| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 603,467 | Δ5,885 bp | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG], nfsB, ybdF, ybdJ, ybdK, sokE, hokE, insL‑2 | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 603467 | 609351 | 5885 | 64 [0] | [0] 66 | [ybdG]–insL‑2 | [ybdG],nfsB,ybdF,ybdJ,ybdK,sokE,hokE,insL‑2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 603466 | 0 (0.000) | 62 (0.910) | 31/64 | 0.1 | 100% | coding (1198/1248 nt) | ybdG | miniconductance mechanosensitive channel YbdG |
| ? | NC_000913 | 609352 = | 0 (0.000) | intergenic (+175/+107) | insL‑2/entD | IS186/IS421 transposase/phosphopantetheinyl transferase EntD | |||||
AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > NC_000913/609318‑609386 | ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag < 1:3550338‑M2/1‑1 (MQ=255)ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag < 1:7338784‑M2/1‑1 (MQ=255)ccgccagagagcgaatatcattgccggttggcgag < 1:6771544‑M2/1‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa < 1:4133623‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa < 1:3484205‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa < 1:7399506‑M2/4‑1 (MQ=255) ccagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTaa < 1:281570‑M2/4‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt < 1:784643‑M2/5‑1 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt > 1:2339813‑M2/31‑35 (MQ=255) cagagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAAt < 1:1659661‑M2/5‑1 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:5020668‑M2/7‑1 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc < 1:4211517‑M2/7‑1 (MQ=255) gagagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATcc > 1:5124139‑M2/29‑35 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc < 1:2778102‑M2/8‑1 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:5886730‑M2/28‑35 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc > 1:6373495‑M2/28‑35 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc < 1:7017969‑M2/8‑1 (MQ=255) agagcgaatatcattgccggttggcgaGTAATccc < 1:7432225‑M2/8‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg < 1:7402175‑M2/10‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg < 1:4995397‑M2/10‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg < 1:448289‑M2/10‑1 (MQ=255) agcgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCg > 1:4104136‑M2/26‑35 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa < 1:6039453‑M2/12‑1 (MQ=255) cgaatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCa > 1:7136659‑M2/24‑35 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:5329003‑M2/22‑35 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:4765518‑M2/22‑35 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:4765481‑M2/22‑35 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:1057980‑M2/22‑35 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata > 1:1035902‑M2/22‑35 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 1:4094687‑M2/14‑1 (MQ=255) aatatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCata < 1:4052082‑M2/14‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat < 1:1691354‑M2/15‑1 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat > 1:181249‑M2/21‑35 (MQ=255) atatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCatat > 1:3820237‑M2/21‑35 (MQ=255) tatcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATc > 1:7389666‑M2/20‑35 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:4556919‑M2/18‑35 (MQ=255) tcattgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCg > 1:136233‑M2/18‑35 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:4319541‑M2/16‑35 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:1158215‑M2/16‑35 (MQ=255) attgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGt > 1:2908609‑M2/16‑35 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:392080‑M2/15‑35 (MQ=255) ttgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGtt > 1:5366854‑M2/15‑35 (MQ=255) tgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg < 1:7896256‑M2/22‑1 (MQ=255) tgccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTg < 1:6095780‑M2/22‑1 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:4930884‑M2/13‑35 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt > 1:5636091‑M2/13‑35 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt < 1:4942331‑M2/23‑1 (MQ=255) gccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgt < 1:2490919‑M2/23‑1 (MQ=255) ccggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtc > 1:5484162‑M2/12‑35 (MQ=255) cggttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtca < 1:5418454‑M2/25‑1 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:2341117‑M2/9‑35 (MQ=255) gttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcagg > 1:6579088‑M2/9‑35 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:6899348‑M2/8‑35 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:496928‑M2/8‑35 (MQ=255) ttggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggt > 1:5422532‑M2/8‑35 (MQ=255) ggcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtca < 1:4874376‑M2/30‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag < 1:1788613‑M2/31‑1 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag > 1:1762279‑M2/5‑35 (MQ=255) gcgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTgtcaggtcag < 1:4433599‑M2/31‑1 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg > 1:2820534‑M2/4‑35 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg > 1:7083033‑M2/4‑35 (MQ=255) cgaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGtcaggtcagg > 1:2820496‑M2/4‑35 (MQ=255) gaGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGa < 1:1367221‑M2/33‑1 (MQ=255) aGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGAt > 1:4781125‑M2/2‑35 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 1:3119178/1‑35 (MQ=255) gTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATg > 1:4186741/1‑35 (MQ=255) | AGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGAGTAATCCCCGCATATCCGGTTGTCAGGTCAGGATG > NC_000913/609318‑609386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |