New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1197136 | 0 (0.000) | 18 (0.340) +CAGATAATT |
9/50 | 1.8 | 49.5% | coding (397/666 nt) | ymfD | e14 prophage; putative SAM‑dependent methyltransferase |
? | NC_000913 | 3979137 = | 50 (0.690) | coding (537/1353 nt) | wzyE | enterobacterial common antigen polymerase |
CCTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATTTTGTCGATTGTATCCCGACAAGG > NC_000913/1197102‑1197160 | ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:369056‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:4909880‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:4909948‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:4976609‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:2738385‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:5809048‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:6264778‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:6421808‑M1/35‑1 (MQ=255) ccTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTAT < 1:691917‑M1/35‑1 (MQ=255) cTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATc < 1:932827‑M1/35‑2 (MQ=255) cTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATc < 1:2846687‑M1/35‑2 (MQ=255) cTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATc > 1:5206685‑M1/1‑34 (MQ=255) cTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATc < 1:7125779‑M1/35‑2 (MQ=255) tGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATca < 1:1552003‑M1/35‑3 (MQ=255) tGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATca < 1:7393997‑M1/35‑3 (MQ=255) tGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATca < 1:2958731‑M1/35‑3 (MQ=255) gATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcag < 1:2853909‑M1/35‑4 (MQ=255) gATTTTAGGAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcag < 1:785657‑M1/35‑4 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga > 1:6728421‑M1/1‑31 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga > 1:6054594‑M1/1‑31 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga > 1:7154966‑M1/1‑31 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga < 1:5789090‑M1/35‑5 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga < 1:1618695‑M1/35‑5 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga < 1:1448111‑M1/35‑5 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga > 1:7259323‑M1/1‑31 (MQ=255) aTTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcaga < 1:7315149‑M1/35‑5 (MQ=255) tttAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagata > 1:7163928‑M1/1‑29 (MQ=255) ttAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataa > 1:7089592‑M1/1‑28 (MQ=255) ttAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataa < 1:6731353‑M1/35‑8 (MQ=255) ttAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataa > 1:1091108‑M1/1‑28 (MQ=255) ttAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataa < 1:3186756‑M1/35‑8 (MQ=255) ttAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataa < 1:1305454‑M1/35‑8 (MQ=255) tAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataat < 1:6227422‑M1/35‑9 (MQ=255) tAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataat < 1:2755562‑M1/35‑9 (MQ=255) tAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataat > 1:464314‑M1/1‑27 (MQ=255) tAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataat < 1:1213969‑M1/35‑9 (MQ=255) aGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataatt > 1:4969068‑M1/1‑26 (MQ=255) aGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataatt < 1:6181067‑M1/35‑10 (MQ=255) aGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataatt > 1:1546776‑M1/1‑26 (MQ=255) gTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATccgataattc > 1:2561814‑M1/1‑25 (MQ=255) gTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattc < 1:153109‑M1/35‑11 (MQ=255) gTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattc > 1:4897917‑M1/1‑25 (MQ=255) gTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattc > 1:3160546‑M1/1‑25 (MQ=255) tAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattca > 1:5809882‑M1/1‑24 (MQ=255) tAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattca < 1:7038947‑M1/35‑12 (MQ=255) tAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattca > 1:7571108‑M1/1‑24 (MQ=255) tAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattca < 1:4580797‑M1/35‑12 (MQ=255) tAATCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattca > 1:6284201‑M1/1‑24 (MQ=255) aaTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaa > 1:2351520‑M1/1‑23 (MQ=255) aaTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaa > 1:1771959‑M1/1‑23 (MQ=255) gtctctTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaa > 1:1275416‑M1/2‑22 (MQ=255) aTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaa > 1:1466304‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaa > 1:2610237‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaa > 1:2832837‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaa > 1:1275368‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaa > 1:4636635‑M1/1‑22 (MQ=255) aTCTCTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaa < 1:4401343‑M1/35‑14 (MQ=255) tctcTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaag > 1:3422620‑M1/1‑21 (MQ=255) tctcTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaag > 1:6217493‑M1/1‑21 (MQ=255) tctcTTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaag < 1:3468191‑M1/35‑15 (MQ=255) tctTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcg < 1:153616‑M1/35‑17 (MQ=255) ctTGATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgt > 1:2125030‑M1/1‑18 (MQ=255) ttGATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtg > 1:3298595‑M1/1‑17 (MQ=255) ttGATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtg > 1:5188728‑M1/1‑17 (MQ=255) ttGATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtg > 1:4844387‑M1/1‑17 (MQ=255) gATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggc < 1:1060763‑M1/35‑21 (MQ=255) gATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggc > 1:6225558‑M1/1‑15 (MQ=255) gATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggc > 1:3214146‑M1/1‑15 (MQ=255) gATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggc < 1:407697‑M1/35‑21 (MQ=255) gATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggc > 1:4749639‑M1/1‑15 (MQ=255) gATGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggc > 1:6303147‑M1/1‑15 (MQ=255) aTGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggct > 1:1701366‑M1/1‑14 (MQ=255) aTGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggct > 1:2648770‑M1/1‑14 (MQ=255) aTGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggct > 1:2505700‑M1/1‑14 (MQ=255) tGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggctg < 1:4142612‑M1/35‑23 (MQ=255) tGCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggctg > 1:598199‑M1/1‑13 (MQ=255) gCTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggctgt < 1:3781179‑M1/35‑24 (MQ=255) cTAAGAACTATcagataattcaaagcgtggctgtg > 1:7039226‑M1/1‑11 (MQ=255) | CCTGATTTTAGTAATCTCTTGATGCTAAGAACTATTTTGTCGATTGTATCCCGACAAGG > NC_000913/1197102‑1197160 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |