Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
MC JC | NC_000913 | 1,299,499 | Δ1,199 bp | insH21 | insH21 |
Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | NC_000913 | 1299499 | 1300697 | 1199 | 143 [0] | [0] 141 | insH21 | insH21 |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1299498 | 0 (0.000) | 111 (1.740) | 39/60 | 0.0 | 100% | intergenic (+253/‑33) | ychE/insH21 | putative inner membrane protein/IS5 transposase and trans‑activator |
? | NC_000913 | 1300698 = | 0 (0.000) | intergenic (+151/‑484) | insH21/oppA | IS5 transposase and trans‑activator/oligopeptide ABC transporter periplasmic binding protein |
Only 100 of 141 total aligned reads displayed.
GAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCAC > NC_000913/1300664‑1300732 | taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:7888374‑M2/1‑1 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:4344014‑M2/1‑1 (MQ=255) taattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaa < 1:604042‑M2/1‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:378960‑M2/2‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:7741748‑M2/2‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:2212037‑M2/2‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:3428911‑M2/2‑1 (MQ=255) aattccactgcctttggtagaggaaagtgctaaat < 1:685220‑M2/2‑1 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata > 1:4716370‑M2/33‑35 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata > 1:3373891‑M2/33‑35 (MQ=255) attccactgcctttggtagaggaaagtgctaaata > 1:6032874‑M2/33‑35 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:5934902‑M2/32‑35 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:5386942‑M2/4‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:5309748‑M2/4‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa < 1:1633105‑M2/4‑1 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:2093832‑M2/32‑35 (MQ=255) ttccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataa > 1:2439545‑M2/32‑35 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat > 1:2599452‑M2/31‑35 (MQ=255) tccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataat > 1:4426957‑M2/31‑35 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata > 1:3567422‑M2/30‑35 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata > 1:7123785‑M2/30‑35 (MQ=255) ccactgcctttggtagaggaaagtgctaaataata > 1:1643046‑M2/30‑35 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:116808‑M2/29‑35 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:2615440‑M2/29‑35 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa > 1:4767640‑M2/29‑35 (MQ=255) cactgcctttggtagaggaaagtgctaaataataa < 1:185678‑M2/7‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat < 1:2552143‑M2/8‑1 (MQ=255) actgcctttggtagaggaaagtgctaaataataat > 1:7064411‑M2/28‑35 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:3196583‑M2/9‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:7819741‑M2/9‑1 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc > 1:7382970‑M2/27‑35 (MQ=255) ctgcctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATc < 1:2449914‑M2/9‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt < 1:2729810‑M2/12‑1 (MQ=255) cctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAt < 1:2316572‑M2/12‑1 (MQ=255) ctttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAAtt > 1:5127048‑M2/23‑35 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg > 1:7770222‑M2/22‑35 (MQ=255) tttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTg < 1:3929814‑M2/14‑1 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:2846435‑M2/21‑35 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt < 1:2130727‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:7298358‑M2/21‑35 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt < 1:1996998‑M2/15‑1 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt > 1:404970‑M2/21‑35 (MQ=255) ttggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGt < 1:3678348‑M2/15‑1 (MQ=255) tggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGtt > 1:7114161‑M2/20‑35 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa < 1:7398974‑M2/17‑1 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:3593438‑M2/19‑35 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:725350‑M2/19‑35 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:1748302‑M2/19‑35 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa < 1:1981976‑M2/17‑1 (MQ=255) ggtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTa > 1:2833824‑M2/19‑35 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:943224‑M2/18‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa > 1:6523006‑M2/18‑35 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:1375633‑M2/18‑1 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa > 1:3638473‑M2/18‑35 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa > 1:5156130‑M2/18‑35 (MQ=255) gtagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaa < 1:2002544‑M2/18‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:6591930‑M2/19‑1 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa > 1:5956006‑M2/17‑35 (MQ=255) tagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:180562‑M2/19‑1 (MQ=255) gagaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTaaa < 1:5303755‑M2/19‑1 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:7873782‑M2/20‑1 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:838313‑M2/20‑1 (MQ=255) agaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAat < 1:6696476‑M2/20‑1 (MQ=255) gaggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatt < 1:6419353‑M2/21‑1 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:3344005‑M2/22‑1 (MQ=255) aggaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAatta < 1:4157092‑M2/22‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:6153361‑M2/24‑1 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt > 1:3449325‑M2/12‑35 (MQ=255) gaaagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAattatt < 1:3526997‑M2/24‑1 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt > 1:4859133‑M2/10‑35 (MQ=255) aagtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgt > 1:1860284‑M2/10‑35 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:542593‑M2/27‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:1719369‑M2/27‑1 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg > 1:2695132‑M2/9‑35 (MQ=255) agtgctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATtgtg < 1:2224389‑M2/27‑1 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:6260131‑M2/30‑1 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:888505‑M2/30‑1 (MQ=255) gctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAt < 1:476426‑M2/30‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt < 1:1271544‑M2/31‑1 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt > 1:5414272‑M2/5‑35 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt > 1:6558147‑M2/5‑35 (MQ=255) ctaaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAtt > 1:5999157‑M2/5‑35 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:6443502‑M2/32‑1 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt > 1:2324132‑M2/4‑35 (MQ=255) taaATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCAttt < 1:2606624‑M2/32‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:7503245‑M2/2‑35 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:114551‑M2/34‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:4856388‑M2/2‑35 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:4579469‑M2/34‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:4576543‑M2/2‑35 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa > 1:282497‑M2/2‑35 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:1505033‑M2/34‑1 (MQ=255) aATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCa < 1:1349948‑M2/34‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:5137025/1‑35 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:7589545/1‑35 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:4409467/35‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:4290299/35‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac > 1:3263125/1‑35 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:1282762/35‑1 (MQ=255) ataataatCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCac < 1:113731/35‑1 (MQ=255) | GAAGAATTTCCCCGCTTATTCGCACCTTCCCTAAATAATAATCAATTGTTAAATTATTGTGCATTTCAC > NC_000913/1300664‑1300732 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |