| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3845530 = | 32 (0.590) | 45 (0.900) | 40/262 | 0.2 | 56.7% | coding (1568/1767 nt) | adeD | cryptic adenine deaminase |
| ? | NC_000913 | = 3992759 | 39 (0.780) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845388‑3845672 | cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTCCAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg > 2:121013/1‑143 (MQ=255) taataTTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATgcgcg > 2:486532/1‑142 (MQ=255) ctggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgggcttacctGCAcc < 2:419586‑M1/5‑1 (MQ=255) atatTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGGTGAGCAcc > 2:377397/1‑143 (MQ=255) tggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccacttcccgctgcgcttacgtGCACCg < 2:273610‑M1/6‑1 (MQ=255) atTGTGGTGGTCGGTCGCAGTGTCGGAGAGTTGTCTCTGGTGTTCAATCAGGTGTTTCAGGAGGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCACTGCCGGGCTGATGAGCACCGa < 2:882716/143‑1 (MQ=255) ggtggtgATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGGTGGCGCTGGCGGTCAGGCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGTGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTATCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGaca < 1:446365/142‑1 (MQ=255) ggcgtgggtgtggttttacggccggcgtgccgcgggcacccttttgtagattaaaggtaacggcagtggcgatttgcctaagttgcaggagatggccgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGacac > 1:923849‑M1/134‑143 (MQ=255) tggtgATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCGCCGACACg > 2:62414/1‑143 (MQ=255) tcgtgtgcattgtttaacggcctgcttatctcgcgtacccgtttgtatataaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACg > 2:310918‑M1/133‑143 (MQ=255) gtgATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGAGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAACTCATCTGCCGTTACCCAGTGCCGGGCTGATGAGCACCGCCACGgc > 2:382799/1‑143 (MQ=255) gggagcGGTCGGAGTGCCGAGGAGAGGGCGCGGGCGGGCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGgc < 2:766731/138‑1 (MQ=255) atggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacccGCACCGccccggcgggtcc < 1:325086‑M1/19‑6 (MQ=255) tttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtgtgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTg > 1:557679‑M1/121‑143 (MQ=255) ttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTgg > 2:156982‑M1/120‑143 (MQ=255) ttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctacgcttacctGCaccgacccggcgccggccctgg < 1:119872‑M1/24‑10 (MQ=255) taacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcgtaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcggaccatttcccgctgggcttgcgtGCACCGACCAGGCGCGGGCGCCGGc < 1:451608‑M1/25‑1 (MQ=255) gTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCCGTCGCTGGCg > 2:704556/1‑143 (MQ=255) aacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCg < 1:582587‑M1/26‑1 (MQ=255) acggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccctttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCgg < 2:192468‑M1/27‑1 (MQ=255) acggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGCCGCAGTCGCTGGCgg < 1:166992‑M1/27‑1 (MQ=255) cGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAAc < 2:618338/143‑1 (MQ=255) ccgacctcgcgcacccgtttgtatatcaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAAtt > 2:329252‑M1/109‑143 (MQ=255) gcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgctttagtttcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCtt > 1:421519‑M1/101‑143 (MQ=255) cacctgtttgtatattaaaggtagcggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGaa > 2:719705‑M1/98‑143 (MQ=255) gtgTCACTCAGGGGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGGGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCAGTTGCGGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGaaa < 1:311988/141‑1 (MQ=255) ccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAagg < 2:274395‑M1/49‑2 (MQ=255) ccgtctgtatattaagggtaacggcattgtcgattggcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgc > 2:163762‑M1/95‑143 (MQ=255) tCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCCTCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAACTGACGCCTTGAAAgcc > 1:437629/1‑143 (MQ=255) gtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAGCAAATTGACGCCTTGAAAgccg < 2:301209‑M1/51‑1 (MQ=255) tttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgccgc < 2:430203‑M1/52‑1 (MQ=255) tttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgccgc > 1:23140‑M1/92‑143 (MQ=255) aaTCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgccgc > 2:630136/1‑143 (MQ=255) ttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgggtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAgccgcc < 2:920195‑M1/53‑1 (MQ=255) ggTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGCCGCCTTGCAAGCCGCCGccc > 1:268819/1‑143 (MQ=255) gTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCg > 2:465572/1‑143 (MQ=255) taacggcagtgtcgatttgcctaagttgcaggagatgggcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCgg > 1:585440‑M1/77‑143 (MQ=255) ggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCg > 1:192468‑M1/73‑143 (MQ=255) gtgtcgagcggcgtaggtggcaggggatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCACCGAGACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTAc > 2:137599‑M1/69‑143 (MQ=255) gggCTGTGCGTGGTACGGATCGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGCTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTAcc < 1:686342/143‑1 (MQ=255) cTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCgc > 2:733971/1‑142 (MQ=255) 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2:440343/1‑143 (MQ=255) aCGTACCGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCCTTCCCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTa < 2:927789/143‑1 (MQ=255) tAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTGTATTc > 1:839574/1‑143 (MQ=255) caggagctggtcgccgacgtgtcgcaccattccccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAg > 2:299249‑M1/49‑143 (MQ=255) ggagatgggcgccgacgtgtcgcaccatgtcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGAt > 2:455934‑M1/47‑143 (MQ=255) gatggtcgccgacgtggcgcaccagttcccgctgcgctgacctGCACCGACGCGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGGCGCCGTGAGAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGc > 1:175898‑M1/44‑143 (MQ=255) 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tGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAg > 2:6329‑M1/2‑143 (MQ=255) aGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACCCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGACCGTTACCCGATGAGCCGCTTATTCCGCTGGCGCGTCTCTCTCTGCCAGCCATCCCCGCGCCAACACTAACCac > 1:218119/1‑142 (MQ=255) GCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCGCCGCGCTGAAACTCACCAGt < 2:148648‑M1/143‑1 (MQ=255) GCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGAAGGCGGTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGt < 1:44900‑M1/143‑1 (MQ=255) | CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845388‑3845672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |