACTTGGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCat < 2:4969‑M1/141‑3 (MQ=255) aTTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCat > 1:1069268‑M1/1‑141 (MQ=255) ttgcggggagggggaagcgcaacaggCATCTGGTGAATCATTAGCCGTTCCCATACAATGAGTTAACCAAACATGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataa < 2:851183‑M1/131‑5 (MQ=255) gaggagccagttcttcgggcgtactaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcagatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCAtata > 2:631698‑M1/125‑143 (MQ=255) cAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTGGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgcta > 1:559458‑M1/1‑133 (MQ=255) cAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgcta > 2:477577‑M1/1‑133 (MQ=255) ccGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTGCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACCTCCCatcagcgctaactt > 1:457462‑M1/1‑129 (MQ=255) cGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaactta > 2:135161‑M1/1‑128 (MQ=255) ggAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAGTTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTGATCTCCCCTTTAATGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaa < 1:467235‑M1/143‑17 (MQ=255) tctccgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACAt > 1:1026242‑M1/114‑143 (MQ=255) caagCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaag < 1:598634‑M1/142‑18 (MQ=255) aaGCGCAACAGGAATCTAGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagg < 1:60803‑M1/143‑19 (MQ=255) ttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagggcttatGGGGAAACACCCCCATATACTGACGTACATGt < 1:931717‑M1/32‑1 (MQ=255) ttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacggtaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCACATACTGCCGTACATGt < 2:625136‑M1/32‑1 (MQ=255) ttcgcgcatacaaatatggcccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcagcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagtgagcgcttatGGGGAAACAGCCCCATATACTGACGTACATGt > 2:395684‑M1/112‑143 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 2:558733‑M1/109‑143 (MQ=255) gggcttaccaatatgggccagaagtgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTaa > 1:421163‑M1/109‑143 (MQ=255) gcAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttcagggtgg > 1:998755‑M1/1‑121 (MQ=255) gcAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGAGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCACataagcgctaacttaagggttg > 2:330690‑M1/1‑121 (MQ=255) ggcgtaccgatatgggccagaattgcggaccagttatcgtgagagtaattcatcggcatgtaaatgcagatcgggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt > 2:1039345‑M1/108‑143 (MQ=255) aaCAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaa < 1:788462‑M1/143‑25 (MQ=255) taccgacgtgggccagaattgctgtccagttttcgtgagagcaattaatcgggacgttaaatcatataaggcgtaataccacaacccctaagttagcgcttatGGGCAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGAt > 2:21637‑M1/104‑143 (MQ=255) taccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTgacgtacatgacgacagat < 2:182535‑M1/40‑10 (MQ=255) aGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGTGGAAACATCCCatacgcgctaacttaagggttgaacca > 2:652267‑M1/1‑116 (MQ=255) aGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaacca > 2:1097913‑M1/1‑116 (MQ=255) ggCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGTGGATTTTATCTTCCCTTTAATTATTCCACTAATCCCCGCGGTGAAATTTGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccat < 1:910288‑M1/143‑29 (MQ=255) gCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatc < 1:203286‑M1/143‑30 (MQ=255) ccaatgtgggtcagaattgctgaccagttatcgtgggagtacttcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcgtatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATgg > 2:385864‑M1/102‑143 (MQ=255) cATCTGTTGAATAATTAACCATTCCTATACTTTTAGTTAACCAAAATGGGGTGATTTTATCTCCTCTTTTATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAGCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatct < 1:113140‑M1/143‑31 (MQ=255) aatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCg > 1:596105‑M1/100‑143 (MQ=255) atatgggccagaattgctgaccagttctcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGCCGTACATGTTAATAGATGGCGt < 1:777895‑M1/45‑1 (MQ=255) cTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa < 1:49037‑M1/143‑34 (MQ=255) tGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTTCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCAActaagcgctaacttaaggggtaaaccaacggaag > 1:102892‑M1/1‑109 (MQ=255) tgggggaggatgtctgaccgggtaccgggagaggaattcatcgggacgttgaatcatatcaggcgtaataccgcaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGaa > 2:234353‑M1/96‑143 (MQ=255) ggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATACCCATATACTGACGTACCTGTTAATAGACGGCGTGAAGc < 1:907936‑M1/50‑1 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGCCGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGca < 2:665264‑M1/51‑1 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGCAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGca < 1:163204‑M1/51‑1 (MQ=255) gAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGAATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATTCCataagcaccaacataaacagtggaccatctgaagcatg > 2:468505‑M1/1‑105 (MQ=255) ccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGcac > 1:509955‑M1/92‑143 (MQ=255) catgagtaaccttTCCCATTCAATAAGTTAAGCAAATAGGGGGTATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTTTTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc < 2:275862‑M1/137‑40 (MQ=255) aataatTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc > 1:1117577‑M1/1‑104 (MQ=255) ataatTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTACTGTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcg < 1:1068372‑M1/143‑41 (MQ=255) ttAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgacgaatgcgacgc > 2:817244‑M1/1‑99 (MQ=255) ttgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccgcaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgt > 2:1072824‑M1/86‑143 (MQ=255) ttgctgaccagttatcgggagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCgt > 2:505321‑M1/86‑143 (MQ=255) aaCCATTCCCATGCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcct > 2:1175825‑M1/1‑97 (MQ=255) cATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgacgaatgcgacgcctcgg > 1:743546‑M1/1‑94 (MQ=255) atccccataCAATCAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCGCCCCTTTAATTTTTCCTCTCTTCTCGGCGTTGAATTTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggt < 1:261961‑M1/140‑51 (MQ=255) cATGCACTTGGTTACCCAAAGTGGGGGGATTTTCTCTCCCCTTTAATTGTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagattgcgacgcctcggtgcctc < 2:559458‑M1/143‑56 (MQ=255) tagaattaGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTGTTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgt < 1:872389‑M1/140‑58 (MQ=255) cAATTAGTTAACCAAACAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtta < 1:294563‑M1/143‑60 (MQ=255) cAATAAGTTAACCAAAAAAGGGGGATTTTATCTCCCCTATAATTTTTCCTCTATTCGCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgtta < 1:1144088‑M1/143‑60 (MQ=255) cgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCt > 1:941777‑M1/71‑143 (MQ=255) gtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTg < 1:616018‑M1/74‑1 (MQ=255) gtgagagcagttcatcgtcacgttaaatcatatcaggcgtaataccccaacccttacgttagcgcttatGGGGAAACACCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTg > 2:557619‑M1/70‑143 (MQ=255) tcttccatcggcatgtttaatcctatcctgtctaatcacacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACAGCCTCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGaaa > 2:315676‑M1/63‑143 (MQ=255) aaCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacctaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtccttcgctaagacgatgc > 2:242835‑M1/1‑75 (MQ=255) aCCAACAAGGGGGGATTTTCTCTCCCCTTTAACTTTTCCTCTTTTGTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcc < 2:37187‑M1/143‑70 (MQ=255) cAAAAATGGGTGATTTTATCCCCCCTTTAATTTCTCCTCTATTCTCGTCGTTGAATGTCGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc < 1:464645‑M1/143‑72 (MQ=255) cAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctc > 1:67891‑M1/1‑72 (MQ=255) ttttATCTCCCCTGTAATTTTTCCTCTAGTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaatt < 1:986381‑M1/143‑85 (MQ=255) ttttATCGCACCTTTAATTTTTCCTATATTCTCGGCGTTGAATGTGGGTGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaatt < 2:233975‑M1/143‑85 (MQ=255) tttATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgccccgcgctcttcaatca > 2:1023986‑M1/1‑58 (MQ=255) aatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGGGGAAATTAACCTAAGAGAGAGct < 2:363051‑M1/99‑1 (MQ=255) tATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgctaagacgatgcctcgcgttcttcacttgcg > 2:60964‑M1/1‑56 (MQ=255) tcgcccctttAATTTTTCCTGTAATCGCGGCGTTGAAGGGGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgtt < 2:514986‑M1/140‑90 (MQ=255) atatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTAt > 1:221534‑M1/41‑143 (MQ=255) atatcaggcgtaataccacaacacttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGCTGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTCACTGGCGGAAATTACACTAAGAGCAAGCTCtag < 2:1034990‑M1/103‑2 (MQ=255) ccccTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttg > 1:242897‑M1/1‑51 (MQ=255) ccTTTAATCTTTCCTCTAGTCGCGGCGTTGAATGTGGCGGAAACATTCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgta < 2:1069268‑M1/143‑95 (MQ=255) caggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCCGGCGGAAATTAAACTAAGTGAGAGCTCTCTGAAt < 1:448791‑M1/107‑1 (MQ=255) cTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcatcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgtctttcagttgcgttttgtat > 1:34293‑M1/1‑48 (MQ=255) tttAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtagg > 2:287506‑M1/1‑47 (MQ=255) tctaaTTGTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagcatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtagg < 1:481687‑M1/141‑97 (MQ=255) ggcggaataccgcatcccgtaagcttgcgcgtatGGCGAAACCTCCCCATATACTGACGTACATGTGAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATcc > 1:474121‑M1/35‑143 (MQ=255) gtaacaacacaacctttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa > 2:1017489‑M1/32‑143 (MQ=255) caaatacaacacgcctcaagatagagcttatGGGAAAACCTCCCCATATACTGACATACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGa > 1:337204‑M1/32‑143 (MQ=255) gtttcCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtca < 1:363214‑M1/142‑103 (MQ=255) tttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcag < 2:522828‑M1/143‑104 (MQ=255) gttcCTCTATTGTCGGCGTTGGATGTGGGGGAAACAGCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcag < 2:1164051‑M1/142‑104 (MQ=255) ttCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagg < 1:477577‑M1/143‑105 (MQ=255) cacaaccattaagttagcgcttatGGGGAAACATACCCATATACTGACGTAAATGTTAATAGATGGAGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGATCTATGaatactgacggttcg < 1:367736‑M1/119‑8 (MQ=255) ctctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacagattagataggcgtgaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcggtttgtagactgtcaggggt > 1:552541‑M1/1‑36 (MQ=255) tctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgatgaatgcgcagggtccgtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatc > 1:273289‑M1/1‑35 (MQ=255) tctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata > 1:205771‑M1/1‑35 (MQ=255) tctATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata > 1:166919‑M1/1‑35 (MQ=255) tctATGCTCGGCGTTGAATGTGTGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcggcgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggata < 1:525631‑M1/143‑109 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTGTGaa < 1:78210‑M1/122‑1 (MQ=255) ttCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgctcttcaattgcgttttgtcggctgtcacggatactgt > 2:26335‑M1/1‑31 (MQ=255) tctcGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtc > 1:1003145‑M1/1‑30 (MQ=255) cttaagttagcgcttatGGGGAAACACCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCa > 1:640662‑M1/18‑143 (MQ=255) ctcGGCGTTTAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcc < 1:697088‑M1/143‑115 (MQ=255) gttagcgcttatGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGaa > 1:877287‑M1/13‑143 (MQ=255) cGTGGAATGTGGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacga > 1:1014523‑M1/1‑24 (MQ=255) gtgGGGGAAACATCCCataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtaggctgtcagggatactgtcccacgaatggccac < 1:135161‑M1/143‑128 (MQ=255) GGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCAtt < 2:883406‑M1/128‑1 (MQ=255) | GCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTG > NC_000913/458645‑458929 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |