| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514275 = | NA (NA) | 65 (1.000) | 56/278 | 0.1 | 90.5% | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase |
| ? | NC_000913 | = 2536318 | 7 (0.110) | coding (487/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2514416‑2514275‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCAACTTT < NC_000913/2536318‑2536174 CCCCGGCATTACGGGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATG < 2:970477/143‑1 CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGG > 1:828868/1‑143 CCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACAAGTTATCGTGAGAGTAATTCCTCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACCACCCTTAAGTTATCGCTTATGGc > 2:1149678/1‑142 CGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGT > 2:517365/1‑143 GGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACAACAACCGTTAAGTTCGCGCGTATGGGgg > 2:440183/1‑141 ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCA < 1:170524/143‑1 ATTACGTGCCGAAGTATCCAGTCCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCA < 2:181580/143‑1 gTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATCTGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCAC < 1:550126/142‑1 CGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGCGAGTAATTCATCGCCACGTTAAATCATATCAGGCGCAATACCACAACCCCTAAGCTAGCGCTTACGGGTTTCCCCCc > 2:912946/1‑142 GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCCGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTCATACCCCAACCCTTACGTCAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC > 1:722054/1‑143 GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCTGACATAAGTCTATGAGTCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC > 1:1138141/1‑143 GTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC > 1:817694/1‑143 GTGCCGAAGTAGCCAGTTCTGCGGGCTTACCAAGATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCAC < 1:55587/143‑1 CCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGT > 1:921528/1‑143 GAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTA > 1:183700/1‑143 GAAGTATCCAGTTCTGCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTA < 1:792940/143‑1 AAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATCCCACAAACCCTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTAC < 1:272042/143‑1 AAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGGAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTAC > 2:51922/1‑143 CCAGTGCTTCGGGCTTACCGATATGGGCCAGAAGTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCATGTTAAATCACATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACC < 1:57245/143‑1 CAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATAGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCG > 1:654226/1‑143 TTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGT > 1:1081110/1‑143 cccGGCTCACCAATATGGGCCAGCATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATCTCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTT < 1:362741/140‑1 GGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATAT‑AGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGAT < 1:85124/143‑1 CCACTATGGGCCAGAGTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTT < 2:960193/143‑1 CAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTC > 1:887764/1‑143 AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTATCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCCGACAGTTTGATCAGGTCT > 2:1015068/1‑143 ATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACAGCTACGCAACCGGACAGTTTGATCAGTTCct > 2:726817/1‑141 tgTGGGCCAGGATTGGCGTCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTCATTCATAGCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTT < 2:689998/141‑1 TGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTACTACCACAACCCTTCAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTGCCGGCCAGTTTGATCCGTTCTTTGA > 1:623346/1‑143 GGCCCGACTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGTTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATT < 2:160992/143‑1 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTCAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTGCCGGCCAGTTTGATCAGCTCTTGTATTT > 1:1018504/1‑143 GCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGGTAAATCATATCAGGCGTAAGACCACAACCCTTAAGTTAGCGATTATGGGTTTCACCCAAGGTTACGCTGCCGGACAGTTTGATAAGTTCTTTGATTT > 1:1028795/1‑143 CTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTT > 2:561047/1‑143 GACCAGTTATCGAGAAAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGACGTGTGCTTTGATTTCGTACATGTggt > 2:654015/1‑140 ACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGGCCATGTTGGA > 1:770552/1‑143 CAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGA > 1:1074545/1‑143 CAGTTATCGGGGGAGTAATTCAGCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAAGACCACAACCCTTCAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGA < 2:74737/143‑1 AGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGA < 1:1076378/143‑1 AGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATTCACCCACGATTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGATGATAGCAAACGGAGT > 2:23393/1‑143 gtacgtcgTCGGCACGTTACATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTC < 2:633835/135‑1 atccaccgcCACGTTACACCACATCCGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGG < 1:562230/134‑1 ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGG < 1:561047/143‑1 ATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGG > 1:1051048/1‑143 TTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTTCGTGTTGAAGGTAACAACCGGAGTCAGGG > 1:6148/1‑143 CATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCGCGGTTACGCTACCGGACAGTTTGGTCAGTTCTTTGATTTCGTCAGTGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTA > 1:1007687/1‑143 ATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTCGGAGATAACAACCGGCGTCCGGGTtg > 1:872548/1‑141 ACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGG < 1:842686/143‑1 GTTAAATCATATCCGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCT < 1:154637/143‑1 GTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCT < 1:173933/143‑1 TTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTT > 1:888071/1‑143 TAAATCGTATCAGGCGTAATACCACAACTCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTGCTTTGATTTCGTCCATGTTGTAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTT < 2:819789/143‑1 TCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCT > 2:995393/1‑143 gTATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTC < 2:1138141/142‑1 ATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTC < 1:517365/143‑1 TATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGCGTCAGGGTAGACTTGGCTATATCTTCC > 2:799798/1‑143 ATCAGGCGTCATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCA < 2:776339/143‑1 ATCAGGCGTCACACCTCCACCCTTAAGTTACCGCTTATTGGTTTCCCCCACCGTTACGCTACCGCTCCGTTTGGTCAGTTCTTTGCTTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCA < 2:347570/143‑1 TCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAG > 1:847627/1‑143 GCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTC > 2:110861/1‑85 GCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTC < 1:110861/85‑1 AATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACAGTTACGCTACCGGAAAGTTTGATCAGTACTTTGATTTGGTGAATGTTGGAGATAACAACAGGAGTCAGGGTAGACTTGGCATTCTCTTCCAGAAGCGGga > 2:645921/1‑141 ATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAG > 1:450046/1‑143 tCACAACCCTTCAGTTTGCCGTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGTACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATC < 2:855996/142‑1 CACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCCGGGTCGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCA > 1:346967/1‑143 cacCCCGTAAGTTAGCGCTTCTGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGCGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAA < 1:904744/140‑1 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATACA > 1:988824/1‑143 CCTTAAGTTAGCGCTTATGGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCGTCCAGCAGCGGCAGACCAAATTCA > 2:736717/1‑143 TTATGGGCTTCACCCACGGTTACGCTACCGTACAGTTTGATCAGTTCTTTGATGTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCC < 2:854749/143‑1 TATGGGTTGCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCA < 1:827121/143‑1 GTTTCACCCGCGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCAACTTT < 2:976025/143‑1 CCCCGGCATTACGTGCCGAAGTATCCAGTTCTTCGGGCTTACCAATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2514416‑2514275‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGGTTTCACCCACGGTTACGCTACCGGACAGTTTGATCAGTTCTTTGATTTCGTCCATGTTGGAGATAACAACCGGAGTCAGGGTAGACTTGGCTTTCTCTTCCAGCAGCGGCAGATCAAATTCAATGACAGTATCGCCAACTTT < NC_000913/2536318‑2536174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |