| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 143 [0] | [0] 141 | insH21 | insH21 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 111 (1.740) | 39/60 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
| ? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1299461‑1299498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA > NC_000913/1300698‑1300731 TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGC > 1:977819/1‑35TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGC > 1:2996552/1‑35TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGC > 1:5191388/1‑35TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGC > 1:1860914/1‑35TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGC < 1:1488852/35‑1 ATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTA < 1:4296836/35‑1 ATTAATTCCACTGCCTTTGGCAGAGGAAAGTGCTA > 1:2250346/1‑35 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA > 1:6275889/1‑35 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA > 1:4672079/1‑35 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:5104640/35‑1 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA > 1:6193355/1‑35 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA > 1:637001/1‑35 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA > 1:657425/1‑35 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA < 1:7049787/35‑1 TTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA > 1:7280714/1‑35 TAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAA < 1:7888374/35‑1 TAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAA < 1:604042/35‑1 AATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAAT < 1:3428911/35‑1 AATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAAT < 1:685220/35‑1 AATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAAT < 1:378960/35‑1 AATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAAT < 1:1256992/35‑1 AATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAAT < 1:7741748/35‑1 ATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATA > 1:6032874/1‑35 ATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATA > 1:3373891/1‑35 ATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATA > 1:4716370/1‑35 TTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAA < 1:5309748/35‑1 TTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAA < 1:1633105/35‑1 TCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAAT > 1:7885076/1‑35 TCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAAT < 1:5668965/35‑1 TCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAAT > 1:6536757/1‑35 CCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATA > 1:3567422/1‑35 CCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATA > 1:7123785/1‑35 CACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAA > 1:4767640/1‑35 CACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAA > 1:116808/1‑35 CACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAA < 1:2044069/35‑1 CACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAA > 1:2615440/1‑35 ACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAAT < 1:2552143/35‑1 ACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAAT < 1:7569466/35‑1 ACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAAT < 1:2186769/35‑1 CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATC > 1:7382970/1‑35 CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATC < 1:3196583/35‑1 CTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATC < 1:7819741/35‑1 CCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAAT < 1:2316572/35‑1 CCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAAT < 1:2729810/35‑1 CTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATT > 1:5127048/1‑35 TTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTG < 1:3929814/35‑1 TTTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTG > 1:7770222/1‑35 TTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGT < 1:2130727/35‑1 TTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGT < 1:849722/35‑1 TTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGT < 1:1996998/35‑1 TTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGT > 1:404970/1‑35 TTGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGT < 1:3678348/35‑1 TGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTT > 1:7114161/1‑35 TGGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTT < 1:2448927/35‑1 GGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTA > 1:3593438/1‑35 GGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTA > 1:2833824/1‑35 GGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTA > 1:725350/1‑35 GGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTA < 1:1981976/35‑1 GGTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTA < 1:5374150/35‑1 GTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAA < 1:1827564/35‑1 GTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAA > 1:6523006/1‑35 GTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAA > 1:5156130/1‑35 GTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAA < 1:1375633/35‑1 GTAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAA > 1:3638473/1‑35 TAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAA < 1:180562/35‑1 TAGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAA > 1:5956006/1‑35 AGAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAAT < 1:6696476/35‑1 GAGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATT < 1:6419353/35‑1 AGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTA < 1:3344005/35‑1 AGGAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTA < 1:4157092/35‑1 GAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATT > 1:4354530/1‑35 GAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATT < 1:6153361/35‑1 GAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATT < 1:3526997/35‑1 GAAAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATT > 1:3449325/1‑35 AAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGT > 1:1860284/1‑35 AAGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGT > 1:4859133/1‑35 AGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTG < 1:1719369/35‑1 AGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTG < 1:2224389/35‑1 AGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTG < 1:542593/35‑1 AGTGCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTG > 1:2695132/1‑35 GCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAT < 1:888505/35‑1 GCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAT < 1:4504677/35‑1 GCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAT < 1:476426/35‑1 CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATT > 1:6558147/1‑35 CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATT > 1:5414272/1‑35 CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATT < 1:1271544/35‑1 CTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATT > 1:7329570/1‑35 TAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTT < 1:2553131/35‑1 TAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTT < 1:2606624/35‑1 TAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTT > 1:596505/1‑35 TAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTT > 1:2324132/1‑35 TAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTT < 1:5244058/35‑1 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA > 1:7503245/1‑35 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA < 1:1505033/35‑1 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA > 1:4576543/1‑35 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA < 1:1669734/35‑1 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA > 1:4856388/1‑35 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA < 1:1349948/35‑1 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA > 1:282497/1‑35 AATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA < 1:114551/35‑1 TTATTAATTCCACTGCCTTTGGTAGAGGAAAGTGCTAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1299461‑1299498‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCA > NC_000913/1300698‑1300731 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |