| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514275 = | NA (NA) | 65 (1.000) | 56/278 | 0.1 | 90.5% | intergenic (+33/‑54) | nupC/insL1 | nucleoside (except guanosine) transporter/IS186 transposase |
| ? | NC_000913 | = 2536318 | 7 (0.110) | coding (487/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
TGGCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGC > NC_000913/2536179‑2536460 | tGGCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGCAACCCata < 1:827121‑M2/143‑4 (MQ=255)ggtggcgtttcgggggacggtatcccggactgccgacaaggcgcaatggaagaacgggaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattctgcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCgg < 2:388268‑M2/14‑1 (MQ=255) gtggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgagaaaacgccgtaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGt > 1:725521‑M2/129‑143 (MQ=255) ggCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGACATCAAAGAACTGATCAAACTGTACGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAGCCCataa < 2:854749‑M2/143‑5 (MQ=255) ggccattcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTa > 1:230995‑M2/127‑143 (MQ=255) attcgtgggacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCg > 1:1116022‑M2/123‑143 (MQ=255) gtgggacagtagccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgtggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATc < 1:656490‑M2/25‑1 (MQ=255) tGTATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagg > 1:988824‑M2/1‑125 (MQ=255) gacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaaga > 1:30815‑M2/115‑143 (MQ=255) gacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAAACCCGGTTATCCGCATCaaga > 1:490612‑M2/115‑143 (MQ=255) gacagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcctatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaaga > 1:1072027‑M2/115‑143 (MQ=255) acagtatccctgacagcctacaaaccgcacttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaagaa < 1:278373‑M2/30‑1 (MQ=255) acagtatccctgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCaagaa < 1:70195‑M2/30‑1 (MQ=255) tttGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACGCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCagaagcgctaacttacggggtg < 1:904744‑M2/143‑23 (MQ=255) cTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtat > 1:450046‑M2/1‑115 (MQ=255) tgacagcctacaacacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagagggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTg < 1:513463‑M2/40‑1 (MQ=255) tgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGACACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTg > 2:727316‑M2/104‑143 (MQ=255) tgacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcatgcttcagatggttcaacccttacgttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCACGAAGTAAGTCTTg > 2:519714‑M2/104‑143 (MQ=255) tcccgcTTCTGGAAGAGAATGCCAAGTCTACCCTGACTCCTGTTGTTATCTCCAACATTCACCAAATCAAAGTACTGATCAAACTTTCCGGTAGCGTAACTGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtatt > 2:645921‑M2/3‑114 (MQ=255) gacgccctacaaagcgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACGCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGc < 2:702014‑M2/41‑1 (MQ=255) gacagcctacaaaacgcacttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGc < 1:359225‑M2/41‑1 (MQ=255) gacagcctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGc > 1:178790‑M2/103‑143 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGt > 1:306780‑M2/97‑143 (MQ=255) ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgacgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGt > 1:600419‑M2/97‑143 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATAGGCATCAAGAAGTCATTCTTCCCGcagct > 2:921854‑M2/96‑141 (MQ=255) ctgGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctga > 1:847627‑M2/1‑106 (MQ=255) tgGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAAGCAAAGAACTGACCAAACGGAGCGGTAGCGTAACGGTGGGGGAAACCAataagcggtaacttaagggtggaggtgtgacgcctgat < 2:347570‑M2/143‑39 (MQ=255) ggAAGATATAGCCAAGTCTACCCTGACGCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAACCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgata > 2:799798‑M2/1‑104 (MQ=255) aaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGaaaa > 1:505971‑M2/92‑143 (MQ=255) aaGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaa > 1:888071‑M2/1‑96 (MQ=255) atagaagaacgcgaggcatcggcttaacgcggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaaccctcaagttagagcttatgGGGGGCAACCACGGTTATCCGCATCAGGGAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAGTGgcgc > 2:1101351‑M2/85‑143 (MQ=255) aGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaac < 1:173933‑M2/143‑49 (MQ=255) aGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgccggatatgatttaac < 1:154637‑M2/143‑49 (MQ=255) tcgcgcagcctcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaaccctcaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGgc < 2:791288‑M2/67‑1 (MQ=255) caaccCGGACGCCGGTTGTTATCTCCGACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgat > 1:872548‑M2/3‑87 (MQ=255) tACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACACTGACGAAATCAAAGAACTGACCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGCGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatg > 1:1007687‑M2/1‑86 (MQ=255) cccTGACTCCGGTTGTTACCTTCAACACGAACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaa > 1:6148‑M2/1‑84 (MQ=255) ccTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaat < 1:561047‑M2/143‑61 (MQ=255) ccTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgccggatgtggtgtaacgtggcggtggat < 1:562230‑M2/143‑61 (MQ=255) gcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTGTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCAttt < 2:146470‑M2/74‑1 (MQ=255) aCTCCGTTTGCTATCATCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAATCGTGGGTGAATCCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattact > 2:23393‑M2/1‑79 (MQ=255) tCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactct < 1:1076378‑M2/143‑67 (MQ=255) cgtcttaaggaggcaccgaggcgtcgcattcttgagatggttcaacccgtaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCAttttttt < 1:1113329‑M2/78‑1 (MQ=255) gtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTa < 2:1037199‑M2/79‑1 (MQ=255) acgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTc < 2:1075723‑M2/85‑1 (MQ=255) tctcCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactg > 1:1074545‑M2/1‑66 (MQ=255) tctcCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaactgaagggttgtggtcttacgcctgatatgatttaacgtgccgctgaattactcccccgataactg < 2:74737‑M2/143‑78 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAACAATGGCCCCCATCGGCGCCATTGTTTTCTGCTTCAGc > 2:270763‑M2/56‑143 (MQ=255) tcCAACATGGCCGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggt > 1:770552‑M2/1‑64 (MQ=255) gcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCa > 1:174581‑M2/54‑143 (MQ=255) cgcggcgcatgctgcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTACTTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGcggcgg < 2:51182‑M2/97‑1 (MQ=255) gAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgc > 2:110861‑M2/1‑52 (MQ=255) cgcattcttcagatggtgcaacccttaagttagcggctgtgCAGCGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCaaaa < 2:811651‑M2/102‑1 (MQ=255) aaaTCAAAGAACTTATCAAACTGTCCGGCAGCGTAACCTTGGGTGAAACCCataatcgctaacttaagggttgtggtcttacgcctgatatgatttaccgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggc > 1:1028795‑M2/1‑51 (MQ=255) aaaTACAAGAGCTGATCAAACTGGCCGGCAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctgacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggc > 1:1018504‑M2/1‑51 (MQ=255) aaTCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAAACGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaagtcgggcc < 2:160992‑M2/143‑94 (MQ=255) ttcttcagatggttcaacccttaaggtagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCaa < 2:306780‑M2/106‑1 (MQ=255) tCAAAGAACGGATCAAACTGGCCGGCAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaactgaagggttgtggtagtacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggccca > 1:623346‑M2/1‑48 (MQ=255) aaaGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgctatgaatgaacgtgccgatgaattactctcacgataactggacgccaatcctggcccaca < 2:689998‑M2/143‑98 (MQ=255) aggaaCTGATCAAACTGTCCGGTTGCGTAGCTGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatat > 2:726817‑M2/3‑45 (MQ=255) aGACCTGATCAAACTGTCGGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgataacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatatt > 2:1015068‑M2/1‑44 (MQ=255) gAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattg > 1:887764‑M2/1‑43 (MQ=255) cagatggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCCACACCACTTCAt > 2:394701‑M2/33‑143 (MQ=255) aaCTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaactctggcccatagtgg < 2:960193‑M2/143‑102 (MQ=255) gccggctcaacccgtgagctagcccttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCCTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCg < 1:166183‑M2/113‑1 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGctc > 2:716326‑M2/28‑143 (MQ=255) aTCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcc < 1:85124‑M2/143‑107 (MQ=255) tcaacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGAAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAACATCAATTcatcgccccca > 1:325154‑M2/25‑138 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCAtg > 2:537583‑M2/23‑143 (MQ=255) aaCTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgagatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaatgctggcccatattggtgagccggg < 1:362741‑M2/143‑111 (MQ=255) aCTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaa > 1:1081110‑M2/1‑32 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCCGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCAtgctgc < 1:624776‑M2/125‑1 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGATAAATGGCGCCCATCGACGCCCTTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCCGCAAATTCACTTCATGGTTCTGATacttct > 2:565‑M2/18‑143 (MQ=255) ttaagttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATgctgct > 1:553609‑M2/18‑143 (MQ=255) cGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCTataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactg > 1:654226‑M2/1‑26 (MQ=255) aagtgagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTgg < 2:616918‑M2/128‑1 (MQ=255) ggTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatgtgatttaacatgccgatgaattactctcacgataactggtcagcacttctggcccatatcggtaagcccgaagcactgg < 1:57245‑M2/143‑119 (MQ=255) ttagcgcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAAGCAAATCATCGCTCCCACGCTCCTGGgtg > 2:327222‑M2/13‑143 (MQ=255) ttagcgcttatgGGGTCAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGACAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGgtg < 2:650971‑M2/131‑1 (MQ=255) gTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttagggtttgtgggattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatactt < 1:272042‑M2/143‑125 (MQ=255) gTAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattccgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatactt > 2:51922‑M2/1‑19 (MQ=255) tAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgcagaactggatacttc < 1:792940‑M2/143‑126 (MQ=255) tAACCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttc > 1:183700‑M2/1‑18 (MQ=255) gcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGGATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATGGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAgcg < 2:826104‑M2/136‑1 (MQ=255) gcttatgGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAATTCATCCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCCGCGGCACAATCAATTCATCGCTACAatgccgctggccgcaccc > 2:1125719‑M2/8‑135 (MQ=255) aCCGTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcgg > 1:921528‑M2/1‑16 (MQ=255) gTGGGTGAAACCCataagcgctgacgtaagggttggggtatgacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattcgggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcac > 1:722054‑M2/1‑13 (MQ=255) gTGGGTGAAACCCataagcgctaacttaagactcatagacttatgtcagatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcac > 1:1138141‑M2/1‑13 (MQ=255) ggggggAAACCCgtaagcgctagcttaggggttgtggtattgcgcctgatatgatttaacgtggcgatgaattactcgcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacg > 2:912946‑M2/2‑12 (MQ=255) gTGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccagattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtac < 1:550126‑M2/143‑135 (MQ=255) gTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTc < 2:769659/143‑1 (MQ=255) tGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaaggactggatacttcggcacgtaat < 2:181580‑M2/143‑136 (MQ=255) tGAAACCCataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaat < 1:170524‑M2/143‑136 (MQ=255) cccccatacgcgcgaacttaacggttgttgtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgcc > 2:440183‑M2/3‑5 (MQ=255) aaCCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCAATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGt > 1:431461/1‑143 (MQ=255) gccataagcgataacttaagggtggtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgaggaattactctcacgataacttgtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccgg > 2:1149678‑M2/2‑3 (MQ=255) ccccGTTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTAc < 1:237869/143‑1 (MQ=255) cccataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcacgtaatgccgg > 1:828868‑M2/1‑3 (MQ=255) cccGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCGCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTCcg > 2:342124/1‑143 (MQ=255) cataagcgctaacttaagggttgtggtattacgcctgatatgatttaacgtgccgatgaattactctcacgataactggtcagcaattctggcccatattggtaagcccgaagaactggatacttcggcccgtaatgccgggg < 2:970477‑M2/143‑143 (MQ=255) | TGGCGATACTGTCATTGAATTTGATCTGCCGCTGCTGGAAGAGAAAGCCAAGTCTACCCTGACTCCGGTTGTTATCTCCAACATGGACGAAATCAAAGAACTGATCAAACTGTCCGGTAGCGTAACCGTGGGTGAAACCCCGGTTATCCGCATCAAGAAGTAATTCTTGCCGCAGTGAAAAATGGCGCCCATCGGCGCCATTTTTTTATGCTTCCGCCAGCGGCGGCAAAATCAATTCATCGCTCTCATGCTGCTGGGTGTAGCGCATCACTTCCAGTACGC > NC_000913/2536179‑2536460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |